關於甲醛刺激和過敏反應幾乎沒有爭議，但關於甲醛作為致癌物的狀況的爭論仍在繼續——儘管似乎已經達成共識。關於甲醛與癌症之間可能關聯的特別重要的研究來自美國國家癌症研究所 (NCI) 進行的兩項研究。第一項（隊列）研究調查了 25,619 名工人的死亡情況，這些工人在 1966 年之前參與了涉及甲醛、甲醛樹脂或在模塑塑料和膠合板中使用甲醛的工藝製造。使用截至 1994 年的數據的第一份報告顯示，風險增加了工人死於白血病的風險。這種風險與暴露的峰值和平均水平以及持續時間增加有關，但與累積暴露無關。
根據另外 10 年的數據，2009 年發表的第二份報告繼續顯示暴露與癌症之間可能存在的關聯。它在很多方面都令人信服，但證據有點複雜。例如，一項針對紡織工人的英國隊列研究未能提供確鑿的證據證明甲醛暴露與白血病之間存在因果關係。但總體而言，在對各種研究的總結分析中，NCI 認為接觸甲醛會導致人類白血病，尤其是髓性白血病。
除了提出甲醛與白血病之間的聯繫外，NCI 的一項研究還表明與鼻咽癌有關，這是一種罕見的鼻癌。同樣，該協會同意了幾項類似的研究，但沒有其他研究發現這種聯繫。此外，大多數現代研究不支持先前提出的與肺癌的聯繫。甲醛行業反應
當然，對甲醛與癌症之間可能存在聯繫的擔憂促使甲醛行業保護其生產和使用。業界批評的主要對像是 NCI 報告，尤其是有關鼻咽癌發展的指控。這項研究的批評者聲稱癌症是由其他原因引起的。這是匹茲堡大學 2007 年一項研究支持的主張。業界質疑甲醛導致白血病的原因，稱其“生物學上令人難以置信”。他們指出，甲醛的反應性如此之大，以至於它只作用於它首先接觸的組織，它的快速新陳代謝阻礙了它在整個生物體中的分佈。對甲醛的主要反對意見是人類暴露於足夠濃度的排放物而構成風險的可能性。在 2007 年甲醛科學國際會議上，該會議由歐洲甲醛工業協會舉辦，並確定在消費品和其他應用中普遍使用甲醛不會對人體健康構成威脅。