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這次任務也是由UCA委託Drawbridge來處理，也提出Sam幫忙的話就可以免除擅自脫離組織的罪責，但小路的狀況比較複雜，所以還要再交涉。
而墨西哥的狀況也非常糟糕，在時間雨，BT和虛爆的威脅下，確實是需要連接網路來避免進一步惡化。於公於私，Sam就承接了這次任務。
第一章 Sam
在我們連接墨西哥時，Sam遇到了Deadman留下的全息投影。
在過去，Deadman因為是人工孕育的生命，缺少的內臟也是移植死人內臟，所以他一直擔心跟一般人不一樣，不會有靈魂，不會有冥灘。在前作的整個過程中與Sam跟BB路創造了非常深的連結。
Deadman利用了全息投影留下了世界局勢的訊息，美國不管是想走空路或海路都受到開若爾物質的阻礙，南美洲北邊也被一大片焦油海截斷，美國也就無法跟世界上其他地方有交流，但在Sam連結全美後，在墨西哥竟出現了板塊門（傳送門），在多次小心翼翼的測試後才知道板塊門對面居然是澳洲。
Deadman也追查了路的序號奇怪之處，BB-28照理說在紀錄上已經在四年前銷毀，所以Sam一直揹著的小路在政府資料上來歷不明，也就沒人知道路的存在，自然也不用擔心小路被抓去研究。
在這裡，Deadman也告訴我們在他所剩不多的生命裡一直在研究冥灘，而在能生出板塊門的這裡到處都充滿著冥灘的資料，而Deadman也發現自己也有冥灘，這對玩過一代的玩家，在開頭這裡得知這個事情絕對是一大安慰，Deadman也有生命歸處。
Deadman也準備了一包禮物要給路，裡面有小孩必打的疫苗跟路喜歡的玩具。
最後Deadman的訊息也表明他在發現自己的冥灘時也發現自己是Dooms體質（特異能力者），有Dooms體質的人都會有開若爾物質過敏，大都以流淚或皮疹體現症狀。而Deadman就在全息投影最後一幕邊流淚邊跟Sam告別，前往自己的冥灘。
之後Sam就一路趕回家，並在路上得知自己的庇護所遭受攻擊，路上還有紅色機甲攻擊他，但這時出現了一個大型武士機甲解決了所有敵人，這個紅色武士其實就是Deadman，但在初期我們是不知道的。
可惜回家後路跟Fragile都不見了，只在附近地上找到生還的Fragile，她表示因為無法把路當成物品，也就沒辦法帶著路一起傳送，並說後來她只能單獨把路傳送走。給我們玩家看的回憶中也沒顯示小路被殺了，但這時Sam看到有如BT的小手印鑽進BB艙中，至此我們知道路應該死了。這樣推斷合理的地方是，在一代時Mama（瑪瑪）就有一個BT嬰兒，所以自然而然我們也不疑有他。
第二章 路 ( LOU )
噩耗過後，Sam在惡夢跟現實中不斷自殺，因為他的體質是Dooms回歸者，根本就不會死。
他只能在酗酒跟自毀的交叉下發洩情緒。所以Fragile就邀請他上DHV麥哲倫號，繼續完成把澳洲連上網路的任務。
第三章 桌布橋（DrawBridge）
Sam在船艦上酒醒過後，洗漱照鏡子時還看到小路在身後的幻象，但不等他多想，Fragile就進來給他介紹了麥哲倫號的內部設施，並說Drawbridge有一個很大方的金主，Sam懷疑說聽起來是UCA的大人物，Fragile說她也沒見過金主，但只要對方信守承諾，Drawbridge就不會多問。艦橋上我們認識了Tarman （焦油人），他是主要的掌舵人也是一個有DOOMS體質的人，他的手隨著兒子被BT吞噬，所以才能感應焦油流向，他身邊也總是跟著一隻黑色的焦油小貓，其實整個劇情都沒實際交代小貓的由來，但有很大的機率是Tarman死去的兒子，而船艦在行駛時基本上都在地下的焦油流裡，所以每個人都是灰色的。Sam也在這遇到這一代最親近的戰友Dollman（偶人），他的KA（靈魂）卡在了玩偶裡面，偶人其實在這也說了，Sam手上的那個圓艙是空的。那我們看到路爬進圓艙的畫面又是甚麼呢?
為了讓麥哲倫號穿過板塊門，Sam必須要徒步穿過板塊門用Q-pid連接第一站，正如前作一樣，Q-pid是只有Dooms體質的人才能攜帶，因為上面有大量的開若爾物質，Q-pid上有六個東西串在一起，每一個的外表都刻上了物理學方程式，有反應擴散方程式，狄拉克方程式，希格斯場方程式，愛因斯坦場方程式，量子糾纏態，史瓦西半徑，都跟量子力學，引力、黑洞和場這個物理學概念有關，而這一代的Q-pid形狀像埃及棺槨一樣，這個形狀也貫穿了整個故事線。
當Sam靠近板塊門時，他發現有一群紅色長袍的人抬著紅色棺材穿過板塊門，紅色的外觀讓人想起襲擊Fragile跟路的人，其實裡面躺著的就是Higgs（席格斯），他沒在一代結局中真的困在冥灘，而這些像信徒的人應該也只是機器人，至始至終Higgs的手下都是一些冥灘來的機器人。
連接第一站後，Drawbridge（卓布橋）的金主決定見Sam一面，但他只以自稱Charlie（查理）的假人來示人，Sam對此很不滿，畢竟在過去的經歷那些高層大都各藏鬼胎。查理看到Sam懷疑的態度就說不然我把臉換成你熟悉的朋友吧，其間的選項有Deadman，Heartman，Lockne，Die-Hardman，都是過去的老朋友，不管你怎麼選，Charlie只會同意你選Diehardman，其實很多好故事在開頭都會直接或間接告知讀者事實，而這邊是完全不演了，其實Charlie就是Die-Hardman，只是他現在還不能現身。
在解釋了UCA現在已經沒有總統了之後，現在國家的管理主要是由APAS系統接手，而管理APAS的民間組織就是APAC，接著APAC的President直接出現在艦橋上，感謝Sam的幫助，並說服Sam能繼續把澳洲連上開若爾網路。其實President出現時有幾個異象，一個是焦油小貓對他哈氣，有短短的一幕President身上有冥灘的小螃蟹在爬，Sam還看到Amelie（亞美利）的幻像，她身為滅絕體在一代結局時把自己鎖在自己的冥灘，不讓人類過早滅亡，但相對的她也必須在冥灘忍受近乎永遠的孤獨。所以儘管President才剛現身，就可以確定其實這人身上有鬼。
在這裡Sam也沒有理由拒絕任務，只能走一步算一步。而每次Sam連結BB艙的時候都會有滲透效應發生，看到一些BB過去的回憶。而這些幻像都是真相的碎片，只是太短暫了無法窺其全貌。
在這一章我們會確定紅衣人的身份就是Higgs，這次他帶著冥灘的機甲產物來向Sam復仇，那是冥灘的技術，一種未知的技術，至少現階段還是。在西堡結Higgs招喚出了大型機械章魚來襲擊Sam，那是一種跟BT不一樣的產物。他的風格也一樣這麼荒誕，一點都沒變，在跟Sam的對話中還炫耀他從小路房間搶來的補夢網，所以幾乎可以確定，他就是攻擊Fragile 跟小路的人。
解決了章魚後，由於Higgs嘲諷Sam說他對於路一無所知，加上之前Deadman留下的訊息，Sam要求Fragile 去調查小路過去的紀錄，而查到的也跟Deadman說的一樣，在前作時屍體焚化部的Igor死前交給Sam的BB-28是在兩年前，時間根本對不起來，也就是路是直接繼承了BB-28這個號碼，真實的來歷卻被隱藏了起來。
在這之後Sam的任務之一就是去接一個重要的夥伴，她比Sam還早加入Drawbirdge，也就是Rainy（蕾妮），我們第一次見到她時就看到她在時間雨下玩耍，彷彿時間雨的老化效果對她沒有影響一樣。
第四章 雨滴 RAINDROPS
船艦上，在Rainy跟Fragile一頓噓寒問暖後，Sam接了一個營救袋鼠的任務，自從時間雨開始肆虐，冥灘的物質讓野外動物不斷進化，保持物種多樣性與研究動物就變成了重要的工作，這次Sam要在山火裡把袋鼠帶回動物收容所。我們在Rainy招喚時間雨撲滅山火後，終於知道為甚麼Rainy是Drawbridge的一員，她真正的能力其實是招喚”核心雨”，在過去人們不懂她的能力，只知道她所到之處都會下雨，自然被周遭的人所厭惡。
在回憶的片段裡，Fragile在Rainy站在橋邊猶豫要不要往下跳時找到了她，而有一幕Fragile因時間雨老化的手被Rainy招喚的核心雨治癒，Rainy的Dooms體質絕對是非常珍貴的能力。至於為甚麼Fragile皮膚會老化，是因為在前作，Higgs逼迫她殘酷二選一，選擇逃跑讓Higgs用核彈把城市毀滅，或是走入時間雨中，Higgs就會罷手不引爆核彈。而Rainy的出現終於治癒了Fragile脖子以下老化的症狀。
在鑑橋上，Fragile也解釋了核心雨，在Rainy半徑1.5公尺內的雨都能把所有東西恢復正常，抵銷時間雨的效果。但Rainy在過去參加了UCA的人工孕育計劃，她想說懷孕有了孩子就能找到人生的意義，但周遭的惡意完全沒有停止，除此之外很不幸的，Rainy也患有靜胎症候群，在死亡擱淺後有許多懷孕的女性都患有這種症狀，胎兒都會停在七個月左右就停止生長，但不是單純的停止生長，而是子宮裡的時間就像停止了一樣，目前還沒找到任何治療的方法，Sam在墨西哥連接網路時也遇過類似的倖存者。
後來麥哲倫號因為焦油流不穩定而無法前進，所以Sam就只能單獨往前調查，在那裏我們看到這一代獨有的焦油瀑布，但就跟前作的Cliff一樣，Sam也被捲進類似的世界，在前作Cliff是Sam的親生父親，所以才有這麼多連結跟異象。但這次Sam在裡面遇到的男子又是誰呢?
第五章 Conflagration ( 大火 )
第一次遇到Neil是在一個放着煙火的戰爭城市裡，到處都放著煙火，街上充滿著火焰與煙硝，如此衝突的場景其實就跟Neil小時候第一次遇到Sam的前妻Lucy有很大的相似之處，很明顯，在焦油瀑布裡的應該都不是活人，何況還有前作Cliff的前車之鑑，加上Neil出場就領著一群骷髏士兵。
有時候一個冥灘並不會只專屬一個人，如果一群人死亡前有共同的強烈連結，他們的Ka（靈魂）就會一起被困在特殊環境中，譬如同一個戰場犧牲的士兵跟人們就可能會共享一個特殊的冥灘，儘管那裡面並沒有海灘。
在這裡Sam也遇到了另一個有實體的女孩走在街上，而她就是未來的另一個夥伴Tomorrow 。
在Sam擊敗Neil後，Neil倒在地上把頭上的頭巾解開拿在手上，嘴裡同時也含糊不清地說著Nil…vana，偶人這時候卻誤解成Nirvana，也就是佛教裡涅槃的意思。其實那頭巾是跟Lucy有關的圍巾，而Lucy就是Sam已過世的前妻，Neil因為執念從來沒有消逝過，他想告訴Sam他是誰。
隨後我們也看到剛剛的實體女孩躺在地上，那樣子就跟Lucy小時候在戰場上卡在石柱下一樣，那也是這場景另一個寓意。隨後天空中掉下一個東西引起爆炸，地上的女孩變成了一個像是埃及棺槨的東西。
回到現世後，Sam被一隻野生動物咬醒，而棺槨也被牠的同類們咬穿面部的外殼，偶人建議最好把棺槨帶回麥哲倫號好好研究。
第六章 Chrysalis ( 蛹 )
在Tarman跟Fragile一頓操作下，把棺槨破壞並稍微清理了裡面的女孩，但是女孩手臂上卻有類似開若爾疹的症狀，不過疹子裡會伸出尖刺，不小心被噴出來的液體濺到的Fragile，皮膚上還出現老化的症狀。
在大家好不容易清理完棺槨的焦油物質並讓女孩睡著後，女孩卻飄在空中，Tarman推斷她有Dooms體質，在睡夢中會連接冥灘導致大量開若爾物質出現，所以她會浮在半空中，就像Sam每次連接開若爾網路時都會飄起來一樣。儘管Sam是在死者的世界找到她的，但經過血液跟DNA檢測，她卻是活生生的人類，Fragile認為她是出生在亡者世界的人，並為她取了名字，Tomorrow。
在之後我們可以看到Tomorrow跟Rainy，Fragile相處的片段，‘’左手手腕還纏着繃帶‘’
的Tomorrow不但不喜歡穿鞋子，不喜歡講話，喜歡吃手指，只吃隱生蟲，就像個孩子一樣。
隨著Sam來來回回忙著連接開若爾網路時，我們還可以看到Rainy幫Tomorrow梳頭髮，還一邊唱Raindrops are falling on my head. Sam經過時還在旁邊偷聽並學著唱，讓所有人都傻眼。
還有一次Sam回來時碰到Tomorrow想出去，Fragile勸道外面很危險，必須要留在船上。Rainy 也拿着一籃梨子想安慰Tomorrow，但Tomorrow拿在手上的梨子卻瞬間腐爛，沮喪的她只能跑回房間。
在一次會議中，大家在討論Tomorrow要怎麼辦，Tarman認為如果她的家人在亡者的世界，我們還是可以送她回去，焦油流還在那裡。Rainy則說跟家人在一起未必會幸福，因為她自己就是被家人趕出來的，Fragile也認為我們必須照顧她，她畢竟是活生生的人。Sam最後下結論說，Tomorrow 來的地方跟地獄一樣，原文是It’s like hell hole. 所以我們要把她留在船上照顧。但這次討論卻被門外的Tomorrow 聽到了。
後來Fragile跟Tarman通過廣播告訴Sam，Tomorrow 不見了，Tarman也表示她好像沒打過任何疫苗，所以他事先就把Deadman留給路的疫苗給Tomorrow打了，至少不用擔心她在外面感染疾病。
在Sam 尋找Tomorrow 的路上突然被幽靈機甲襲擊，這是很重要的片段，Tomorrow 展現了她腐化萬物的能力，她不但可以在地下焦油流裡自由活動，還有異常靈活的身法，也許這是她在亡者世界學的，但很可惜，我們沒有任何線索得知，至少在這一代沒有任何解釋。她用自己的能力打敗了一群幽靈機甲，算是救了Sam一次。
在戰鬥後，Tomorrow 對Sam說她好像沒有任何地方可以去，也懷疑自己到底是不是活著，甚至不知道自己有沒有家人，還問Sam有家人嗎，Sam只說有啊，但已經不在了，同時幫Tomorrow 穿上鞋子，回到船艦後，看到Tomorrow 身手的Fragile，就問Tomorrow要不要幫Drawbridge 工作，當然也是找個理由留下Tomorrow，前提是要她先學會控制自己的能力，Rainy也把大家都有的輔助戒指交給Tomorrow。
在這之後，Sam要去老朋友Heartman（心人）的實驗室，也順便把他的實驗室連接上開若爾網路。心人為了尋找妻兒每21分鐘都會前往冥灘3分鐘，這一次他有了外機械骨骼，所以不用再擔心突然昏倒了，但隨著一次一次的死亡再電擊心臟復活，讓他的心臟逐漸逼近極限。每次復活，他都會從淚腺裡收集冥灘的水交給水文學家，也紀錄冥灘座標來尋找妻兒的靈魂。
這個實驗室的另外一個人就是水文學家，她一樣有21分鐘症候群，每21分鐘就會想吐，所以她不喜歡見人，只經過暗格把眼淚收走，送了Sam一個讚表示歡迎，而設施裡面也有能和緩嘔吐症狀的溫泉，她的兩個女兒也都有21分鐘症候群，Sam在連接網路時都會碰到他們，這三人各自在自己的基地進行不一樣的研究，也算是女承母業了，而目前人類還對這個現象不了解，至少這一代還不能治癒。
離去時Heartman 拖著一個類似行李箱的東西就要登上麥哲倫號，Sam問你就只帶這些東西？Heartman 只說我需要的東西都在麥哲倫號上了，這個只是我的一個保險。其實裡面是Deadman的心臟，Deadman在前往冥灘後把自己的心臟送給了Heartman，也為之後的重聚埋下伏筆。
在船上Heartman說最近他跟Fragile不斷收到屬名心人的信，但是他卻不記得有寄過這些信，信裡是有關小路的調查報告，還有UCA當初在研發開若爾網路的秘辛，七個月大的嬰兒是人類與冥灘之間的橋樑，一開始的時候是需要犧牲這樣的嬰兒才能建立開若爾網路的，而當時有十個這樣的BB，路就是其中一個，但信裡的資料表明美國政府只用了9個Bridge Baby，而且就如Deadman所說，路繼承了BB-28這個序號，但真正的BB-28在四年前就被銷毀了，不過現在的開若爾網路已經不再需要犧牲靜胎了，這些秘辛也終於在這段劇情中被揭露，也算是交代了開若爾網路被建立的始末。
第七章 POD ( 圓艙 )
自從Tomorrow穩定了之後，Sam會在船艦休息時看到Rainy、Fragile跟Tomorrow互動的情況，期間Tomorrow也曾說，在她長大的地方所有的事物都不會改變，這一句是少數Tomorrow描述她長大的地方，整個過程我們對她長大的過程知之甚少，劇情也沒有交代，只是會發現隨著故事發展，Tomorrow越來越健談，跟大家的羈絆也越來越深，也包括Rainy常常拖著Sam一起教Tomorrow的益智問題，雖然Tomorrow一臉不情願的樣子。
後來Sam在連接開若爾網路時認識了為母，她的Dooms體質賦予她能用開若爾手將靜胎症候群的胎兒暫時移出來檢查，但只能維持很短暫的時間，她也曾經將靜胎移至BB圓艙中，這樣魯莽的舉動也造成了夥伴孩子的喪生，靜胎在圓艙中的心跳只維持了三分鐘就停止了，但儘管如此，也有越來越多靜胎症候群的母親找上門來，這次找上Sam是希望他能夠摧毀附近的武器工廠，這樣為母的庇護所在未來就會少受到外面的人騷擾。離開前為母用她的手穿進Sam的肚子裡拿出了子彈，其實這顆子彈是一代時的劇情，在Sam還是嬰兒時，Sam的父親Cliff跟他一起中彈，Sam在過去也是被實驗的嬰兒之一，而當時受命開槍的就是Die-Hardman（頑人）。之後身為滅絕體的Amelie把嬰兒Sam送回人世，從而將死者世界撕開更大的裂口讓更多的BT進入人世，也進而造成Sam的回歸者體質，而Sam也被Amelie的Ha（肉體），也就是美國前總統Bridget撫養長大，期間Amelie與Sam培養的感情是意料之外，最後導致滅絕體的Amelie放棄提早實施這個世界的第六次大滅絕。
當Sam搗毀武器工廠時會發現也有幽靈機甲在守護工廠，如無意外就要出意外了，當搞定一切時Higgs又憑空出現，但一如往常，儘管已經控制住Sam，他還是要長篇大論一番，其中他說了一句話，”只要懂得運用槍枝和暴力，就能掌控全世界，這道理萬古不遍” ，狠狠諷刺了現在的時局。
但當Higgs檢查Sam的BB圓艙時，臉上也出現驚訝的表情，還嘲笑Sam到現在還不知道實情，Higgs的回歸肯定是要對Sam復仇，這次他從身上掏出了會不斷勒緊的機械腸子，想讓Sam一次又一次的窒息死亡，因為Sam根本不會死，他只想折磨Sam。
突然間，紅色武士又憑空出現來拯救Sam，如之前所解釋，這人其實就是Deadman所操控的機甲，但這次紅色武士會發出嬰兒的笑聲，讓當時的我相當困惑，讓我還在猜這是不是路的分身，Higgs也自言自語的說，”這個人跟我一樣!”，其實他是說一樣從冥灘用機甲返回人世。
不過Higgs很快就被手下的幽靈機甲救走，當Sam質問紅色武士是誰時，紅色武士只放了一段嬰兒安眠曲，接著就用武士刀劃地為圈消失不見。
這期間回去船艦的時候會碰到Rainy跟Tomorrow在用鞋子玩預測天氣遊戲，原本的日本習俗是用木屐，這時Sam也想玩，但發現自己的鞋子太緊踢不出去，超級好笑。但一切都表明，Tomorrow越來越活潑，也表現得越來越像正常人。
Heartman也抱怨他的房間會出現積木，還問Sam船艦上是不是有小孩，偶人說應該是Tomorrow，畢竟她對所有的事情都很好奇。
在連結東堡結後，又出現了焦油瀑布的現象，這次Sam一靠近，一個焦油形成的Neil就把他的手握住，往上捲進了焦油瀑布裡。
第八章 Deluge ( 洪水 )
這次是第二次，我們還沒搞懂每次進來這個亡者世界是甚麼原因，這次戰場是在水下，當我們擊倒Neil時，他嘴裡喊著 ”路，路在哪裡?” 這次Sam在他身上搜出了證件，但在最後被地上包包裡的假娃娃炸彈炸得不醒人事，醒來之後就回到現世了，在Tarman聯絡Sam時還說了我們只失聯了幾秒鐘，偶人說那個地方大概跟冥灘一樣時間流速不一樣。
靠著拿到的證件，Fragile 找到了他的身分，是一個名叫Neil Vana的送貨員，隸屬於早期的Bridges，秘密幫Bridges走私一些敏感的物品，他的卡片也查出可以進入一些設施，也跟BB實驗室有關，更重要的是，他跟Sam都在同一個時間段去同一個設施找心理治療師，紀錄上他死於一場虛爆，而那場虛爆Sam是唯一活下來的人。
而且查到Neil是Sam前妻Lucy的治療個案，檔案中還有他們的合照，當時Lucy還懷著孕，但Sam說道”那不是我的孩子，她親口對我說孩子不是我的，我沒有孩子。"
說完就轉身離去，顯然這段經歷Sam還耿耿於懷，誰又能對背叛輕易釋懷呢?
而在連接BB艙的時候，滲透效應裡甚至看到了Lucy相關的回憶，每一次的滲透效應都揭露了一點碎片。
這一章我們可以看到Tomorrow在用蘋果練習時間能力時越來越熟練，其中一次還分了Sam一顆唯一成功的蘋果，只不過當下次Tomorrow成功催熟所有蘋果時反而不分Sam吃了，雖然好笑，但也暗示Tomorrow成為戰力的那一天到來。
另外，Sam在搗毀另外一座幽靈機甲武器工廠時，資料裡發現他們運送的路線跟APAC使用的路線高度重合，Tarman跟Fragile 極度懷疑Higgs背後的指使者是APAC，也建議大家以後在跟President往來時要小心一點。
而另一件事一直困擾著Fragile，她告訴Sam，Haertman常常會在船艦上夢遊，晃來晃去不知道在做什麼，要Sam多注意一下。
有一天晚上Sam被吵醒，突然發現Heartman在走廊走動，沒想到過去攀談時他居然說自己是Deadman，原因就是，Heartman 已經開始在使用Deadman留下的心臟了，那也是為什麼當Heartman前往冥灘時，Deadman可以利用這三分鐘使用他的身體，而那些署名心人的秘密信件就是Deadman寄的，因為在冥灘反而更容易進入資料庫去查BB路過去的紀錄，Deadman也坦承是他把路過去的紀錄都刪掉了，就是為了讓Sam跟路可以重新開始，只不過一場襲擊一切都變了。這時三分鐘已到，偶人自願留下來跟回來的Heartman解釋情況。
第九章 Puppets ( 傀儡 )
自從Drawbridge開始懷疑APAC後，President有時候會用加密頻道跟Sam通話，試圖說服Sam一切可能跟UCA有關，也狡辯自己也很擔心武器流竄各地的情況，還囑咐Sam不要讓其他人知道自己偷偷聯絡他。
除此之外Rainy時間過長的靜胎症候群也導致了她精神不穩定，於是只能帶她去找為母，讓她親眼看看自己的孩子還是健健康康的，這給她帶來安慰。但之後為母叫住了Sam，表示自己想再檢查一次路的圓艙。
據她瞭解，每個圓艙在內部都會有一串編號，為母發現路的圓艙編號是BB-00，也就是第一個Bridge Baby，而且後面的日期也顯示那是在十一年前Sam遇到虛爆的那一天。為母則勸Sam執著於過去不是什麼好事情，但現在又多了一條線索，想必Sam一定會追查下去。
回到船艦上，Tomorrow 跟Rainy在整理貨物時，Tomorrow 想安慰Rainy，所以說在我來的地方是沒有人生小孩的，他們都待在媽媽的肚子裡。但那也挑起Rainy不安的情緒，她反說道，在我們的世界，嬰兒會出生並長大成人。偶人也和緩道，Tomorrow來的地方是亡者的世界，那樣的地方是不會有孩子出生的。Tomorrow 也意識到自己說錯了話並向Rainy道歉。
據我的記憶，Tomorrow就只說過這兩句話來描述她長大的地方，希望幾年後的續作能說說更多Tomorrow 在另一個世界的回億，她是怎麼學會戰鬥的，怎麼學會生存的，怎麼長大的。
之後在一次麥哲倫號下潛時遭到機械章魚的阻擾，Higgs還突然出現在艦橋上劫持了Fragile，但很可惜Higgs並不知道Tomorrow 的存在，而Tomorrow再次在Higgs身上使用熟練的腐化能力，也讓大家發現Higgs是靠機甲回到現世的，他沒有肉體可以使用，沒有Deadman跟Heartman這樣的羈絆，那情況比較像是偶人，”Ka”也就是靈魂附在無機物上。而另一個關鍵是，Tomorrow 使用能力時，臉上也浮現跟Higgs一樣的金色液體痕跡，明顯表明Tomorrow 跟冥灘的深度連結。
被打敗的Higgs也只好用機械棺材再次遁逃，而Sam只能下船再去處理另一隻該死的大型機械章魚。
之後麥哲倫號在攻擊下擱淺在雪山區域，不但Sam要去取得關鍵替換零件，其他人也要外出去尋找原料，當然Tomorrow 也很興奮終於可以外出，擔心的Sam詢問Fragile他們OK嗎，Fragile說道可別忘了她是Fragile Express 的前老闆，Rainy跟Tomorrow也說他們是Dooms能力者，叫Sam照顧好自己就好。
President在其間再次偷偷聯絡Sam，不但說Charlie 身份可疑，也完全查不到他的資料，也說Drawbridge的資金其實來自Bridges，也就是政府方的金流。
而這一章Deadman突然藉著Heartman聯絡Sam，表示他查出BB-00的過去, 美國政府原本的計畫是只要準備一個核心BB就可以建立整個北美開若爾網路，而路就是那個核心BB，不過實驗結果不夠有效，於是就選了第二個計畫，犧牲九個BB來建立初期的開若爾網路，而路這個BB-00就被儲存了起來。
在之後Bridges打算把沒用上的BB-00銷毀，但Deadman卻發現Bridges有一個最高權限的帳號竄改了BB-00的紀錄，讓整個Bridges跟UCA相信BB-00已經銷毀了，而在之後路進而繼承了BB-28的序號。至於那個帳號的使用者其實就是Amelie（亞美利）。
之後，在Sam突破所有機甲的包圍並成功連接南邊環境觀測站後，Higgs又帶著新花樣來襲擊Sam，這次他在吉他上裝了開若爾火焰發射器，直接打了Sam一個措手不及，這種火焰會對開若爾物質起作用，所以每當Sam從生死交界回歸時，身上就會帶著大量的開若爾物質，導致開若爾火焰不會熄滅，偶人也被Higgs一腳踢到外面去，在Sam受著無盡的痛苦時，Higgs還提起Lucy背叛他的事，很明顯Higgs也知道隱情。
在這段劇情時小島還會讓玩家操控Sam在地上緩慢地往前爬，讓玩家對Higgs恨得牙癢癢卻又無法做甚麼，無力感油然而生。好在小島沒有折磨我們太久，很快Fragile就載著Tomorrow來營救Sam，而當Tomorrow徒手跟Higgs的吉他之刃搏鬥時，Fragile跪在旁邊也不知道該做甚麼來救Sam，令人訝異的是這一幕還顯示Tomorrow還有著驚人的防禦力，不管Higgs怎麼砍都只能造成皮肉傷，雖然如此，Tomorrow身上依然被砍得傷痕累累，但她類似BT的能力還是把Higgs狠狠的壓制住，一瞬間麥哲倫號也及時出現進行了火力支援，Higgs在搏鬥中扯了一把Tomorrow的頭髮就遁逃而去，而還好我們有Rainy的核心雨能力來撲滅Sam身上的火焰，但Tomorrow被扯走的頭髮想必會在之後帶來禍害。
在Sam療傷之際，偶人跟Tarman討論著Sam的狀況，偶人也決定該跟Sam談一談了，畢竟這一趟旅程也是Sam的療傷之旅，而我們也只剩最後一站終堡結需要連結，而在Sam醒來時也發現BB圓艙的異樣，Sam馬上就拿著圓艙跟偶人商量，偶人這時也說出真相，是Fragile希望偶人能幫忙Sam走出喪子之痛，但是Sam急著反駁道，路跟他才橫越整個澳洲大陸，並且想拿相片來證明，但Sam這時定睛一看卻發現照片裡的圓艙是空的，正如第一次偶人看到Sam所說的一樣，圓艙是空的，一直一來都是空的，而一路以來掃描器歐卓德克都是偶人在操縱的。Fragile在這時也走進來安慰Sam，並說希望Sam能好好活下去，畢竟她是目睹Sam在意外發生後反覆自殺跟酗酒的慘況。
Sam挫折的說，一直以來我都是一個人嗎？但Fragile則說死亡無法將我們拆散，無論如何，我們會一直陪著你。
偶人的過去其實也失去過孩子，他在生前其實是一名靈媒，妻子在一場焦油海嘯中喪生，最後變成了凝者，他的女兒當時希望能再見母親一面，於是他就帶著女兒跟妻子生前喜歡的音樂去事故點尋找妻子的BT，偶人也承認這是他這輩子做過最糟糕的決定，他們在當時馬上就被BT淹沒，但不知為何撞上岩石連同焦油被吐回現世，而女兒的靈魂則躲進了她最喜歡的玩偶中，偶人為了讓女兒能順利去彼岸，拼命鑽進了偶人的身體讓女兒的靈魂離開，於是從那時候他的KA就卡在玩偶中了，一直到Fragile發現他，才脫離躺在焦油裡等待解脫的日子。
第十章 Isolation ( 孤立 )
Sam在一次出發前往外面時，看著空的BB艙，這是這麼久以來，Sam真正意義上的獨自出發，他的生命旅程裡不斷地在失去親人，養母Bridget因癌症過世，形同姊姊的Amelie早已斷開連結，前妻Lucy的喪生，還有一直以來陪伴在旁的小路（Lou）被仇人Higgs所殺，在此之後我們也會發現Sam胸口不再帶著BB艙了，但還好Sam還有偶人的陪伴。
在連接F7北邊配送中心後，焦油瀑布又出現了，偶人也說這是最後一次了，一定要跟Neil搞清楚11年前的情況，畢竟Neil跟Lucy還有當時肚子裡的孩子，我們都還沒得知真相。
第十一章 Quake ( 門震 )
每次進焦油瀑布都不一樣，這次是Neil在焦油瀑布開了一道口子邀請Sam進去，一進去的場景是地鐵站，打到一半時，Neil讓Sam看到過去的記憶，那是個戰亂城市，就像Sam第一次進入焦油瀑布的地方，其實那是Neil小時候的記憶，而Neil跟Lucy在這樣的戰亂城市中認識，很奇怪的是，仔細看的話周遭的人都是靈魂，整個城市也正在被大型BT肆虐，但其實這段沒有任何解釋，我們也不知道Neil還有Lucy小時候是否跟Tomorrow一樣是在亡者世界長大，還是只是因為他是Dooms體質才看得到周遭這些有如BT的靈魂，很可惜一切都只能用猜測的，但能確定的是Neil跟Lucy因為接近融化的金屬而擁有同一個燙傷印記，而Lucy也在之後診療Neil時認出他來。
不過在這段回憶裡，Lucy拉起跪在地上的Neil想帶著他一起走，但後來一陣爆炸，Lucy被壓在雕像下，而Neil因為恐懼而沒有把Lucy從石堆中拉出來就逃跑了，那個情況就如前面第一次進入焦油瀑布時，Sam看到石頭下的Tomorrow一樣。
這個意象還出現在Sam打敗Neil時，頭頂的石頭掉下來壓住了Neil，但這次Sam把Neil從石頭裡拉出來，Neil還對著Sam說著對不起，我沒保護好他們，並把一個硬碟跟頭巾交給Sam，並說這是Lucy要交給他的，也囑咐Sam要保護好路。然後一股腦就把一大段的相關記憶傳給Sam看。
原來在Lucy跟Sam交往的期間，Neil可能因為組織的要求接受了心理諮商，而Lucy也因為Neil的檔案跟傷疤提早認出了他，並在Neil離開前叫住了他，給他看當時金屬飾品燙出的傷疤，然後狠狠的給他一巴掌，但明顯這段過往Neil也沒忘記，兩人很快就抱在了一起，也許那段羈絆太深了，兩人都沒有忘記彼此。
就如前面所說，Neil為Bridges工作時常在墨西哥邊境運送一些危險物品，他還跟當時的上司起了衝突，因為Neil不想做了，但組織不允許，所以被Bridges的高官威脅，字裡行間都在警告他們有Neil的犯罪證據。
不僅如此，在Neil跟Lucy的諮商片段中，他也說Bridges強迫他運送腦死孕婦的屍體，很明顯那就是早期開若爾網路研究的BB實驗體，而那給Neil帶來的精神壓力快把他逼瘋了。
有一天晚上Lucy戴著Neil的圍巾對著大片落地窗照鏡子時發現有人在跟監他們，這段也明顯表示她跟Neil有了更親密的關係，Neil開玩笑地用手機跟Lucy自拍，來看背景車子是不是跟監的車，而當時的照片並沒有隨手機檔案刪掉而消失，而是一直被存在Bridges的資料庫中，也才在十一年後被Fragile查出來，但那個合照已經說明了很多東西。
而在下一個片段則是Lucy跟Neil提分手，她說著自己已經懷孕了，而且她深愛著Sam，加上基因檢測的結果，孩子的父親是Sam，不相信的Neil還說你確定嗎，但Lucy把檢查的畫面丟給Neil看，也說他們之間是個錯誤，但Neil不在乎，還說我不在乎那是不是我的孩子，之後Neil則把圍巾跟小時候的金屬飾品交給Lucy就離開了，那就是Neil所有執念的開端。
回到現實的偶人跟Sam說著，Neil好像消失了，偶人說不知道他有沒有進入涅槃，但我們應該是沒有機會再見到他了，而Neil交給Sam的硬碟，成為一切的關鍵。
回到船艦後，Fragile跑來找Sam，並說要談談Sam孩子的事情，但Sam一時間還無法接受，他一直都以為Lucy背叛他，所以直接就說我不想聽。
但Fragile沒有理他的反駁，只說這個硬碟裡有當時Bridges的秘辛，也包含了Neil幫忙走私腦死孕婦的紀錄，還有Lucy留給Sam的道歉信，Fragile繼續解釋裡面的內容，Lucy知道回歸者的孩子一定會被抓去實驗，所以謊稱孩子是Neil的，但她也知道有一天是要讓Sam知道的，所以才把一切的真相放在這個硬碟裡面。
但說到一半，在距離最後一站終堡結跟麥哲倫號之間聚集了很多幽靈機甲，所以這旅程的最後並沒有打算給大家休息的機會，這邊有個好玩的揭露就是，我們在開拓澳洲的一路上會聽到船艦上有人問，到底是誰在VR戰鬥模擬打出這麼高分，原來那個人就是Tomorrow，所以Rainy在Fragile猶豫著要給Tomorrow甚麼任務時，Rainy就說其實Tomorrow是船艦上最厲害的槍手，可以讓她負責船艦頂部的兩座機槍，只要她把VR練習時的實力發揮出來，而Tomorrow也興奮的躍躍欲試。
第十二章 Fragile
在Sam解決一群群的敵人後來到最後一站的大橋上，這時紅色武士又出現，並露出了面具下的臉，也如前面所說，這人就是Deadman，他自願留在Sam後面斷後，Deadman從生到死，從一代到二代，可以說是Sam最好的朋友了，Deadman斷後前也說了跟Fragile一樣的話，死亡無法將我們拆散。
而在連接終堡結後，Higgs也理所當然地出現了，還在這秀了一手打破第四面牆來嘲諷玩家，說”你們是不會贏的”，在我們還害怕他這次又要想出甚麼方法來整Sam的時候，Fragile帶著整艘麥哲倫號出現在室內，並用延伸的主砲管將Higgs砸到牆壁上，甚至他的機甲還斷成了兩半，而Fragile也在這裡報了一箭之仇，拿著Higgs的吉他將他鞭屍，這時Higgs還嘴上不饒人，對著Sam說路是他殺的，Sam也送上一梭子彈，Fragile最後開啟上次的火焰，還用吉他直接砸爆Higgs的腦袋，送他回冥灘。
回到船艦後，President出現在艦橋上，其他人反常地躺在椅子上睡著了，這時他恭喜Sam終於把世界合而為一，也承認賦予Higgs力量是必要的策略，幽靈機甲也是他們為Higgs打造的，他的理由是，有實質的威脅，才會促使大家透過連結尋求力量，而說到這President身上又出現冥灘的螃蟹，Sam也才發現他並不是人類，在一連串看似很有邏輯的自白跟Sam的懷疑後，President用一代出現的”長老”樣子解釋他們在Sam連接北美的網路後，有一個開若爾網路資料中心產生虛爆，隨著周遭的四千人一起進入了冥灘，並聚合成一個整體。他們得到的結論就是為了達到零虛爆，APAS將掌控未來全世界的人類，避免沒有必要的接觸，並讓所有人以靈魂的姿態存在於開若爾網路中，確保人類處於世界的頂端，一直到時間的終結。
但突然Charlie以整身的形體出現，還是以歌舞的形式，邊跳邊轉換為原本的身分，也就是Die-Hardman（頑人），還反駁President你無法控制我們，然後把Sam從Apas 4000的冥灘拉回到現實。
第十三章 DIE HARD (命硬)
從一代到二代，仔細看的話，可以發現Die-Hardman左眼下紋了眼淚的紋身，我想那是他為了紀念Sam父親的紋身，身為Cliff過去的部下，但最後卻因為Amelie的命令而誤殺了Cliff，所以那個眼淚是代表他的悔恨。
這時回到艦橋上，他嘲笑看來就算是Apas也沒發現Charlie就是頑人，還說在新的Q-pid連接的網路下能限制連線和資訊流通。
在這時小島還玩起了”打破第四面牆”，讓Die-Hardman對玩家說，我猜你們有些人已經發現DHV不但是Deep-tar Hunting Vessel，也是Die-Hardman’s Vessel。
還解釋當APAS 4000委託Lockne（勒克妮）設計新型的Q-Pid連接器來掌控全人類時他都知道，雖然Lockne一開始拒絕，但頑人說服她接受這個任務，並在結構上開了後門，讓這款新的連接裝置不但可以促進連結，也可以切斷與亡者的連結。
說著說著就一個一個把大家喚醒並開啟了裝置把Apas 4000屏蔽，之後向大家道歉，而Tarman其實也一直都知道頑人躲在船上。
不過連喘息的時間都沒有，後面就砍來一把大刀，紅色武士突然出現攻擊大家，Sam還以為那是Deadman，但Deadman馬上用Heartman的身體說那不是我!
很明顯這次一定又是Higgs，他一進來就招喚出焦油並用蛹把Tomorrow封印起來，一如往常，他一定要長篇大論，他的目標其實是要連結到滅絕體Amelie的冥灘來招喚第六次大滅絕，雖然Sam跟Amelie的連結已經切斷，但Tomorrow卻是那個連結Amelie冥灘的唯一催化劑，在上次戰鬥時，Higgs抓了一把Tomorrow的頭髮而發現她跟Sam的基因吻合，還嘲笑Sam說，她是你的女兒啊，並大笑著帶走Tomorrow。
但在這裡眾人猜測當Sam加入Bridges的時候留下的基因紀錄有可能製造出基因層面上Sam的女兒，而目標馬上變成要怎麼移動到Higgs所在的冥灘，討論的結果就是既然Higgs有捕夢網還戴著Amelie的奇普項鍊，Fragile可以藉由大家的力量勉強帶整艘船艦瞬移到Higgs的冥灘，那現在只要Sam回到原本的地下庇護所找出跟Amelie有連結的物品，就能準確找出Higgs的所在地。
第十四章 Last Stranding ( 最後一次擱淺 )
因為焦油流混亂只能獨自穿過板塊門回到墨西哥的Sam，在路上遇到了一個看起來很好吃的巨型帝王蟹BT，其實每隻大型BT都是可以抓的，就算是劇情中的也不例外。回到庇護所後，彷彿一切都沒有變，恍惚中路還躺在椅子上睡著了，Sam溫柔地把她放在小床上，煮飯時路開著小車撞上Sam的腳，在牆壁上量身高的壁紙，每一段回憶都還歷歷在目，最後Sam在抽屜裡找到自己跟Lucy，還有養母Bridget的照片，而Bridget就是滅絕體Amelie的肉體Ha，當Sam離開庇護所的瞬間，一切又恢復了當時的混亂，畢竟當時的美好早已被摧毀。
回到船艦後，大家準備前往Higgs的冥灘，所有人坐在自己位置閉上眼睛集合Dooms體質的力量，只有Sam跟Fragile站在中間，Fragile再也控制不住自己的情感而吻上了Sam，他們兩個都是內斂的人，所以在這麼長的冒險中都沒有捅破那層紙，但在這最後的最後終於彼此回應深藏的心意。
而進入冥灘後，所有人的KA圍了一圈，也顯示出所有有羈絆的人，包括偶人的真身，設計網路的雙胞胎Lockne跟Mama，他們在前作共享了同一個肉體，還有船上的所有夥伴，在這也可以發現Tarman旁邊的是他的兒子，間接也證明了焦油小貓確實是Tarman兒子的化身。
順利傳到冥灘後，Fragile癱倒在地上，只能讓Tarman跟Sam扶她到椅子上，這裡不愧是APAS 4000的冥灘，充滿了伺服器，各種各樣的大型BT，升空的麥哲倫號也很快發現遠方被蛹封印的Tomorrow，瞬間多個大型BT就朝著麥哲倫號前進，因此當下只能靠Sam下船去把Higgs解決，把Tomorrow救出來。
當Sam要離開時，Fragile抱著他說，別忘了，我會一直陪著你。不過她身體狀況相當差，Sam只能再次把她扶回椅子上，回頭一瞬間，Amelie站在走廊等著Sam，但依然一語不發。
第十五章 On The Beach ( 冥灘上 )
Die-Hardmam隨即啟動了麥哲倫號的主炮，這邊有一幕是一手搭在頑人身上的Fragile是以靈魂的形式，她的肉體還坐在後面的椅子上，顯示出她的HA跟KA已經脫離了。在麥哲倫號被大型巨人BT抓住時，Deadman跟Heartman一個眼神交會，在麥哲倫主砲打爆BT巨人的頭之後就附身到巨人BT上，而Heartman就藉由特殊的靈魂羈絆讓麥哲倫號跟巨人BT合體。這一段是相當精彩的戰鬥，我們的麥哲倫號會在Sam處於地上前進時不斷在背景跟所有大型BT纏鬥。
因為在冥灘無法補充彈藥，所以Sam只能帶上一把Higgs當初留下的同款吉他，第一場必須要對付Higgs的武士化身，第二場則是在APAS 4000的伺服器陣列中彼此決鬥，但誰能想到除了吉他外，我們還有披薩空手道呢? 在伺服器陣列旁戰鬥時，巨人BT還會不斷破壞周遭的伺服器，這是一場不公平的比鬥，Sam所有的武器都沒辦法用，補血也只能靠地上的隱生蟲。
打到最後還會進行像格鬥遊戲一般的決鬥，Sam跟Higgs兩人拿著吉他互毆，砸到一定程度兩人還會彈奏吉他鬥琴，這時就要一直按圈才能打贏，接著就在背景的夕陽下襯托兩人裸著的上半身，不愧是抽象小島才會做的事，但在這裡Sam可以一邊罵髒話一邊狠揍Higgs，把一代二代所有的氣都發在他身上。
當Sam把Higgs打到殘血後，Tomorrow被吸進裂開的天空，然後變身成大型嬰兒穿過厚重的焦油出現在大家的面前，而那個嬰兒就是路的樣子，Higgs這時彈著琴哄著大型路，但路只是把他抓起來一口吞進去嚼碎，還把Higgs的其中一個金色面具吐出來。然後乘著黑色翅膀飛回天上的金色裂隙之中，這時Amelie也出現，灰色的Fragile跟在後面抱著嬰兒路然後把路放在地上就消失了，而就如前作一樣，Amelie抱住Sam然後一把把Sam推下水，讓他回去該回去的地方。
第十六章 Tomorrow
之後Sam進入冰天雪地的幻境裡，前面還背著一歲的小路，如同前作的手法，這個意境隱喻Sam一路走來的旅程，我們操控著Sam在冰天雪地裡艱難地找到回家的路，到達一個點後，Sam的眼前出現麥哲倫號鳴著笛，瞬間Sam回到冥灘，而Tomorrow躺在海灘上，麥哲倫號也在旁停靠。
但上了船之後，Tarman卻告知了Sam噩耗，Fragile其實死了，而且在一開始Fragile跟小路遇襲時，Fragile就已經死了，她的情況跟前作的Mama很類似，在生死之間遭受意外，因為她的傳送能力是依靠冥灘跟現世的連結，但是因為冥灘的時間流速不一樣，所以肉體才能撐到現在。
而當Sam倒在浴室痛哭時，由Fragile親口敘說當時的情況，在第一次遇襲，Higgs開槍時，她的Ha和Ka已經分離了，而且是小路把兩個人連接到一群可憐的靈魂身上，也就是Neil他們，而當時不知道為甚麼Fragile認為把小路交給他們更為安全，所以就把小路交給Neil他們保護，但回到現世後Fragile只記得自己已經死了，而當下只想把剩下的時間都留給Sam。而當麥哲倫號到達APAS的冥灘時，Fragile想起了一切。接著場景轉到Sam的臥室，Fragile的靈魂出現在Sam旁邊並說著，你永遠不會獨自一人，死亡無法拆散我們。就跟前面Deadman說的如出一轍。
回到鑑橋上，Tarman依然需要所有人合力才能導航回現世，這時居然Tomorrow的對面飄著Neil的靈魂，而畫面轉到11年前回憶的後半段。
Lucy在跟Neil分手後，有一天突然把Neil叫來辦公室，說Bridges要她跟Sam的孩子，因為他們計畫要用小路當BB祭品，畢竟回歸者的孩子是相當稀有的實驗對象，她希望Neil告訴大家孩子是他的，但一開始Neil是回絕的，不過很快就妥協了，他根本對Lucy無法釋懷，於是就說他們必須要從墨西哥偷渡出去，而且要一個禮拜內準備好，這時Lucy把硬碟交給Neil，當然那個硬碟就是前面Sam拿到的那個。
而當他們倆個要離開研究中心時，馬上就被Bridges高官抓到，但明顯沒有講好，很快就有士兵開槍擊中Lucy，Neil情急之下只能把Lucy拖進裡面的辦公室，這時高官出現在旁邊，而Neil試著跟他交涉，希望可以救下Lucy的命，他口頭答應了Neil的要求，但在高官開門讓士兵進來後，Neil馬上就被射殺了。
畫面轉到另一個場景，明顯是病人在手術台的視角，兩個醫生在討論BB-00已經順利取出，準備通知屍體焚化部對一男一女進行焚化，但Neil的屍體腐化異常快速，兩個醫生發現馬上就逃之夭夭，而Neil很快就變成了BT，視角也變成了BT飄盪的視角。
這時十一年前的Sam來到醫院確定Lucy的屍體，掩不住傷心的Sam跪在地上然後想把Lucy抱走，而變成BT的Neil因為執念跟了上去，就在那一瞬間觸摸到了Sam。這就是當時引發虛爆的整個原因。
當Neil的靈魂在冥灘的水裡飄盪時，他看到躺在砂地上的小路（Lou）跟爬行中的Fragile，而靈魂分離出來的Fragile抱著小路親手交給連結到的靈魂們，而小路就在蛹中長大並在Neil的守護下生存下來。如果仔細看會看到隱生蟲的成蟲天使蟲在旁飄盪，如果去查隱生蟲辭條，會發現隱生蟲化蛹之後會在蛹內待上數年甚至數十年。我想這邊的隱喻不管是用現世還是冥灘的時間來看，小路待在蛹內的時間肯定是很長的，才會長成現在Tomorrow的模樣。一路冒險過來，其實也有太多線索指向Tomorrow就是Lou。
最後麥哲倫回到現世時，Tomorrow常常抱著的隱生蟲生態罐碎裂在地上，不知為何裡面的隱生蟲也都變成天使蟲，牠們每停在一個人身上就會叫醒一個人，而最後了然於心的Tomorrow跟Sam彼此相認，Sam也拖起Tomorrow的左手看著胎記喊Lou，Tomorrow說著我們將永遠心繫彼此(We will always be connected.)，Fragile也安詳地躺在椅子上微笑而去，而Tomorrow最後說了一句I am your Louise (Lou). 結局我們終於知道為甚麼小路叫Lou了。
而最後小島也放上了引述的話，就像前作一樣:
Though the future is a product of every present that precedes it. Tomorrow does not belong to today.
雖然未來是每個先前的當下造就的產物，但明日不屬於今日。
To live is to imagine ourselves in the future. And there we inevitably arrive. Yet our place in said future may not be the one we envision.
KOBO ABE. IN SEARCH OF THE PRESENT - 安部公房 《追尋今日》
活著就是想像未來的自己，未來是我們必然到達的彼方。但是我們在所謂未來的位置，未必與我們想像的相同。
最後一幕我們可以看到澳洲大地上充滿著野生動物，還有一台台小機器人努力在曠野中奔跑運送貨物。
Tomorrow也踏上她自己的旅途，戴著Fragile脖子上的手套，看著那些有所羈絆的照片，也可以看到Rainy終於生下了孩子，而Tomorrow站在另一個板塊門前，預示著死亡擱淺3的到來。
也許拆成這樣的敘述可能無法讓沒玩過的人感受其中的精采，但死亡擱淺2的所有設計真的都像藝術品般，有很多彩蛋，有趣的道具，勢均力敵的敵人，壯麗的開放世界與角色間的羈絆，你會不自覺想弄懂每一個角色的過去，跨越橫在眼前的挑戰，這個世界就是如此迷人。而人與人的羈絆也許就是生命的意義，我是奧古，我們下次見~~
