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SARS病毒增益實驗
2010年6月22日,石正麗和其他人發表了一篇論文,報告了如何使用活性馬蹄蝙蝠病毒和一種基於艾滋病病毒的偽病毒來增強薩斯冠狀病毒SARS-CoV對人類的傳染性的額外實驗。構建了帶有SARS病毒BJ01-S的HIV偽病毒——HIV/BJ01-S
即用該合成的偽病毒和SARS病毒檢查不同蝙蝠ACE2對人類SARS-COV刺突S蛋白敏感性。通過改變蝙蝠ACE2幾個氨基酸測試其對S蛋白的結合性。
RaTG13病毒株
2012年4月,在中國雲南省墨江縣,六名礦工在清理礦井中的蝙蝠糞便後出現了類似新冠病毒(COVID-19)的症狀,其中三人死亡。後來石正麗團隊從該礦中分離出了名為「RaTG13」的病毒,並將其送到了武漢病毒學研究所。直到今天,RaTG13仍然是已知的與Covid-19病原體最近的親戚。
2014年5月,由石正麗指導的武漢病毒學研究所的一篇論文提到了墨江礦工事件,指出「三名礦工死於肺炎」。這篇論文承認,石正麗及其團隊「調查了這個洞穴裡蝙蝠攜帶的病毒」,並得出結論,「這六名礦工很可能感染了蝙蝠攜帶的病原體。」這篇論文也是首次提到了被稱為新冠病毒的近親的RaBtCoV/4991病毒。
2016年2月18日,石正麗在一份中國期刊上發表了一篇文章,這是她第一次親口承認自己從墨江的一個廢棄礦井中獲得了多種冠狀病毒,包括新的類似薩斯的毒株。她沒有提到礦工們,是他們的神祕患病和死亡把她帶到了洞穴。在這篇文章中石正麗承認她從墨江礦區獲得了一種名為RaBtCoV/4991的病毒。後來她在2020年2月初將該病毒重新命名為RaTG13,當時新冠病毒(COVID-19)大流行剛剛開始出現。
2020年2月3日,石正麗和她的合作者在一篇新文章中指出,武漢病毒學研究所的科學家找到了與新冠病毒(COVID-19)非常匹配的病毒。後來才發現,石正麗所說的病毒實際上就是2012年從墨江礦區提取的病毒RaBtCoV/4991。
2020年2月5日,武漢大學的研究人員在《新出現的微生物與感染》雜誌上發表的一篇文章中說他們在一個名為RaBtCoV/4991的中國資料庫中發現了新冠病毒(COVID-19)的一個近親。後來了解到,這正是石正麗兩天前於2020年2月3日改名為RaTG13的病毒。奧地利因斯布魯克大學的生物工程師羅薩娜•塞戈列多指出RaBtCoV/4991病毒在石正麗那裡保存了七年,是一個精確匹配新冠病毒(COVID-19)最近的親戚。石正麗在2020年2月3日發表的論文中將病毒重命名為RaTG13,掩蓋了病毒的來源。石正麗為2020年2月3日發表的一篇文章發表了一份附錄,承認2012年至2015年採集的蝙蝠樣本實際上來自墨江礦區。她還承認,在2020年2月3日的論文中,她將與新冠病毒(COVID-19)接近的親戚RaBtCoV/4991。整體相似度96.2%
2020年11月17日,石正麗為2020年2月3日發表的一篇文章發表了一份附錄,承認2012年至2015年採集的蝙蝠樣本實際上來自墨江礦區。她還承認,在2020年2月3日的論文中,她將與新冠病毒(COVID-19)接近的親戚RaBtCoV/4991更名為RaTG13。
COVID-19與RATG13共享三個序列,位於此圖蛋白的n末端,GTNGTKR \NNKSWM \RSYLTDGD
WIV1及WIV16病毒株
2013年10月30日,石正麗等其他人合作發表了一項由NIAID資助的研究結果,宣布首次從馬蹄蝠糞便樣本中成功分離出活性冠狀病毒。石正麗的團隊將該病毒命名為SL-COV-WIV1,隨後又分離出SL-COV-WIV16。
WIV1病毒株可以使用人體的ACE2進入受體,並感染人類細胞。
WIV16病毒株可使用人體ACE2進入人體,並可感染人造人類細胞。
即將SL-COV從非ACE2結合轉化為ACE2結合的最小插入區(氨基酸310-518)。天然蝙蝠病毒無法利用人類ACE2使人體感染,但當插入蝙蝠COV病毒的S蛋白序列中位310-518氨基酸時,該嵌合的蝙蝠病毒就可以使用人類的ACE2受體。
冠狀病毒的S蛋白上的5個氨基酸位點對SARS病毒與人體ACE2結合至關重要,分別為
Y442 L472 N479 D480 T487,位於310-518區間內。
2018年權威機構得出結論,蝙蝠病毒無法不通過中間宿主,通過使用人類ACE2直接感染人類。
改造後的HKU4病毒株
2015年,武漢病毒所對HKU4病毒的S蛋白中引入兩個突發基因,突變的S蛋白可幫助該病毒進入人體。(HKU4本身不進入人體)同時發現,MERS的S蛋白雞蛋納入突變基因後將無法進入人體。
帶有S蛋白的實驗室工程病毒
2015年,對SHC014病毒改造產生嵌套病毒。利用老鼠的骨架合成了SHC014蛋白,形成了適應老鼠的SARS-COV病毒————SHC014-MA15嵌套病毒(帶有S蛋白的實驗室工程病毒)。該病毒可結合人體ACE2進入人體,亦可造成老鼠死亡。並得出現有SARS病毒不能保護自身不受SHC014-MA15感染。
RsSHC014及Rs3367病毒株均在2013年分離出。其中RS3367與WIV1一致性為99.9%
2015年11月12日,一篇發表在《自然》雜誌上的文章特別警告:武漢病毒學研究所進行的蝙蝠冠狀病毒實驗可能有導致大流行的風險。羅格斯大學生物學家理查德•艾布萊特告訴《自然》雜誌,「這項工作的唯一影響是在實驗室中創造了一種新的非自然風險。」
SARS病毒近期發現
2018年,發現人類近期SARS病毒是雲南一個蝙蝠山洞中三個病毒株重組而來,WIV1/RS4231/RS4081
2018年3月2日,石正麗等人在一份中國雜誌上發表了一篇文章稱,「結果表明,一些SARSr-CoV可能具有很高的感染人類細胞的潛力,而不需要中間宿主。然而,迄今尚未發現SARSr-CoV從蝙蝠直接傳播給人類的證據。」他們的論文沒有提到武漢病毒學研究所一直在實驗室中進行實驗,以確定其中一種病毒是否可以「感染人類細胞」。
2018年3月27日,生態態健康聯盟的一項資助申請《消除蝙蝠傳播冠狀病毒的威脅》提議通過基因工程把「人類特有的」弗林蛋白酶裂解位點改造成蝙蝠冠狀病毒。後來證明,對新冠病毒(COVID-19)來說,弗林蛋白酶裂解位點是病毒致病的關鍵。
病毒爆發後的各方態度
2019年3月31日,臺灣向世界衛生組織發出警告,指出這種新疾病可以在人與人之間傳染。這一警告未能與其它國家分享。臺灣也開始監控所有來自武漢的入境旅客。
2020年1月30日,世衛組織宣布冠狀病毒爆發為全球公共衛生緊急事件。世衛組織總幹事特沃德羅斯•阿達諾姆•蓋佈雷耶蘇斯(中文名:譚德塞)說,「中國發現爆發疫情、分離病毒、測序基因組,並與世衛組織和全世界分享的速度令人印象深刻。」
2021年3月30日,世衛組織發布《世衛組織召集全球SARS-CoV-2溯源研究:中國部分》報告。實驗室事故被認為是「極不可能」發生的。譚德塞同時表示,他認為世衛組織的評估還不夠全面。
2021年6月4日,福奇承認,該病毒可能來自武漢病毒學研究所的實驗室泄漏。
2021年8月27日,美國國家情報總監公開了情報部門對新冠病毒(COVID-19)起源的評估摘要。該報告沒有得出結論,認為「自然接觸受感染動物和與實驗室相關的事件」兩者都是可信的。