馬爾他自古以來便是地中海的海運樞紐,控制了由義大利半島來往北非的航線,自然也成為各個強權爭奪的要地,先是羅馬與迦太基,中世紀的拜占庭、阿拉伯人與諾曼人,都曾經以馬爾他作為通往義大利或北非的跳板。1282年西西里晚禱事件(Sicilian Vespers)後,馬爾他隨著西西里王國(Kingdom of Sicily)一起轉入伊比利半島的亞拉岡王國(Kingdom of Aragon)治下。後又跟著亞拉岡與卡斯蒂亞王國(Kingdom of Castilla)合併成立西班牙,而西班牙王位在16世紀初被哈布斯堡家族接手,馬爾他也成為哈布斯堡家業的一部份。
當騎士團被趕出東地中海後,在歐洲一時居無定所,但鑒於土耳其海軍的威脅,神聖羅馬皇帝、哈布斯堡家族的卡爾五世(Karl V / Charles V)與教皇克雷芒七世(Clement VII)於1530年決定將騎士團安置於馬爾他,他們每年須向西西里國王繳納一隻獵鷹作為租金,再度擔負起抵禦土耳其艦隊與北非的巴巴里海盜(Barbary Corsairs)的任務。先前指揮羅德島守城的大團長菲利普.德.維利埃.德.利阿當(Philippe de Villiers de L'Isle-Adam, 1464 – 1534)回鍋繼續領導騎士團,他們也逐漸以馬爾他騎士團的名號為人所知。
土耳其當然不會坐視騎士團東山再起,於1550年代起開始對馬爾他發動多次進攻,其中最具代表性的便是1565年的馬爾他之圍(Siege of Malta)。在戰鬥中,超過3萬名土耳其官兵在名將德拉古特(Dragut / Turgut, 1485 – 1565)率領下登陸馬爾他,騎士團方面只有守軍及民兵合計6千人,由大團長讓.德.瓦萊特(Jean "Parisot" de la Valette, 1495 – 1568)指揮。
歷經三個多月的圍城,土耳其大軍遲遲無法攻破騎士團堅守的要塞,主帥德拉古特也在戰鬥中殞命,使得土耳其一方士氣低落。得知來自歐洲的增援抵達後,土耳其軍隊匆匆撤退,將勝利留給了騎士團;雙方都失去了過半的參戰人員,馬爾他首都比爾古(Birgu)幾乎被夷為平地。馬爾他之圍與6年後的勒班陀海戰(Battle of Lepanto)成為擋下土耳其勢力進入西地中海的兩場關鍵戰鬥,瓦萊特大團長與騎士團以此一戰成名,馬爾他的新首都瓦萊塔(Valetta)即得名於瓦萊特。
菲利普.德.朗維利埃.德.龐西(Phillippe de Longvilliers de Poincy, 1584 – 1660)是來自法國北部的小貴族,1604年時加入馬爾他騎士團,在地中海與土耳其艦隊交手過幾次;回到法國後又加入法國海軍,在三十年戰爭中立下功勳,於1639年獲任法屬西印度群島總督。
法國於西印度群島的殖民始於1635年,探險家皮埃爾.貝蘭.德斯南布克(Pierre Belain, sieur d'Esnambuc, 1585 – 1636)在馬丁尼克島(Martinique)建立了第一個永久殖民地,隸屬於美洲群島公司(Compagnie des Îles de l'Amérique),這間殖民公司的後台正是著名的樞機主教黎塞留公爵(Armand Jean du Plessis, Duke of Richelieu, 1585 – 1642)。
在龐西就任時,法國在加勒比海的根基仍相當薄弱,僅有馬丁尼克、瓜德羅普(Guadeloupe)兩座島嶼以及和英國共享的聖克里斯多福島(Saint-Christophe / St. Kitts),另外還有名義上擁有但仍未殖民的多米尼克島(Dominique),其餘島嶼上有英國、荷蘭與西班牙的勢力,另外還有神出鬼沒的海盜。
龐西在任內積極擴張地盤,先後在聖巴泰勒米島(Saint-Barthélemy)、聖馬丁島(Saint-Martin)、聖克羅瓦島(Sainte-Croix)等地建立據點;又在鬥爭中趕走了繼任總督德.托瓦錫(Noël Patrocle de Thoisy, ? – 1671),確立自己在法屬西印度的地位。
1660年,在加勒比呼風喚雨的龐西逝世,來自薩伏伊的騎士團成員夏爾.德.薩勒斯(Charles de Sales, 1625 – 1666)接任總督。儘管少了一個難以駕馭的人物,但騎士團在殖民事務上也遇上瓶頸,加勒比海的幾個殖民地遲遲沒有獲利,應付給法國政府的12萬金埃居也從未付清;由於法國不斷追討債務,騎士團最終決定在1665年將殖民地歸還給法國。
同年,第二次英荷戰爭爆發,法國支持荷蘭對抗英國,薩勒斯受命向聖克里斯多福的英國殖民地發動攻擊,但他卻在交戰中陣亡,副總督克羅德.德.盧.聖洛倫(Claude de Roux, chevalier de Saint-Laurent, ? – 1689)一面驅逐島上的英國人,一面將政權移交給新成立的法國西印度公司(Compagnie française des Indes occidentales),他成了最後一任騎士團的殖民地總督,也是法屬西印度群島的新一任總督。