今天有人問我NTFS與FAT32那個好用，雖然我簡單的回答了，剛好有看到一份說明文件，我想就利用該文件簡單的說明一下好了。
FAT
大部分DOS、Windows 3.x 與Windows 95 版本都是使用FAT 檔案系統。Windows98/Me/NT/2000 與OS/2也可以使用FAT檔案系統。
FAT檔案系統的特性是使用檔案配置表(FAT) 與叢集。FAT 是整個檔案系統的核心；為了保險起見，FAT在硬碟上有副本，避免上面記錄的資料遭意外刪除或損壞。叢集是FAT系統最小的資料儲存單位，一個叢集含有固定數量的硬碟扇形磁區。FAT 會記錄哪些叢集已經使用、哪些叢集還沒使用以及檔案存放在叢集中的位置。
FAT檔案系統雖然能支援容量達2GB的硬碟或分割磁區，但最多只能有65,525個叢集。因此無論硬碟或分割磁區的大小為何，叢集內所含的扇形磁區數量必須夠多，才能讓所有可用空間都包含在65,525 個叢集中。可用空間越大，叢集的大小也必須越大。
注意：一般而言，較大的叢集浪費的空間比小叢集多。
FAT檔案系統也會使用根目錄。這個目錄能夠容納的最大項目數量有限，而且必須位於硬碟或分割磁區上的特定位置。使用FAT檔案系統的作業系統會以反斜線字元(\)表示根目錄，並且一開始就會在開機時顯示這個目錄。
根目錄會以個別目錄項目的形式儲存有關每一個子目錄與檔案的資訊。例如，檔案目錄項目會保留如檔案名稱、檔案大小、日期與時間戳記等資訊，這些資訊會指出檔案上次的變更時間、開始時的叢集數目( 特指保留檔案第一個部分的叢集)以及檔案的屬性(例如隱藏的或系統的)。
FAT32
FAT32 是可以在Windows 95 OEM Service Release 2 (4.00.950B 版)、Windows 98、Windows Me 與Windows 2000 上使用的檔案系統。但是DOS、Windows 3.x、Windows NT 3.51/4.0、較早版本的Windows 95 與OS/2 無法識別FAT32，而且無法從FAT32硬碟或分割磁區上啟動或是使用上面的檔案。
FAT32 是由FAT檔案系統改良而來，以32 位元檔案配置表項目為基礎，而不是以FAT系統使用的16 位元項目為基礎。因此，FAT32 能支援更大的硬碟或分割磁區( 最高可達2 TB)。
FAT32 檔案系統使用的叢集比FAT 檔案系統使用的小，具有重複的根記錄，而且根目錄大小不限、可以放到硬碟或分割磁區上的任意位置。
NTFS
NTFS ( 新科技檔案系統)只能在Windows NT/2000 上使用。最好避免在少於
400 MB 的硬碟上使用NTFS，因為它的系統架構非常佔空間。
NTFS 檔案系統的中央系統架構就是MFT (主要檔案表)。NTFS 會保留多份主要檔案表重要部分的副本，避免損壞發生與資料遺失。
和FAT 及FAT32 一樣，NTFS也是使用叢集儲存資料檔案；但是，NTFS 的叢集大小與磁碟或分割磁區的大小無關。叢集最小可到512 個位元組，無論分割磁區的容量是500 MB 或5 GB 都不受影響。使用較小的叢集，不僅可以減少浪費的磁碟空間數量，也可以降低檔案不連續的機率( 這種狀況是因為檔案切割成很多塊，分別存放在許多不連續的叢集中，進而造成檔案存取速度過慢)。由於NTFS能使用較小的叢集，因此在高容量硬碟上的效能非常好。
NTFS 檔案系統也支援強制修復，這項功能會自動偵測損壞的扇形磁區，並將它們標示出來，以後不再使用。
還有一個跟下載檔案比較相關的是，NTFS 檔案系統支援單一檔案大於4GB的限制，FAT32則不支援，所以當你要製作DVD光碟的映像檔的時候，你必須使用NTFS 檔案系統，否則將無法製作一個內容超過4GB的映像檔。
NTFS與FAT32檔案系統
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