申時行的身世之謎
關於申時行的出身問題，錯誤資訊實在太多了，網路上的搜尋結果幾乎全軍覆沒，於是整理一下看過的資料，寫點比較詳盡的辨偽，非專業，如有錯誤請見諒。
《玉蜻蜓》的尼姑私生子說當然不對，流傳較廣的申時行本人被舅父蘇州知府徐尚珍收養也非事實，最接近真相的申時行祖父申乾被徐州富商徐朴收養的說法，若詳細閱讀相關資料，也幾乎可以確定純屬穿鑿附會。（不過申時行與徐樸確實關係密切，後文會提到）
申時行的祖父
申時行的出身，根據他自己在〈申氏宗譜序〉所附家傳與《申氏世譜》中記載，他的曾祖父名叫申周（妻子徐氏），祖父名叫申乾，字易卿，號東城，是申周次子，少時過繼徐姓舅父「怡竹翁」撫養，因此改姓徐。
怡竹翁家境富裕，坐擁諸多僮僕，並且仍靠著經商持續拓展家業。申乾替養父承擔沈重的徭役（當時江南許多人家招贅婿、收養子的主要目的並非傳宗接代，而是替自己家族承擔徭役，申乾很可能便屬於此類），怡竹翁晚年有了自己的孩子，因為年齡較小，申乾仍然替徐家管理財產。
怡竹翁曾願意將家產半數分給申乾繼承，然而徐家是世襲匠戶，不得脫籍，也不得自行分家，得負擔繁重勞役（至嘉靖年間才逐漸改為繳交銀兩），且遷徙不自由，入贅或過繼者，日後也不得改復原姓，一但編入匠戶，限制較民籍多且麻煩。從家傳「常領重役徭使縣中」一句可知，徐家應當是輪班匠戶，而若接受了徐家家產，意味著子孫後代可能無法脫離匠籍身份，申乾於是脫離徐家獨立為編氓（編入戶籍的普通平民），但仍徐家替徐家管理產業。
此處令人困惑的是，明代匠籍從制度上來說是無法更改的，但申乾為什麼能登記為普通民籍？
較為可能的解釋是，申乾本生家庭貧困，出生時便沒有登記戶籍，後來為舅父收養時，也沒有正式錄入徐家戶籍，才能以民籍身份自立門戶。從徐家對待申乾的方式來看，與其說是養子，實際上較類似於半個長工/管家，很可能顧慮到未來會有親生孩子，為避免繼承問題，而沒有給外甥正式戶籍。
明代中晚期由於官府在造黃冊（即大規模戶口普查與造冊登記）一事上因循懈怠，因天災家貧脫落戶籍的狀況層出不，王世貞曾言：「居官者每以弊端從積，不易清查，委之吏書，蠶政多矣。 」，晚明戲曲家徐復祚的《花當閣叢談》中亦曾提及當時江南戶口狀況：「淮以北，土無定畝，以一望為頃，故每多欺隱田糧。江以南，戶無實丁，以系產為戶，故多脫漏戶丁。」申乾確實可能因為家貧無系產，在自立門戶前都以黑戶的身份生活，而沒有被查出。
不過以上內容純屬個人推測，對戶籍制度沒有特別深入瞭解，或許存在有其他能更改的手段。
申時行與徐朴家族
怡竹翁的怡竹是徐舅父的號，本名沒有找到，但顯然不會是網路流傳的蘇州鉅富徐朴（徐泰時、徐申的曾祖父，紫芝園、留園、拙政園等蘇州名園多為其家族建造或持有），原因大致有三：
其一，申時行在賜閒堂集中，曾多次替徐朴後人撰寫墓誌銘，其中替徐樸孫子徐封所寫的〈太學生徐翁夫婦合葬墓誌銘〉一文中，提到徐樸使用的稱呼是「尋樂翁」而非「怡竹翁」。
其二，匠戶身份世襲不得更改，但徐朴的孫子，嘉靖二十年進士徐履祥的登科錄資料是民籍，與怡竹翁的匠籍不符。
其三，據《申氏世譜》記載，申乾出生於弘治庚戌年（1490年），而徐樸的長孫徐封出生於弘治癸亥年（1503年），也就是說申乾13歲時，徐樸都有孫子了，與家傳所述「（怡竹）翁晩而舉子，弱不任事」的情形明顯不符。
綜上所述，雖然申乾的舅舅兼養父怡竹翁與徐朴都姓徐，但不是同一個人。
然而申時行和徐樸家有沒有關係呢？
有，據他自己所述：「余諸生時，則授經徐符卿家塾，而與其群從游處，因以識墨川翁（即徐樸孫子徐封）。」徐符卿便是徐樸之孫徐履祥，留園（東園）建造者徐泰時的父親，後來官至尚寶司卿，故稱符卿。申時行通過院試入學為諸生後，曾到徐履祥的家塾中教書，徐泰時（三錫）、徐申（本名徐申錫，野獲編：「去太倉之嫌名，附吳縣之同姓」的那位。）等「錫」字輩的徐家子弟，大約都是他的私塾學生，兩人日後分別成為申時行主考、副考的萬曆8年、萬曆5年進士，又成為正經的座師與學生的關係。
徐樸家族在申時行年輕時就已是蘇州富豪，據徐樸五世孫徐樹丕回憶：「余家世居閶關外之下塘，甲第連雲，大抵皆徐氏有也。」《吳門表隱》亦稱徐氏富甲三吳，閶門下塘的江西會館、陶家池、花埠、十房莊、六房莊、桃花墩等，「皆明尚寶徐履祥宅」，申時行曾感嘆在徐家教書時欣賞到的園林景致：「所構園池水石之勝，為吳中甲乙，余因得寓目焉。則嘆以為熈洽之世，㒺疏民樂，雖閭巷布衣，猶得比於封君湯沐之奉，嬉遊俛仰，蒙故業而安，葢俗化之殷阜若此。」（白話文就是沒想到平民百姓家庭能有錢成這樣，和劉姥姥進大觀園的感想差不多）
由這段師生關係，申時行和徐朴家族的關係一直很好，致仕後經常到徐家產業參訪遊覽（詳見賜閒堂集所有徐氏館、徐氏園、紫芝園等標題開頭的詩），修築適適圃亦可能多少受到熱愛園林的徐家人影響，其堂侄申用明娶了徐朴曾孫徐永錫的女兒，但他和徐樸家族確實沒有直接的血緣關係。
下圖為下塘徐氏世系圖，附上《賜閒堂集》中瑤泉為徐家人寫過的墓誌銘整理，有興趣可以參閱原文：
〈贈通議大夫應天府府尹徐公墓碣銘〉：徐履祥
〈光祿寺大官署署丞徐君墓誌銘〉：徐履中
〈太學生徐翁夫婦合葬墓誌銘〉：徐封
〈徐母蔣孺人墓誌銘〉：徐履祥側室，徐時錫母
〈鴻臚寺序班徐君曁配胡碩人合葬墓誌銘〉：徐佳
〈家傳〉原文
祖乾，字易卿，號東城，累贈特進、光祿大夫、左柱國、少師兼太子太師、吏部尚書、中極殿大學士。配陸氏，累贈一品夫人。繼配嚴氏，生二子：長士章，次士毅，具陸出。東城府君少時，育於外兄怡竹徐翁所，遂以為子，從其姓。翁素饒於貲，家僮數輩，轉逐鿄楚間，益拓其業。然常領重役徭使縣中，及長鄉賦。
府君旣長，則代翁為家督，公私嚴辦，靡不當翁指。是時吳俗簡樸，府君婚時，猶以平定巾白鞾成禮，以故終身不尚華靡，以節儉訓子孫。翁晩而舉子，弱不任事，事皆決於府君。翁故匠籍，念欲析箸予府君半產，可數萬金。府君私念：「吾受匠產而遺子孫憂，是為重利使也。」固辤不受，脫身出別籍為編氓，而任翁家事如故。
翁子被訟，當對簿，噤不出一語，第睜目視府君，府君代對無橈詞。或時受窘辱，亦無慍色。居里中，有所睚眥，常面斥之，歸而達旦不寢，曰：「若人得無報復乎？」因自引咎，使人慰解之，其畏事如此。聞郡邑有司貪黷，輒唾罵，因戒子孫愼毋效若輩所為，自取禍敗也。
及見孫時行擢第，年七十四，以嘉靖癸亥十二月二十日卒，距生為弘治庚戌二月十三日。配陸氏，以嘉靖丁亥六月三日卒。繼配嚴氏，以嘉靖庚申十二月十五日卒。具葬婁門外金鵝鄉之新阡。
