在選擇恆溫培養箱時，依據培養的需求，也會考慮到選擇不同的加熱方式，而選擇 直熱式 Direct Heat / Air Jacket 或 水夾層 Water Jacket 的培養箱。本文將簡單介紹兩者的加熱原理與優缺點比較，希望能作為提供在選擇培養箱時的參考。
- 直熱式培養箱 Direct Heat / Air Jacket Incubators
直熱式培養箱利用在培養箱兩側壁的周圍內配備加熱元件，這些加熱器產生熱量，直接將箱內空氣加熱至培養所需溫度。並且搭配在培養箱內的風扇，有助於熱空氣在整個培養箱中流動，使熱量均勻分布，防止箱內溫度變化。通常會搭配內門和外門，在外門內有加熱元件，能夠加熱內門，避免因開關門造成溫差。
這種加熱方式具有能夠在開關門後直接且快速地恢復溫度，產生較小的溫度波動。另外，直熱式的培養箱能夠搭配可高溫滅菌的系統。並且，相較於水夾式，不用再進行定期加水到水箱的操作。
出於安全原因，門打開時加熱功能停止。但隔熱性材料(玻璃棉)會覆蓋腔體，以減少外部溫度影響，並在滅菌過程中消除高溫傳導性。
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- 水夾層培養箱 Water Jacket Incubators
水夾層培養箱顧名思義，是利用箱室周圍的水夾層充滿水，作為蓄熱，使用水循環系統，將水溫保持在所需的溫度設定。熱量透過外部的水夾層，傳遞到培養箱內部，水溫由複雜的溫度控制系統控制，該系統可連續監測箱內的溫度，並相應地調整加熱元件或冷卻機制，以維持所需的設定點溫度。由培養箱底部的主加熱器加熱水夾內的水，熱水向上流動，冷水向下流動，在夾層內產生自然對流。同時會可能會採用pump和風扇，來使整個培養箱的溫度分佈更均勻。
水夾層培養箱更能夠保持溫度的恆定，因為培養箱壁中的熱水能為培養箱提供穩定的溫度，且使培養箱內溫度的均勻性高。水作為良好的隔熱介質，可以讓培養箱在停電時，能保溫更長時間。
然而，水夾層培養箱需要定期加水，以及更需要定時清潔消毒，且無法搭配高溫滅菌系統，污染風險較高。此外，水夾層培養箱的體積較重，移動時較不易。
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