新版LINE Pay App還有一項重大變動，就是未提供一卡通MONEY電子支付服務。
LINE Pay說明，著手開發新版LINE Pay App時，尚未有去年11月啟用的LINE Pay綁卡服務與一卡通MONEY分別驗證登入機制的計劃，直到開發後期，遇到LINE App內的LINE Pay為確保服務穩定性而導入分別驗證機制，這也讓LINE Pay面臨最艱難的一刻。
LINE Pay指出，新版LINE Pay App若再導入分別驗證機制以提供一卡通MONEY，需投入更多的開發資源與時間，但由於多數用戶是透過LINE App內的LINE Pay使用一卡通MONEY，而非透過LINE Pay App。
