南斯拉夫內戰爆發,新任塞爾維亞軍指揮官對於突如其來的內戰,在初期顯得有些不知所措,於是下令各旅級部隊不得做出大範圍移動的指示,僅針對孤立在Cazinska Krajina地區的波西尼亞叛軍發動炮擊,對波軍造成部分傷害,並掃蕩散落在北部各地的波西尼亞及克羅埃西亞零星叛軍,計劃先將北部地區的控制權收入囊中。
至於克羅埃西亞軍指揮官認為克軍戰線緊縮,部隊戰力密度大於波西尼亞軍,有望驅逐控制南斯拉夫精華地區的波軍,因此數次對駐守在Srednja Bosna地區平原區域的波軍展開掃蕩,獲得不小勝績。
波西尼亞軍遭到塞爾維亞及克羅埃西亞雙方的夾擊,且部隊分散在各地,指揮官只能下令各旅固守在城市內抵抗,尋求戰線串聯的機會。但因受到塞爾維亞及克羅埃西亞雙方面的軍事攻擊,波西尼亞部隊戰損高於預期,因此指揮官自國外進口大量武器配發給市民,打算藉此擴充兵力,但沒想到塞爾維亞竟早有預期,事先要求聯合國頒布武器禁運的命令,使波西尼亞陷入空有兵源,但無以配發武器的窘境,依然無法擴充足夠抵抗侵擾的戰力。
原本即渴望一勝的克羅埃西亞指揮官見狀,立刻抓住機會,對Srednja Bosna地區的波西尼亞軍連續發起進攻,每次皆有斬獲,終以蠶食的方式攻下Travnik,而鄰近地區大城市Zenica的守軍見Travnik淪陷,再評估克軍指揮官的野心,幾可預期Zenica將成為克軍下個目標,不久後勢必發生一場血戰。
預計先將南斯拉夫北部區域叛亂彌平的塞軍指揮官,持續針對Cazinska Krajina地區發起進攻,並調派2支精銳旅接替正規旅,接手Bosanska Krupa攻擊任務。
面對須越過河川天險的戰鬥,塞軍精銳旅的攻擊顯得疲軟,但波軍也並未做出有效的反擊,使塞軍即使在不利於己的地形交戰,仍能保存完整戰力。反觀另一支塞軍正規旅則繳出好成績,攻破同樣具有河川天險的Bihak,成功控制Cazinska Krajina地區的主要城市,連帶圍困了Bosanska Krupa的波軍,使該區域的波軍陷入的補給短缺的危機。
塞軍指揮官見Bosanska Krupa的波軍孤立無援,遲早因斷了補給而潰敗,於是迅速將2支精銳旅快速調派至與克羅埃西亞具有爭議的Sjeverna Bosna地區,打算掃蕩該地區的零星克軍,完整奪取北方控制權。
波西尼亞軍指揮官雖眼見四散在各處的波軍戰況不佳,但因遠水救不了近火,不得不放棄營救計畫,下令維持原方針,固守現有控制區域中的關鍵城市,再逐步找尋突破。於此同時,波軍指揮官也發現塞爾維亞將軍事重心放在北部,尚未考慮塞拉耶佛的狀況,於是下令塞拉耶佛的各旅儘速完成作戰準備,近期將在塞拉耶佛對塞爾維亞軍發動軍事行動。
急於奪取Srednja Bosna地區的克羅埃西亞指揮官因為久攻不下地區要塞都市Zenica,雖稍有心焦,但在接下來的一次奇襲作戰中,克軍繞過Zenica的層層防禦,終於攻入城鎮中,逼退當地守軍,成功佔領Zenica。然而波西尼亞自知己方軍事優勢不若克羅埃西亞,因此將克羅埃西亞侵略城市,造成周邊國家產生難民危機這點,大肆宣揚於國際,導致克羅埃西亞政府迫於國際政治壓力,憤恨不平地同意將到手的Zenica歸還波西尼亞,使流落在外的難民回歸家園,但克國政府也不斷向波西尼亞喊話,表示Zenica仍為克軍首要戰略目標,要求波軍讓步,勿多做抵抗,避免流血。
塞爾維亞指揮官眼見克羅埃西亞對波西尼亞態度強勢,並未把戰略目標放在塞爾維亞身上,因此在收拾殘存於北部地區的克羅埃西亞軍後,立刻將部隊大量轉移至塞拉耶佛,準備奪取戰略價值及資源均最高的塞拉耶佛。
由於塞爾維亞的戰略改變太快,波西尼亞在塞拉耶佛佈署的部隊仍未拓展在塞拉耶佛的戰略縱深,就面臨塞爾維亞的大軍包圍。且塞爾維亞指揮官在下令將部隊移轉至塞拉耶佛後,旋即對波西尼亞佔據的關鍵城市Centar及Novigrad發起全軍突擊,並以懸殊的的戰力擊潰2處城市的守軍,而緊守在Novo Sarajevo部隊見狀,則開始構築戰壕,希望能藉此多爭取一些時間,阻擋塞軍的侵略。
由於波西尼亞幾乎是呈現困獸之鬥的態勢,塞爾維亞明顯隨時可取得塞拉耶佛的控制權,克羅埃西亞指揮官認為塞爾維亞的勢力將逐漸坐大,應想辦法同樣擴大己方之實力,但克軍遲遲無法攻克Srednja Bosna地區,長久以往,在南斯拉夫的影響力將無法與塞爾維亞抗衡,於是克軍指揮官決定暫緩佔領Srednja Bosna地區的計畫,改為正面與塞爾維亞衝突,直接削弱塞爾維亞的勢力,選擇的首要目標就是Juzna Krajina地區。
克羅埃西亞軍將原本大量集結在Srednja Bosna地區的兵力,調撥大部分至Juzna Krajina地區,發起進攻,並獲得預期中的戰果,雖然塞爾維亞立刻集結部隊展開反擊,但效果不彰,僅殲滅1支旅,難以奪回地區控制權,而克軍為了鞏固戰局,則在當地加速構築防禦工事。
完成對塞爾維亞的作戰後,克軍指揮官隨後來個回馬槍,指派將領Ludvig Pavlovic率領部隊回頭進攻要塞都市Zenica,悄悄越過層層防禦,成功發動奇襲,盡殲當地駐軍,取得城市控制權。至此,波西尼亞軍已無力反擊,指揮官於是宣布Srednja Bosna地區徹底淪陷,且不再擬定奪回計畫。
由於波西尼亞在這場內戰中的敗勢已定,塞爾維亞趁勢掃蕩塞拉耶佛殘餘波軍勢力,波西尼亞當然無力抵抗,於是對塞爾維亞政府表達願意展開談判,協議停火。
於是,波西尼亞要求獨立的抗爭之路止步於此。
成功遏止波西尼亞獨立的塞爾維亞,立即將位於塞拉耶佛的部隊移轉至其他區域,全力對付另一股試圖分裂南斯拉夫的克羅埃西亞,並嘗試將Srednja Bosna地區收回囊中。但由於克軍指揮官採取的作法為「每下一城即加固一城」,因此塞爾維亞要收復失土也相當不容易,幾回攻防下來,雙方均未嚐到任何甜頭。
隨後克羅埃西亞與塞爾維亞雙方戰況長期呈現僵局,克羅埃西亞方面評估在這場戰爭中獲取之籌碼雖不如塞爾維亞,但也無法再撼動目前戰局,而塞爾維亞則認為己方在南斯拉夫影響力上取得上風,即使無法透過軍事手段變更目前克軍控制區域,取得更全面的勝利,在政治談判上也未必會落敗,於是雙方同意停火,以政治談判手段解決獨立爭議問題,使本場內戰迎來終結。