據鄉里傳說，南埔石爺已經有百餘年的歷史，從前小孩生急病，來祭祀石爺祈求平安，都能得到應驗。由於十分靈驗，漸漸就吸引南來北往的人們過來祭拜。早期醫藥不發達，嬰兒早夭，先人為求順利撫養小孩平安長大，會將小孩送給關聖帝君或石爺當契子，由於南昌宮不祭拜關聖帝君，因此祭祀石爺成為風俗。