【第一篇：AGGRESSOR】
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U.C.0079年，吉翁公國以殖民地自主權的名義發動獨立戰爭，這場戰爭從最初預計一週內能拿下勝利的「不列顛作戰」，到後續失敗演變成長期戰爭，並且整整打了一年，史稱「一年戰爭」。
而在這場戰爭中，各自投入地球聯邦軍與吉翁公國軍的士兵們，並不是清清楚楚的分成地球人與宇宙之民，在這當中有許多持相反身份，卻站在對方陣營的人們，他們因為各自的原因而選擇投靠異地，而本作便是其中一支聯邦軍部隊的故事......
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在當時，地球聯邦軍內有一支戰時成立的特別部隊「侵略者部隊(アグレッサー部隊)」，該部隊的成員全是從吉翁公國倒戈的逃兵以及從吉翁公國非法入境的居民組成，因為吉翁軍對聯邦軍來說是「侵略者」，因此才以這個略帶鄙視的名稱來命名。
聯邦軍高層之所以將他們聚集在一起成立部隊，是為了方便監視，同時送他們到最前線面臨危險的戰鬥，也是刻意為之，這些人有如此特殊的身分，在其他正規聯邦軍眼中不僅受到鄙視，連在戰場上遇到吉翁軍也是被敵方唾棄，侵略者部隊就在這樣裡外不是人的戰場，執行一次又一次的任務。
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U.C.0079年11月，在南美洲某處荒野上，侵略者部隊正與吉翁軍交戰著，隸屬該部隊的主角「蔡斯•史卡爾加特」，駕駛一架聯邦軍的實驗機體RX-80RR(紅騎士)與吉翁軍的古夫展開交戰。
在你來我往之中，後方潛伏於沙中的薩克突然偷襲，但一瞬間傳來無數砲擊擊中了薩克，原來是同隊的戰車隊隊長「海恩茲•海威」軍曹，他率領的61式戰車隊成功破解埋伏，結束了這次的任務。
這支前吉翁軍士兵組成的聯邦小隊，在過去因緣際會下曾拯救了來自「賈布羅」的「香織•佐野」少尉，佐野本來是負責RX-80RR(紅騎士)試驗運用的部隊，但在先前輸送過程遭到吉翁軍精銳部隊偷襲導致所有測試駕駛全都戰死，最後在侵略者部隊支援下才救了佐野一命，因此佐野作為該項測試的執行官，決定在回到賈布羅之前讓侵略者部隊使用RX-80RR(紅騎士)作戰，同時也能繼續收集實戰數據。
而故事的開頭就這樣展開了......
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侵略者部隊是由一位叫做「道格拉斯•特蘭伯爾」的中隊長管轄，道格拉斯是一位正統聯邦軍，所以非常厭惡身為前吉翁身分的侵略者部隊們，只要一有機會就想找他們麻煩，但只要事情結果能有助於他升官，卻又會獨攬所有戰功，是一個非常狡猾的人。
除了道格拉斯以外，同中隊底下的其他聯邦部隊也非常討厭侵略者部隊，劇中更以03戰車中隊為代表，描述兩方人馬在軍中關係非常差，甚至有打群架的狀況。
而在一次晚餐的爭吵中，兩方人馬大打出手時，部隊駐紮地忽然遭到攻擊，是先前與他們戰鬥並逃走的古夫駕駛員「達格」，他這次率領了支援部隊發動夜襲。
不過這場襲擊很快就在蔡司與海恩茲的合作下結束，達格再度撤退。
但也因為這次襲擊事件，讓那些本來就看不慣侵略者部隊的其他聯邦軍，開始無憑無據想要誣賴他們，認為是他們洩漏了中隊的情報，導致雙方對立的關係更加升溫。
不久後，侵略者部隊終於找到洩漏情報的人，但對方不是士兵，而是一位居住在當地的婦人，她因為女兒被吉翁軍抓作人質，不得以的情況下才唯命是從。
蔡司等人為了救出人質，開始擬定了作戰。
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根據婦人的情報，蔡司等人來到小鎮一處房子，海恩茲與其他成員埋伏在房子四周進行狙擊，蔡司則是喬裝成居民登門拜訪。
本來打算如此潛入救出小孩，但先前聽聞計畫而擅自行動的道格拉斯中隊長，指派03中隊以61式戰車闖入了交涉，驚動了敵方。
但好在海恩茲等人狙擊以及蔡司的緊急突入，最終仍成功救出小女孩，不過對方也因此逃走。
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逃走的吉翁軍士兵名叫「布里克」，他回到小隊藏匿地後，打算趁那些聯邦軍中隊與侵略者部隊合流前，率先殲滅中隊的那些61式戰車，於是布里克率領MS-09B(德姆)小隊，開始襲擊03中隊。
此時，留在小鎮附近山丘維修紅騎士的蔡司與技術主任「艾爾莎」，發現03中隊正遭到敵襲開始撤退到小鎮，同時先前撤退的達格也率領一批馬傑拉戰車隊，準備從城鎮後方包圍他們。
在無法與海恩茲本隊取得聯繫的狀況下，蔡司為了阻止小鎮成為戰場，丟下艾爾莎後，駕駛尚未調整完成的紅騎士衝向達格的戰車隊發動攻擊。
