行天宮奉祀五聖恩主，所謂的「恩主」就是扶鸞信仰的「救世主」，因為恩主公憐憫世人、救世濟民，所以信眾感恩如救世主。五位恩主，以關聖帝君為首，因此臺灣一般民眾亦稱關聖帝君為恩主公，也經常稱行天宮為恩主公廟。
行天宮五聖恩主(神明座向為主)
隆恩真君：道教重要的護法神、火神，又稱豁落靈官，尊稱「王恩主」。
孚佑帝君：中國八仙之一，人稱「呂祖」、「呂仙翁」，道教尊稱孚佑帝君，又奉為五文昌之一，尊稱「呂恩主」。
關聖帝君：為三國時代之名將關羽，字雲長。關聖帝君備受三教推崇，佛教尊奉為伽藍菩薩；道教奉為協天大帝、翊漢大天尊；儒教則奉為南天文衡聖帝，亦奉為五文昌之一，又稱「山西夫子」（與「山東夫子」孔子並稱）；鸞堂稱為恩主公；一貫道奉為關法律主。1614年，明朝萬曆帝敕封關聖帝君為「三界伏魔大帝神威遠鎮天尊關聖帝君」，故又尊稱關聖帝君，尊稱「關恩主」。
司命真君：灶神，又稱張真君，能夠紀錄一家善惡，稟告天庭。尊稱「張恩主」。
精忠武穆王：12世紀中國宋朝名將，即岳飛，尊稱「岳恩主」。
宗教活動[編輯]
成立宗教性的財團法人機構，確立其社會公益屬性。
每天宣講，傳播正信理念、道德觀、善行作為等。
提供求恩主公收為契孫的平安袋與隨身平安卡。
提供免費之宗教科儀如：收驚、祭元辰、祭關限、祭星、掩魂。
求恩主公收為契孫、參加祈安大法會，費用隨喜。
提倡正信理念、不供奉牲禮、血食、不收受金牌、不演戲酬神、不設乩扶鸞。
不焚化金紙、不燒香，但內殿仍保有廟方為信眾消災祈福的香爐與線香，收驚時也使用線香。
不設置功德箱，香火錢捐獻均由廟內服務人員開立收據，手續清楚。
不主動對外募捐並禁止商業行為。
每年農曆十二月免費提供值年太歲星君神位，供信眾恭請回家自行安太歲，信眾可至事務所恭請值年太歲星君神位，由服務人員解說如何祭拜，並附有說明供信眾參考。
公益志業[編輯]
行天宮除了宗教志業，以及成立於1995年的「財團法人行天宮文教發展促進基金會」之外，還設有四座附設圖書館，以及位於三峽區的恩主公醫院及橫溪恩主公護理之家。
行天宮附設玄空圖書館
敦化總館-館址：臺北市松山區敦化北路120巷9號
北投分館-館址：臺北市北投區中央北路四段18巷48號
松江分館（玄空紀念學院）-館址：臺北市中山區松江路359號
中山分館（親子圖書館）-館址：臺北市中山區中山北路一段144號
行天宮醫療志業
恩主公醫院復興醫療大樓：新北市三峽區復興路399號
恩主公醫院中山醫療大樓：新北市三峽區中山路198號
恩主公醫院門診大樓：新北市三峽區中山路258號
橫溪恩主公護理之家：新北市三峽區成福路6巷30號
金剛經:一切有為法，如夢、幻、泡、影；如露，亦如電，應作如是觀。」