更新於 2024/04/07發佈於 2024/04/07

- EV 藥物的開發困境

儘管EV藥物展示出巨大的應用潛力,但在臨床應用之前,仍需克服一些挑戰,包括:

a. EV 的異質性 (Heterogenecity):異質性不僅包括 EV 的大小不同,還包括它們裡面包含的成分以及表面標誌物 (Surface target) 的分佈不同,即使是來自同一來源的 EV 也可能有不同個性,除此之外,在分離 EV 時那些與 EV 一同分離出來的其他細胞結構可能降低 EV 的純度與品質,進而影響治療的有效性。

b. 製造與純化:EV的分離和純化是一大挑戰,需要高度精確的技術來確保獲得純度高、活性良好的EV。目前的分離方法如超高速離心 (Ultracentrifugation) 或層析法 (Chromatography) 等,不僅成本高昂,而且效率相對較低。

c. 濃度量化與標準化:缺乏有效的量化方法來準確測定 EV 的濃度和載荷量,以及在不同實驗室之間缺乏標準化的操作流程。

d. 安全性和毒性評估:關於EV藥物的長期安全性和可能的毒性效應,仍需進行大量的研究。尤其是當這些EV來源於異體細胞時,其免疫原性和可能引發的免疫反應皆須納入考量。

e. 載體容量:如何提高 EV 的容量,確保能夠遞送足夠量的藥物到目標組織或細胞。

f. 靶向性和遞送效率:如何提高EV藥物的靶向性和細胞內遞送效率,以確保藥物能夠精確達到疾病部位,並在目標細胞內釋放有效成分,是目前研究的另一大挑戰。

g. 對表面蛋白了解不夠:對於特定的 EV 表面蛋白組成的了解仍有限,目前只有一些通用的表面蛋白被識別出來,但是這些表面蛋白如何影響 EV 的遞送和治療效果尚不清楚。

因此在設計用於 EV 藥物時,必須全方面的考慮 EV 的表現型、分離方式、什麼方式給藥、藥動及藥效,除此之外,EV 的儲存條件和穩定性也會影響治療效果,如何避免重複的凍融循環導致的囊泡或膜損壞、囊泡碎裂、聚集等,以及在 4℃、-20℃ 和 -80℃ 不同溫度下儲存的總時間皆是需要深入研究的課題。



- AI 如何幫助 EV 藥物開發



近年來有越來越多關於生成式 AI 以及深度學習應用在藥物開發上的案例, EV 藥物也不例外,下表是三種 AI 算法類型 (監督式、半監督式及非監督式學習)與藥物開發應用的整理表格:

實際的例子有:

a. Ramos 等人利用蛋白質結構預測平台如 iTasser 和 ClusPro,發現 CD81 與 CD44 之間的相互作用,並透過轉錄組學和蛋白質組體學研究這些交互作用如何影響 EV 的功能,為精準治療提供了新見解。


b. Yuyao 等人運用深度學習演算法 AggMapNet,成功地在複雜介質中分類 EV,並以此來診斷乳腺癌,展示了 AI 在提高 EV 藥物遞送系統診斷精準度方面的潛力。

- AI 提高 EV 藥物的靶向性



EV 藥物遞送系統面臨到的其中一個挑戰是如何提高靶向性,因為 EV 能夠被幾乎所有類型的細胞和組織吸收,進而影響藥物遞送的效率。但是目前針對 EV 靶向性所進行的生物工程改良都有可能影響 EV 原生的性質,以及影響其形成的蛋白質冠 (Protein Corona) (蛋白質冠已知與 EV 在細胞中的定位相關)。

而引入 AI 能夠改善這個問題,AI 可以幫助我們建構新的靶向配體 (ligand) (就是在 EV 上表現能夠被特定細胞辨認接收的蛋白質配體),並且不會影響 EV 的表面性質,增加 EV 藥物的靶向性,AI 還能夠基於特定患者的遺傳組成、環境因素與醫療史提供最有效的治療方法,這種個人化的方法可以提高治療成效並減少不良反應,進而開發出高度定制化和個人化的治療方案。


資料來源:
Towards artificial intelligence-enabled extracellular vesicle precision drug delivery Minimal information for studies of extracellular vesicles (MISEV2023): From basic to advanced approaches
Extracellular Vesicles: New Classification and Tumor Immunosuppression


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