在東京擔任廚師的明石幸次（阿部進之介 飾演）返回家鄉參加父親的葬禮。他不明白身體健康的父親怎突然過世，妹妹洋子（小西真奈美 飾演）截斷母親的話，要哥哥趕緊找工作幫忙償還債務。
第二天與修車廠有業務往來的三宅良平（田中哲司 飾演），上門要替明石和幸（渡邊裕之 飾演）上香，母親京子（室井滋 飾演）衝出來厲聲趕走三宅，還粗暴的揮落對方交給幸次的奠儀。
三宅不在意京子的態度，告訴幸次要好好處理他父親留下的爛攤子。幸次追問母親後，才知道父親因告發合作大企業內部的非法行為而被逼自殺。人雖然去世仍然要面對法律問題。幸次找來舊報紙，知道三宅企業生產的汽車零件有瑕疵，卻造假數據稱合格，父親發現問題後，基於良心不安，向媒體舉發引起軒然大波，又因種種壓力改口說是向公司要求巨額金錢不成，而做的不實指控，在將進行入司法審理前，父親竟自殺。
幸次讀完父親日記，充滿矛盾跟良心拉扯，汽車零件應該是有問題的。
他到修車廠整理時，遇到自稱一直受父親照顧的北村健一（安藤政信 飾演），他知道幸次還沒找到工作，問他願不願意跟他一起工作。
北村是家孤兒院的負責人，幸次白天在那裡幫院童做飯，晚上跟北村一夥人去偷車。過去幸次父親利用自己的技術將北村他們偷竊來的汽車拆卸零件轉賣，高級汽車則賣到中國各地。
北村聲稱自己的竊車集團所得都是守護院內孩子們的生活，而幸次父親依賴分得的金錢維持家用和修車廠的運作。
在北村這荒謬的價值觀的影響下，幸次覺得偷竊汽車沒什麼關係，手法熟練到一分鐘開鎖，三分鐘開走車，讓集團成員對他刮目相看。
三宅良平時不時來家催促賠償金，幸次越看他越不爽，心裡燃起了報仇的火焰，居然偷走三宅的房車壓成廢鐵。
院內高中生大野奈奈（清原果耶 飾演）是北村收養的女孩，有次到山區烤肉戲水溺水，北村為救她卻溺斃。孤兒院和竊車集團陷入群龍無首混亂狀態，
資深保育員友梨佳（佐津川爱美 飾演）讓幸次看奈奈的資料，原來多年前奈奈的父親潛入北村健一家行竊，被返家的北村撞見他的妻子被殺，發生扭打，盛怒的北村也刺殺竊賊。
當他知道那名竊賊留下一名幼兒，北村心裡有愧，收養了女嬰並創辦了孤兒院。近日奈奈知道了這件事，和北村產生矛盾。
三宅良平僱人跟監幸次行蹤，拍攝他們一夥竊車過程的照片，威脅幸次要收手於他，並向警察舉發竊車集團的行動，多人被捕，僥倖逃脫的幸次被惡意蒙蔽雙眼，約三宅到清空的修車廠談判，他堅決不為父親和自己的作為道歉，並痛毆三宅險致死，被逮捕後以殺人重罪起訴。
《日與夜》故事灰暗，畫面夜景居多，看了心很沉重，雖然不太明瞭編導要講的話是善與惡一線之隔，或是贖罪，或是救贖，男主角阿部進之介在監獄，看著淚流滿面的母親，不停不停說對不起，他忍住淚水，心想：當人內心在善惡境地迷失，最終自己也身陷黑暗裡。
清原果耶 相當戲劇作品：-我的事說來話長
