相信日劇迷都會認識知名製作人「秋元康」，他擅長撰寫天馬行空懸疑故事，劇作經常虎頭蛇尾，被觀眾謔稱為「爛尾王」。當知道他有新作品《巧克力醫生》，好奇瀏覽新聞，被宣傳海報深深吸引。這個美麗小女孩是誰？配搭高挑的坂口健太郎，單是有趣的身高差已萌爆。
***註：之前錯誤以為秋元康是編劇，渡邊雄介才是編劇，秋元康只是企劃加提案人。
小唯，出生醫學世家，父親寺島光一（山本耕史 飾演）是知名外科教授，野田哲也（坂口健太郎 飾演）研究院指導教授；母親寺島葵（安達祐實 飾演）是遺傳基因專家，研究成就驕人。
小唯醉心研究人體解剖學，甚至拿起手術刀開始為模型公仔動刀。父親不但沒阻止，更悉心教導她，不足八歲，實力有如外科醫生。
兩年前，一個晚上，寺島家正在開晚宴，突然煤氣爆炸，小唯父母當場死亡，哲也右手嚴重受傷，幸好小唯只是昏倒，被哲也救出屋外。哲也覺得爆炸並非意外，帶著小唯逃至森林，哲也右手傷處出現敗血症，忍痛請小唯動割斷手術，二人從此失去蹤影。
不久，新加坡傳出秘聞，〝醫療界有位班克西（藝術家）般人物，可以成功完成任何手術的天才外科醫生～「巧克力醫生」。〞傳言聲稱，〝要請這位「密醫」出馬，就要準備一億日元、簽署保密協議，還有附上好吃的巧克力。〞眾人不曉得「巧克力醫生」本尊究竟是誰，只有人看過他的右手裝有義肢。
鏡頭一轉，哲也和小唯坐在飛往日本的航班上，忽然聽到廣播表示機長失去意識，空服員尋求醫生幫忙。小唯催促哲也去瞭解狀況，過程被新聞記者奧泉渚（西野七瀨 飾演）看到，懷疑哲也就是自己尋找多時的「巧克力醫生」，自此泉渚對哲也展開調查，查實在機長室動手術的人是小唯。
哲也，被小唯稱為「Teacher」，是「巧克力醫生」的代理人；同時馬不停蹄為小唯尋找殺害雙親的兇手，替她報仇。二人回到日本後，哲也用銀彈政策吸引技術一流的醫療菁英組成「Chocolate Company」為日後進行「密醫」手術。成員包括：（小唯按他們的喜好或特徵取綽號）
臨床工學技師銀原明日香「綽號：Gilbert」（葵若菜 飾演）
手術護理師阿達瑞穗「綽號：足湯」（鈴木紗理奈 飾演）
放射線技師落合瞬「綽號：搞笑藝人」（前田旺志郎 飾演）
臨床檢查技師 David幸太郎「綽號：出川」（古川雄大 飾演）
麻醉科醫師座間味和直「綽號：餘額」（小澤征悅 飾演）
首席護理師宇野靜香「綽號：鰻魚」（齊藤由貴 飾）
身體甚麼部位生病，只要請到「巧克力醫生」動手術都能死裡逃生，這類超現實醫療故事，情節誇張卻充滿濃厚人情味，追看的觀眾想必早已不計較劇情的合理性吧！看到小唯煞有介事做手術，及對成人質疑她年紀時，板著臉反駁〝年齡只是一個數字〞的戲碼，必定會心微笑。
劇集每個單元故事，主人翁的病況均千奇百怪，但只要「Chocolate Company」出馬，哪管是在馬路邊、升降機或病人住所，甚至在槍擊戰中，「巧克力醫生」都能動手術，而且定必成功。
不得不佩服編劇「秋元康」的創意，把嚴肅的醫療劇變得充滿娛樂性又不失溫情；況且今回總算沒有爛尾，是首尾呼應的happy ending。
不但病人有各自故事要請「密醫」救命，「Chocolate Company」成員亦深藏自己暗黑難過的際遇，才會為錢非法行醫，情節同樣感人療癒，跟「秋元康」以往的懸疑劇特質類近。
小唯父母懸案跟一個綽號「覺者」的人有關，是「覺者」在網絡出文誣陷寺島家的醫學研究違反人類道德，引來一批極端違道之士憎恨寺島家，進而殺害寺島家。
設定算是劇集最懸疑處，故事穿插不少哲也與奧泉渚記者追查「覺者」是誰的戲碼，結局舖排有點似推理小說，最後都能拆解清楚。
白山乃愛不但長得漂亮可愛，擁有一雙明亮會笑的眼睛，還具大將氣派，難怪得獎不久便能在黃金檔當主角，以眾星拱月姿態，為她度身訂造「巧克力醫生」一角。她也不負眾望，表現出眾，尤其跟坂口健太郎做對手戲時，流露真摯的亦師亦兄感情，令觀眾留下深刻印象。
