日軍的「捷一號」作戰計畫，想定美軍在菲律賓登陸，空中作戰部份將動員駐紮在菲律賓馬尼拉的海軍第一航空艦隊，由於當時日本海軍的航空母艦幾乎已損失殆盡，因此海軍的戰機大多部署在陸上基地，因此又被編為第五基地航空部隊，再加上當時仍然隸屬於陸軍的空軍第四航空軍，共約 440架機戰組成了菲律賓的空中防禦部隊。至於「捷二號」作戰計畫，想定美軍在台灣或沖繩群島登陸，空中作戰部份將動員總部設在台灣高雄的海軍第二航空艦隊，其戰機一樣都使用分佈於台灣、沖繩、九州南部的陸上基地，因此也稱為第六基地航空部隊，總共約有470架戰機。在「捷二號」空中作戰命令發布後，大批集結到台灣與沖繩的前線基地，再加上陸軍部署於台灣的航空隊與高射炮部隊，準備全面與美軍接戰。
只是在之前的幾次海戰中，日本海軍已損失大批的資深飛行員，特別是菲律賓海戰更是慘烈，包括第一航航空艦隊與第二航空艦隊，都缺乏足夠的飛行員與戰機。為緊急補足作戰能力，很多資淺甚至只受過基礎訓練的飛行員被迫提前上戰場，而且陸軍的航空部隊情況也好不到哪裡去。為了彌補日軍空中戰力已經無法與美軍正面匹敵的問題，日軍採用了新的作戰方法，除了原本的日間攻擊外，加強黃昏與夜間偷擊，希望利用這種方式來彌補雙方的戰力落差。而被部署在沖繩的第762海軍航空隊，就是在第二航空艦隊中負責黃昏與夜間攻擊的主力，因而被寄予重望。這支別稱「T攻擊部隊」的航空隊在10月11日，就已收到夜間出擊的作戰命令，但因美軍第38特遣艦隊的突然大轉彎，讓日軍無法確認最新的位置，在夜間作戰更為危險且幾乎無法目視搜索敵人下，最後只能暫時取消先一步發動攻擊的作戰命令。
