織田信長奉足利義昭上洛受阻。憑藉強大軍事實力,信長迫逼反對者投降。足利義昭成為第十五代將軍後,勸信長擔任副將軍,被信長拒絕。
永祿十二年 (1569 年) 一月,信長率主力部隊返回美濃,期間阿波國三好氏三名武將 (三好長逸、三好政康、岩成友通) 竟聯同齋藤龍興等襲擊足利義昭的臨時御所六條本圀寺。信長援軍趕至,擊退三好、齋藤聯軍。「本圀寺之變」後,信長按照原定計劃攻打伊勢國。只用了短短幾年時間,他便把伊勢國納入自己的控制範圍。
與此同時,足利義昭試圖重塑幕府的榮耀,這使得他與信長之間存在不可調和的矛盾,後者只把他當作傀儡。義昭與信長暗中較勁,信長為限制義昭的大將軍權力,訂立了稱為「殿中御掟」九條掟書 (公布法或公定法),之後復追加七條昭告天下,並迫使義昭承認這項命令。義昭與信長的對立日益顯著。
信長繼而以義昭的名義對各地大名發佈要求上洛參見的命令,越前國朝倉義景對此反應冷淡。元龜元年 (1570 年) 4 月,信長夥同盟友德川家康向越前國進軍。
朝倉軍節節敗退,突然,織田信長妹夫近江國淺井長政基於父親淺井久政的要求,決定撕毀與信長的盟約,派出家臣出使越前國,向朝倉義景表示願意夾擊信長,以守護淺井與朝倉家長久的友好關係。淺井的背叛令織田、德川聯軍陷入危機,全賴木下藤吉郎、明智光秀、池田勝正等奮戰殿後,織田、德川聯軍方能夠順利撤退。
金崎之戰激起信長對淺井家的忿恨。同年六月,信長出兵攻打近江國。織田、德川聯軍與淺井、朝倉聯軍在姊川河原 (今滋賀縣長濱市野村町附近) 對峙。織田、德川聯軍率先發動攻擊,未有重大突破。淺井、朝倉聯軍精銳接連攻破木下藤吉郎、柴田勝家等大將的軍陣,最後卻遭織田、德川聯軍夾擊。隨著淺井、朝倉聯軍的右翼潰敗,姊川合戰勝負已分,淺井家受到重挫。
比叡山延曆寺一再包庇淺井、朝倉聯軍,元龜二年 (1571 年),信長採取殘酷武力手段反擊,率軍焚燬寺院。
淺井長政與父親退守小谷城,天正元年 (1573 年),小谷城之戰爆發,織田軍以壓倒性兵力攻佔小谷城,淺井久政 9 月 23 日在京極丸切腹自盡,三日後淺井長政在小谷城本丸切腹自盡,死前留下遺言囑託妻子阿市帶著三個女兒 (即茶茶、阿初、阿江) 回到織田家,並送她們出城。
武田信玄在北條氏康死後,與後繼者北條氏政修補關係,重新結盟。武田軍自甲府出發,兵分三路,向織田信長的盟友德川家康的軍隊發動攻擊,三方原之戰爆發。三方原之戰是武田信玄以上洛為目的的一場戰爭。武田軍最後取得勝利,往西前進,可惜中途武田信玄病情惡化,未幾病死。