1189年7月6日英格蘭國王亨利二世(Henry II)去世,現存最年長的兒子理察一世(Richard I)因此成為無可爭議的繼位者。當理察一世繼位之後,他首先便是命令威廉‧馬歇爾(William Marshal)前往英格蘭,釋放阿奎丹的埃蓮諾(Aliénor d’Aquitaine)。不過還不待威廉‧馬歇爾抵達,監視阿奎丹的埃蓮諾的人便已先行將之釋放。重獲自由的阿奎丹的埃蓮諾立即騎馬前往威斯敏斯特修道院,並代表英格蘭國王理察一世接受領主與主教們的效忠誓言,正式復出政壇。
理察一世繼承金雀花王朝領地之後,其首要任務便是積極響應教皇克萊門三世(Clement III)號召的第三次十字軍運動。為了保障遠征期間英格蘭國政順暢,理察一世安排伊利主教威廉‧德‧隆尚(William de Longchamp)擔任大法官,負責英格蘭國內政務,在法蘭西各地的封邑,也分別安排人選負責管理。此時阿奎丹的埃蓮諾雖然沒有正式職務,但他卻在國政上發揮實質影響力。
當理察一世率軍參與第三次十字軍運動時,阿奎丹的埃蓮諾也沒閒下來。雖說理察一世年輕時就在父親亨利二世的安排下,與法蘭西公主艾莉斯(Aélis)訂有婚約,然而由於兩國關係充滿矛盾,理察一世一直不願履行婚約,與此同時,阿奎丹的埃蓮諾為了金雀花王朝的未來,也不贊同這個婚約,因此他親自翻越庇里牛斯山,前往納瓦拉王國,與納瓦拉國王桑喬六世(Sancho VI)商議,為理察一世與桑喬六世之女納瓦拉的貝倫加麗亞(Berengaria)訂立婚約。隨後阿奎丹的埃蓮諾便在隆冬之時,帶著納瓦拉的貝倫加麗亞穿越阿爾卑斯山與義大利,趕往墨西拿與理察一世會合。理察一世隨後便向法蘭西國王菲利普二世‧奧古斯都(Philippe II Auguste)攤牌,表明他寧可拋棄與卡佩王室的婚約,也要與納瓦拉的貝倫加麗亞成親的意思。
由於當時正值四旬齋期,婚禮無法立即舉行。阿奎丹的埃蓮諾無法長期不在國內,因此無法留下來等待婚禮的舉辦,便將未來的媳婦貝倫加麗亞託付給女兒瓊安(Joan)照顧,隨後便於4月2日先行離開墨西拿。阿奎丹的埃蓮諾返國後,理察一世等人也離開西西里,繼續踏上前往利凡特的道路,之後理察一世與貝倫加麗亞便在1191年5月12日於賽普勒斯島的利馬索爾舉行婚禮。
在阿奎丹的埃蓮諾返國途中,他在路過羅馬時,向教皇為其丈夫的私生子若弗魯瓦(Geoffrey)爭取成為約克大主教的機會。由於若弗魯瓦雖是亨利二世的私生子,卻是所有兒子當中最為年長的,且他一直追隨在其父身邊,並積極參與金雀花王朝事務,雖若弗魯瓦早早便成為候任主教,卻一直拒絕成為教士,顯然若弗魯瓦並不打算放棄他的世俗權力。阿奎丹的埃蓮諾為了鞏固其子的地位,徹底斷絕若弗魯瓦的潛在威脅,因此特意向教皇求得特許,並迫使若弗魯瓦放棄政治上的訴求。
返回國內後,阿奎丹的埃蓮諾便留在諾曼第公國過冬,但由於他的幼子約翰利用英格蘭貴族對大法官威廉‧德‧隆尚的不滿,打算趁機推翻理察一世的統治,於是阿奎丹的埃蓮諾立即返回英格蘭調解,一方面接受貴族們的意見,將不孚人望的威廉‧德‧隆尚撤職,另以盧昂大主教沃爾特‧德‧庫坦斯(Walter de Coutances)接替,以挫敗約翰接掌攝政的陰謀。經過阿奎丹的埃蓮諾的積極介入,約翰的野心便暫且遭到挫敗。沃爾特‧德‧庫坦斯接掌攝政之後,阿奎丹的埃蓮諾對英格蘭事務的影響力也進一步提高。
然而隨著英格蘭國王理察一世在返國途中為奧地利公爵利奧波德五世(Leopold V)俘虜,之後又將他轉賣神聖羅馬帝國皇帝亨利希六世(Heinrich VI)。得知愛子被囚的阿奎丹的埃蓮諾對此感到憤怒,因此就此事向教皇未能善盡保護十字軍戰士之責感到不滿,於是阿奎丹的埃蓮諾致信教皇,請求他給予援助,並嚴厲斥責教皇怠忽職守。與此同時,阿奎丹的埃蓮諾也為營救理察一世而積極奔走。
與此同時,阿奎丹的埃蓮諾的幼子約翰見兄長理察一世被囚於德意志,認為這是奪權的天賜良機,於是他在1193年3月暗中與法蘭西國王菲利普二世‧奧古斯都勾結,試圖將諾曼第公國要邑維辛(Vexin)割讓給菲利普二世‧奧古斯都,以換取來自法蘭西的支持。阿奎丹的埃蓮諾聞訊立即在溫莎召集所有盎格魯-諾曼貴族一起反對約翰,使約翰的陰謀暫且受挫。
為了救出愛子,阿奎丹的埃蓮諾不斷與神聖羅馬帝國皇帝亨利希六世交涉,最中議定以相當於英格蘭王國兩年的收入的15萬銀馬克作為贖金。如此天價般地巨額贖金並未難倒阿奎丹的埃蓮諾,阿奎丹的埃蓮諾旋即積極籌措贖金,並於1193-1194年的冬季,帶著籌集到的頭期款親自將其帶到美因茨交給神聖羅馬帝國皇帝亨利希六世,並將理察一世帶回英格蘭王國。
英格蘭國王理察一世返國後,立即著手處理謀叛的約翰,約翰自知不是兄長的對手,很快便於1194年向其屈服,理察一世也隨即寬宥約翰。在兒子們和解之後,年事已高的阿奎丹的埃蓮諾便退隱至豐特夫羅修道院,開始在修道院中過著宗教生活。
不過,當其得知愛子英格蘭國王理察一世於圍攻沙呂城堡,意外為弩箭射傷後,阿奎丹的埃蓮諾便趕忙離開豐特夫羅修道院,前往前線看望愛子。理察一世隨後因為醫療處治不當,引發壞疽,最終死於阿奎丹的埃蓮諾懷中。理察一世的死亡,迫使阿奎丹的埃蓮諾重出江湖,在隨後的王位之爭中,阿奎丹的埃蓮諾站到了他最後一個兒子約翰的這一邊。
由於阿奎丹的埃蓮諾的威望與能力,約翰在繼位之初便對其十分倚重,阿奎丹的埃蓮諾也因此步入其權力顛峰。此時阿奎丹的埃蓮諾雖已75歲高齡,但他仍精力旺盛地處理國政。當其孫子布列塔尼公爵阿爾蒂爾一世(Arthur I)入侵安茹伯國後,阿奎丹的埃蓮諾便在梅卡迪耶(Mercadier)等傭兵的護送下,前往安茹伯國各地展開盛大的巡遊,以安定人心。接著他又在1199年4月底至6月中旬,前往阿奎丹公國,一方面安撫人心,同時也對此起彼落的叛亂加以鎮壓。
之後,阿奎丹的埃蓮諾於7月15-20日返回都蘭伯國,並在此以巧妙的方式,就都蘭伯國向法蘭西國王菲利普二世‧奧古斯都行臣服禮。阿奎丹的埃蓮諾以這一系列手段,阻止阿爾特爾一世的王位聲索。在完成這一系列行動之後,阿奎丹的埃蓮諾隨即將其所領有的土地全部移交給約翰,約翰因此成為阿奎丹的埃蓮諾的附傭。約翰透過阿奎丹的埃蓮諾的這番運作,成為法蘭西國王附庸的附庸,因此擺脫了對法蘭西國王直接稱臣的必要。
出於進一步鞏固約翰的地位,阿奎丹的埃蓮諾於7月30日,與約翰讓一起在魯昂開始與菲利普二世‧奧古斯都展開和談。9月,阿奎丹的埃蓮諾將身懷六甲的女兒瓊安接到魯昂待產,遺憾的是瓊安不幸在分娩時去世。
1199年聖誕節後不久,菲利普二世‧奧古斯都與約翰舉行和談,為使雙方建立穩固的和平關係,因此議定菲利普二世‧奧古斯都之子路易八世(Louis VIII)將迎娶約翰二姊卡斯提爾王后埃蓮諾的其中一位女兒。為此,年事已高的阿奎丹的埃蓮諾毫不猶豫,立即在隆冬時翻越庇里牛斯山,前往卡斯提爾王國,為路易八世挑選妻子。不過阿奎丹的埃蓮諾才剛離開普瓦捷,就在通過與亨利二世有宿怨的于格九世‧德‧呂濟尼昂(Hugues IX de Lusignan)的領地時,遭到他的伏擊而被俘虜。阿奎丹的埃蓮諾被迫答應于格九世‧德‧呂濟尼昂要求割讓拉馬什伯國的條件後,才重獲自由,繼續他的旅程,最終他於1200年1月抵達卡斯提爾王國。
這時卡斯提爾國王阿方索八世(Alfonso VIII)與埃蓮諾還有烏拉卡(Urraca)和布蘭什(Blanche)兩個女兒尚待字閨中,阿奎丹的埃蓮諾仔細觀察兩位外孫女後,決定選擇了年紀較小、性格更像自己的布蘭什做為路易八世的妻子。經過2個月的停留後,阿奎丹的埃蓮諾便於3月帶著布蘭什返回阿奎丹公國。他們一行人在復活節前幾天(4月9日)抵達波爾多。傭兵隊長梅卡迪耶(Mercadier)特意前來參與復活節慶典,並打算親自護送阿奎丹的埃蓮諾與布蘭什北上。不過就在復活節的次日,梅卡迪耶卻遭到另一名傭兵隊長布蘭丁(Brandin)的重裝軍士謀殺。年邁的阿奎丹的埃蓮諾經過這場悲劇之後,身心益發疲憊,在帶著布蘭什騎馬前往羅亞爾河谷之後,阿奎丹的埃蓮諾的身體狀況已然不佳,因此他將布蘭什交給波爾多大主教護送後,身心俱疲的埃蓮諾便前往豐特夫羅修道院休養,約翰聞訊後曾前往探視。
1201年,約翰與菲利普二世再次交戰,身體狀況已有好轉的埃蓮諾隨即離開豐特夫羅修道院,前往普瓦捷坐鎮,以支持兒子約翰,並防止孫子布列塔尼公爵阿爾蒂爾一世(Arthur I)趁機奪取普瓦捷。1202年7月,菲利普二世宣布奪取約翰在法蘭西王國境內的所有封邑,並支持布列塔尼公爵阿爾蒂爾一世率軍奪取金雀花王朝領地。阿爾蒂爾一世為了獲得英格蘭國王寶座,決心擊敗叔叔約翰背後最大的支持者──祖母阿奎丹的埃蓮諾,於是決心突襲埃蓮諾所在、缺乏重兵保護的豐特夫羅修道院。阿奎丹的埃蓮諾預判孫子阿爾蒂爾一世的意圖,早一步離開豐特夫羅修道院,打算前往普瓦捷,但由於道路受阻,於是只能先行退避至米雷波城堡。阿爾蒂爾一世立即發兵進圍米雷波城堡,試圖在約翰介入之前俘獲埃蓮諾。然而,令阿爾蒂爾一世感到意外的是,他那向來寡斷不決的叔叔約翰一聽到母親被圍的消息,竟然迅即發兵南下解圍。未及設備的阿爾蒂爾一世很快便遭到擊敗,並遭到俘虜。
阿爾蒂爾一世遭到擊敗後,已經80歲高齡的阿奎丹的埃蓮諾再次隱退至豐特夫羅修道院,這次他正式出家,成為修女,自此退出政治舞台。最終阿奎丹的埃蓮諾在1204年4月1日去世於豐特夫羅修道院,隨後他便被安葬在豐特夫羅修道院,永遠安眠於其第二任丈夫亨利二世及其愛子理察一世身旁。