高中生和泉宏哉生長於小鎮鏡澤町，和同學水瀨杏梨同為鏡澤高中高二學生，同時也是一起做人工透析的病友。兩人每週須花費三次、每次四小時的時間在宏哉爸爸開設的診所進行透析，直到找到適合的腎臟捐贈者，才能停止治療。

鏡澤高中沒有校規，但是原則是不能觸犯法律，觸犯法律者將遭受霸凌（無視），宏哉看出制度當中的不合理，還有這個小鎮種種怪異的現象，他決定找出真相。

書名《魔女的原罪》指的是留有犯罪者血液的後代無可避免的會走上犯罪的道路。爲此，擁有相同境遇的加害人家屬一起聚居在這個小鎮，守護這些背負「原罪」的子女，避免他們誤入歧途。因爲境遇相同，也比較能夠彼此照應。

激進人士甚至舉辦「淨化血液」的儀式，拿無辜少女的血獻祭。就連具有醫療專業的人員也深陷其中無法自拔，失去理性判斷的能力，猶如中世紀西方社會中審判女巫的村民，對自己的孩子投以不信任的眼光，甚至想「淨化」他們的血液。

作者的想像力十分豐富，虛構了一個聚集加害者家屬的城鎮，但這樣的小鎮在如今網路發達的時代如何能夠與世隔絕，不被外人發現其中秘密，想來也是匪夷所思。作者五十嵐律人爲現任律師，不止藉由書中的例子帶出法律概念與知識、法庭上精彩的法律攻防，還有對教育方面的省思，值得世人借鏡。