《怪獸死了怎麼辦》是一部披著特攝片皮時而反諷日本政治與政府官員的一部黑色幽默片。故事描述有一天侵略日本的巨大怪獸死掉了，在國民高興慶祝的同時，日本政府卻面臨到一個巨大的問題。大怪獸的屍體應該怎麼辦？這問題落在了被指派處理的特工隊員帶刀新太身上，而關於死掉怪獸該怎麼處裡，各處政治鬥爭角力現在才要開始。