是說雖然目前是由民進黨籍的蔡英文總統執政，以民進黨為主的泛綠陣營一般被視為比較偏向本土意識，主張台灣獨立。但這樣的看法，並不十分精確，因為在蔡英文贏得第二次總統大選前，不止受到國民黨的嚴厲挑戰，屬於泛綠營的深綠獨派團體，也曾希望推出自己的總統候選人。不管是喜樂島聯盟或是民進黨黨內的初選挑戰者賴清德，其實都代表了泛綠營的另外一個路線。蔡英文雖然在第二次總統大選中，又再度率領民進黨全面執政，卻不代表這些路線之爭已經完全解決。蔡英文所代表的「務實獨立」派與深綠獨派團體所代表的「正名制憲」派，未來可能還要再次對決。
蔡英文與賴清德的黨內總統候選人初選競爭，其實就代表了獨派路線的衝突。
不過泛綠營的路線之爭，其實是屢見不鮮的，遠在民進黨還沒有成立之前，當時所謂的「黨外勢力」已有過路線之爭。受到國民黨迫害監視的異議份子們，有一部份人的主張「街頭路線」，也就是持續以街頭抗議、不合作運動、不承認中華民國政府的體制，來推翻國民黨的一黨執政。而另一部份人則主張應該要走「議會路線」，參與中華民國政府的選舉，加入各級議會，來尋找反對運動的舞台。前者曾執行刺殺蔣經國的運動，也曾策畫多起街頭激烈示威事件，後者則加入當時的省議會選舉，與後來的增額立法委員選舉。
這場路線之爭，結束的部份原因在於蔣經國晚年逐步開放黨禁與報禁，各級議會也的確給了「議會路線」更多舞台。同時台灣經濟快速起飛，各種街頭示威活動雖然層出不窮，但過於激進的主張，並不受當時社會認同。再加上李登輝繼任總統以後，加速民主改革，萬年國代退職，立法院也全面改選，而讓「議會路線」成為了反對運動的主流，「街頭路線」於是逐漸退出舞台。而在此同時，由眾多「黨外人士」所剛剛創立的民進黨，其實也隱含路線之爭，因為「黨外人士」是所有討厭國民黨的人，所聚集在一起的團體，這當中也包含了許多外省人，他們支持民主運動，但其中有一部份的人，對於台灣獨立運動是抱持著保留的態度。
這場路線之爭，在民進黨成立的那一天，就已經展開，但當時的處理方式是選擇暫時擱置，先共同爭取民主，避免剛剛成立的民進黨立刻分裂。不過這場路線之爭在後來民進黨大舉投入地方選舉以後，立刻浮上檯面。因為民進黨選擇以地方包圍中央，全力爭取本省籍選民的支持，因此在論述上常常訴諸台灣人所受到的壓迫，快速朝向支持台灣獨立運動的光譜移動。這樣的選舉策略在陳水扁第一次參選總統時，幾乎達到最高峰。這雖然讓民進黨快速獲得多數本省籍選民的支持，但隨之而來的問題，是民進黨被貼上台獨政黨的標籤，政黨之間的省籍情結變的更為涇渭分明。
當然，國民黨在面對民進黨的強烈挑戰下，為了進一步鞏固自己的鐵票，因此也操作外省族群的危機感，讓這種情勢越演越烈。但很快的，藍綠雙方的不同意識形態加入了新的因素，那就是隨著中國的改革開放，對投資中國市場的看法開始兩極他。在李登輝執政的時代，中國的經濟實力還在起步階段，李登輝在執政中期以後也掌握軍政大權，因此他的「戒急用忍」政策，還能暫時阻止台商大舉投資中國。但當時全球已經興起中國熱潮，龐大的吸引力幾乎已經勢不可擋。到了李登輝執政的最末期，連民進黨黨內都出現了不同的意見，一派認為應該「大膽西進」，而另一派則堅持應該延續「戒急用忍」的政策，阻止這股熱潮。
民進黨內的這個歧見越演越烈，但雙方也都同意，為了面對接下來的二○○○年總統大選，民進黨必需要儘早解決這個歧視，形成共識，也一併討論民進黨對投資中國問題的態度，因此舉行了大辯論。結果卻是誰也沒有辦法說服誰，最後得出一個折衷版本稱為「強本西進」，等於是沒有結論的結論。接下來陳水扁執政時，朝小野大，一方面立法院不斷強硬通過各種開放投資中國的法案，另一方面民進黨本身的「強本西進」的這個結論，也讓陳水扁有理由妥協，形成陳水扁政府一方面以台灣意識為政治號召，在經濟上卻不斷加大與中國的依存度。在這樣的困境下，陳水扁只能選擇向深綠基本教義派靠攏，以獲得基本盤的支持。
在陳水扁驚險贏得連任，並引發國民黨長時間示威抗議下，藍綠對抗加遽。不論是有意或無意，雙方支持者均向光譜兩端移動。尤其是泛綠營深綠化的情況最為明顯。陳水扁推動的本土化意識，快速結合「制憲正名」運動，成為陳水扁主政下，泛綠營的論述主軸。但無論這個方向對或不對，陳水扁八年主政的結局，是綠營在二○○八年的大選中一敗塗地，國民黨再次奪回政權，馬英九挾國會的絕對多數，完全執政，讓泛綠營的「制憲正名」運動轉入民間。在民進黨情況最慘淡時，各派系領袖都不願意出來擔任黨主席，結果找來非民進黨嫡系出身的技術官僚蔡英文，由她暫時帶領民進黨，卻沒想到蔡英文成功穩住情勢，在短短幾年內快速成為新的派系共主，並再度奪回政權。
技術官僚出身的蔡英文，個性較為務實。她在民進黨大敗之際，檢討了過去的民進黨路線，改採李登輝時期的部份策略，奉行「只能做，不能說」的方式，專注於內政與改革制度。這種「務實獨立」的路線，也成為蔡英文政府的特色。但結合中華民國體制，重用技術官僚，不進行政治動員的方式，也讓蔡英文執政的前期飽受黨內與親綠團體的批評。特別是「制憲正名」派對蔡英文的不滿，溢於言表。蔡英文在失去泛綠營基本盤的支持下，民調長期積弱不振，讓「制憲正名」派獲得推出新候選人，以取代蔡英文的正當性。只是國際情勢的快速轉變化，蔡英文成功逆轉選情，還因為接下來成功防疫，獲得極高的民意支持度，更讓美、台關係來到有史以來的最佳時刻。
但問題在於，目前看來已成為泛綠營主流的「務實獨立」路線，能否在蔡英文時代結束後，繼續持續下去。目前看來「制憲正名」派並沒有放棄。擁有一定深綠基本盤支持的「制憲正名」派，絕對有實力在未來民進黨的總統候選人初選中，左右選情。在後蔡英文時代，這場路線對決，恐怕很快會捲土重來，最有可能是在下一次的黨內初選中，就率先攤牌。可以這麼說，下一次的民進黨黨內總統候選人初選，將會決定民進黨未來的新路線，是要回到過去，還是走向未來。蔡英文所主張的「務實獨立」路線，絕對沒有現在看來的這麼穩固，因為兩年多前蔡英文低迷的民調，已證明這種路線不容易號召選民。而「制憲正名」派在長年發展下，擁有穩固的支持群眾，雖然目前氣勢低迷，卻也蓄勢待發，鹿死誰手，還在未定之天。
