昨日疫情消息曝光後，外界將禍首指向廚餘養豬，農業部部長陳駿季直言，病毒是由境外移入，並非在廚餘中產生，只要取得環境部核可、高溫蒸煮，皆是合格廚餘。目前尚未確定病毒如何進入養豬場，外界不應將廚餘養豬污名化，未來視疫情狀況再行跨部會研商廚餘管理方式。
農業部次長胡忠一表示，依據世界動物衛生組織（WOAH）規範，廚餘中心溫度 90 ℃以上、蒸煮一小時，便可殺死病毒，蒸煮可用於養豬，目前歐盟、美國、日本、南韓也都採相同作法，他澄清，台灣還未「全面永久」禁止廚餘養豬。
但未控管風險，目前取得廚餘核可再利用的牧場，僅可使用來自食品廠的純植物性廢渣，例如：豆渣、酒粕等，而不能使用家戶廚餘。環管署統計，2024 年全台家戶廚餘有 50.5 萬公噸，其中 23.1 萬噸（45.8%）會製成堆肥、21.6 萬噸 （42.8%）用於養豬、4.8 萬噸（9.5%）用於生質能，其他如養黑水虻約使用 1 萬噸（1.9%）。
環管署副署長林左祥指出，目前全國每天家戶廚餘量為 1384 公噸，其中約 593 公噸家戶廚餘是由豬吃掉的，除家戶廚餘外，另有 731 公噸的事業廚餘（來自餐廳、團膳）也多作為豬飼料用，人口越多的都市造成的廚餘越多。而廚餘養豬場大多飼養本土黑豬，多坐落鄉村地區，鄉村裡的豬每吃一口，都是在為都市分憂解勞，全面禁止廚餘養豬，來自都市的廚餘去處便成了新問題。
林左祥坦言，2021 年時也曾暫停廚餘養豬一個月，但當時僅限家戶廚餘，可靠堆肥、生質能及黑水虻等其它方式消化，但此次禁止廚餘養豬，範疇包含 每日 1384 公噸的家戶廚餘，以及 731 公噸的事業廚餘（來自餐廳、團膳），總計每日需處理 2115 公噸，超出現有量能 495 公噸。
林左祥表示，目前每日多出的 495 公噸廚餘，將視各縣市狀況，分別以焚化爐焚燒或掩埋，以南投縣為例，目前並無焚化爐，便會為採取掩埋，環境部也會請各縣市加強廚餘源頭減量宣導，「在家吃多少煮多少，出外吃多少點多少」，並請民眾排出廚餘前要瀝水。
據悉，2021 年暫停廚餘養豬的一個月，大量廚餘進入焚化爐，一度讓焚化爐發出白煙。若永久禁用廚餘養豬，每日需額外處理近 500 公噸的廚餘，環境部能否負荷？林左祥僅表示，待 15 日病毒分離、農業部的廚餘養豬政策確定後，環境部再行配合。
長期關注環保議題的「看守台灣協會」發文指出，養豬廚餘含有高鹽份，會腐蝕焚化爐體，增加停爐維修頻率，且鹽分若與澱粉類食物水合，燃燒容易產生戴奧辛，加上廚餘含水量高，容易造成爐溫降低，導致不完全燃燒，以上皆會增加焚化爐空汙排放，包括重金屬與戴奧辛，同時會惡化垃圾危機。
「看守台灣協會」認為，養豬廚餘若進入焚化廠，將是一場災難，建議環境部與農業部協調，在各地配置簡易堆肥或黑水虻養殖的農業設施，收受、處理廚餘，讓廚餘可以進入非洲豬瘟風險低又適合使用堆肥或蟲糞的農地。
