一開始先定義好你的需求: 你需要極高的讀取效率或是極高的寫入效率? 需求定義好之後，我們就開始今天的內容。
需要極高讀取效率請選擇MyISAM 儲存引擎;
需要極高寫入效率請選擇InnoDB 儲存引擎;
MyISAM/InnoDB原理與比較:
原理相異處:
MyISAM 儲存引擎採用了一種稱為「表層級鎖定」（Table-level Locking）的鎖定機制，這意味著對於一張表的讀取操作和寫入操作是互斥的，也就是說，當一個執行緒在寫入資料時，其他所有執行緒都不能進行任何讀寫操作。但是，在讀取數據時，MyISAM 儲存引擎可以使用「同時讀」（Concurrent Reading）的方式，多個執行緒可以同時讀取同一張表中的數據，因此 MyISAM 儲存引擎的讀取效率非常高。
InnoDB 儲存引擎採用了一種更細緻的鎖定機制，即「行層級鎖定」（Row-level Locking）。這種鎖定機制可以保證在Concurrent的情況下，每個執行緒都只鎖定自己需要的行而不是整張表，從而避免了 MyISAM 儲存引擎的寫入衝突問題。因此，InnoDB 儲存引擎在寫入資料時會比 MyISAM 儲存引擎更有效率。
結構部分:
MyISAM：每個MyISAM在磁碟上儲存成三個檔案。名列前茅的文件的名字會以表的名字開始，副檔名是文件類型。.frm檔案儲存表定義。資料檔案的副檔名為.MYD (MYData)。索引檔的副檔名是.MYI (MYIndex)。
InnoDB：基於磁碟的資源是InnoDB表空間資料檔案和它的日誌文件，InnoDB 表的大小只受限於作業系統文件的大小，一般為 2GB。
任務部分:
MyISAM類型的表格強調的是效能，其執行數度比InnoDB類型更快，但不提供交易支援。
InnoDB提供交易支援，外鍵（foreign key）等高階資料庫功能。
SELECT UPDATE,INSERT,DELETE操作部分:
MyISAM：因為鎖定寫入，天然的適合執行大量的SELECT。
InnoDB：如果要執行大量的INSERT或UPDATE，出於效能方面的考慮，應該使用InnoDB表。
DELETE FROM table時，InnoDB不會重新建立表，而是一行一行的刪除。
LOAD TABLE FROM MASTER操作對InnoDB是不起作用的，解決方法是先把InnoDB表改成MyISAM表，導入資料後再改成InnoDB表，但是對於使用的額外的InnoDB特性（例如外鍵）的表不適用。
AUTO_INCREMENT的操作部分:
MyISAM：INSERT和UPDATE作業時自動更新列。這使得AUTO_INCREMENT列更快（至少10%）。在序列頂的值被刪除之後就不能再用。 (當AUTO_INCREMENT列被定義為多列索引的最後一列，可以出現重複使用從序列頂部刪除的值的情況）。
AUTO_INCREMENT值可用ALTER TABLE或myisamch來重設。
對於AUTO_INCREMENT類型的欄位，InnoDB中必須包含只有該欄位的索引，但是在MyISAM表中，可以和其他欄位一起建立聯合索引。
InnoDB：如果為一個表指定AUTO_INCREMENT，在資料詞典裡的InnoDB表將包含一個名為自動計數器的計數器，它被用在為該列賦予新值。
自動增長計數器僅儲存在主記憶體中，而不是存在磁碟上。
表的具體行數不同部分:
MyISAM：select count() from table，MyISAM只要簡單的讀出保存好的行數，注意的是，當count()語句包含 where條件時，兩種表的操作是一樣的。
InnoDB：InnoDB 中不保存表格的具體行數，也就是說，執行select count(*) from table時，InnoDB要掃描一遍整個表來計算有多少行。
鎖不同的部分:
MyISAM：以表為鎖。
InnoDB：提供行鎖(locking on row level)，提供與Oracle 類型一致的不加鎖讀取(non-locking read in SELECTs)，另外，InnoDB表的行鎖也不是絕對的，如果在執行一個SQL語句時MySQL無法確定要掃描的範圍，InnoDB表同樣會鎖定全表，例如update table set num=1 where name like “%H%”。
MYISAM和INNODB是MariaDB提供的兩種儲存引擎。兩者的優劣可謂各有千秋。 INNODB會支援一些關聯式資料庫的高階功能，MYISAM不支援。但MYISAM的性能更優，佔用的儲存空間少。所以，選擇何種儲存引擎，視具體應用而定。
如果你的應用程式一定要使用多元或高階功能，毫無疑問你要選擇INNODB引擎。但要注意，INNODB的行級鎖定是有條件的。在where條件沒有使用主鍵時，照樣會鎖定全表。例如DELETE FROM ATable這樣的刪除語句。
如果你的應用程式對查詢效能要求較高，就要使用MYISAM了。 MYISAM索引和資料是分開的，而且其索引是壓縮的，可以更好地利用記憶體。所以它的查詢效能明顯優於INNODB。壓縮後的索引也能節省一些磁碟空間。 MYISAM擁有全文索引的功能，這可以大幅優化LIKE查詢的效率。
有人說MYISAM只能用於小型應用，其實這只是一種偏見。如果資料量比較大，這是需要透過升級架構來解決，例如分表分庫(實際上真實的檔案獨立等)，而不是單純地依賴儲存引擎。
