治療上有五個重點
1.解除動物的疼痛不舒服
2.盡可能移除耳道內的分泌物與殘渣
3.消滅感染源，包括外耳與中耳
4.逆轉慢性的外耳道病變
5.確認原發原因(Primary cause)
獸醫師能提供的工具有：除蟲滴劑，潔耳液、外用耳藥，全身性的口服藥，鎮靜深層清洗耳朵，手術。
- 除蟲滴劑：主要以清除耳疥蟲為主的滴劑。建議可一個月使用一次。
- 潔耳液：任何感染，均有機會在感染處形成生物膜(Biofilm)，而生物膜可以保護病原們不受到藥物的破壞，使得病原可以大量的孳生、更使得發炎更加嚴重，其中，潔耳液可有效地破壞生物膜的結構，可考慮每周清潔兩次。
因綠膿桿菌感染而形成的分泌物及生物膜，圖片取自: todayveterinarypractice.com
- 外用耳藥：多數商品化的外用耳藥為抗生素、抗黴菌藥、類固醇的混合藥劑，須注意有些類固醇長期使用可能會造成脫毛的現象，如Betamethasone, Dexamethasone，依據藥物的效果，有一天一次、一天兩次等商品可以使用，須依造獸醫師的醫囑使用。
- 口服藥物：一般使用 1. 在對外用藥沒有反應，2. 同時有中耳炎、內耳炎，3. 無法使用外用藥，4. 明顯有耳葉鈣化、耳道增厚等慢性病變的動物。藥物內容也是以抗生素、抗黴菌藥、類固醇為主。其中，藥物透過血液循環跑到耳道的濃度很低，因此需要較高的藥物劑量才可以起到效果，另外在使用抗生素的時候，建議仍須根據細菌培養之結果再使用，若有中耳炎的話，建議中耳與外耳分別都需要做培養。若要長期服用藥物，需要逐漸減少劑量，避免高劑量的藥物產生過多的副作用。而一般使用時間通常為細胞學檢查下在正常範圍內後再使用一週。
- 環孢靈(Cyclosporin)：可使用於嚴重慢性增厚且又無法手術或是不想手術的病患。建議須與獸醫師討論相關副作用後再考慮使用。
- 鎮靜深層耳道清洗：在嚴重的耳道感染時，是非常疼痛的，多數的狗都不願意被碰耳朵，更不用說檢查了，免不了需要麻醉去進行耳道清潔，以及評估耳膜的完整性，如果條件允許，在清洗耳朵前，先進行CT確認是否有中耳炎，若有明顯中耳炎的影像證據，可在清除完耳道內的髒污之後，進行耳膜穿刺，去收集中耳內的分泌物，並執行細菌培養。一般耳膜在穿刺之後約一個月左右可自行修復。而這一個月必須服用口服藥物，避免感染再度發生，同時避開可能的原發原因。須注意術後可能會有神經症狀的產生，如前庭症狀、歪頭，耳聾等等。
