從清末的武術小說開始，我們就已經看到一系列有關南少林武術的相關小說及故事，無論是真是假，我們或已經能夠看出南少林的重要性，它對嶺南文化、福建文化及台灣文化的重要影響仍然存在於各層面的傳統文化中。
成立的過往：
少林寺的傳說自北魏時代開始，在唐朝時達至巔峰，在明朝清朝時也有着許多的描寫。少林代表着佛教文化在中國的傳承，大家熟悉的少林寺多數是指嵩山少林，位置河南省，在河南有兩個比較熟悉的武術體系，一個是北少林拳，另一個是陳家溝的陳式太極拳。少林寺的武功影響巨大，南北各派不少武術體系都有少林傳承，甚至是曾經參與戰爭而出名。
但是除了嵩山少林寺之外，巔峰時期的少林據說有着九所不同的少林寺佈布於中國各地。其中另一所少林寺在南方，只有十三棍僧救唐王的其中一人在南方福建省開創的。傳說在清朝是由於資助南方反清勢力而被皇室以軍事勢力所燒毁，據說南少林的功夫對現今的福建及嶺南武術有重要的啟發，許多南方門派的祖先都是來源自南少林寺。有許多南方少林拳術把自己的開創者定位至今一百到三百間的南少林練習者。南方重下盤，北方重腿法的武術特徵也能被體現出來。相傳洪拳的始祖洪熙官，詠春拳的始祖五梅師太，白鶴派祖師方七娘等等都是出自南少林武功。包括中外周家五虎，周龍創立的周家拳，曾與太平天國叛亂有關的新會陳享所創立的蔡李佛拳等等皆有從南少林借鑒。
燒毁及發掘：
但由於南少林寺曾經被銷毁，因此歷史學家不能肯定藍少林寺在福建的那個地方。很多學者認為南少林有可能在福建莆田或福州，但並沒有任何的證據證實。在北少林的典籍中並沒有尋找到任何關於南少林的任何蹤跡，甚至有人認為這是洪門組織虛構出來的一個對抗清廷的機構，經歷過多年的法國工作，在福建各地尋找到許多有機會是男少林遺跡的遺趾結構，直至1992年，以林山村中的一所巨大寺院—林泉院，作為南少林的存在認定，認為這就是傳說中的南少林，這是由於在當中找到了關於武僧的記載，而武僧是只是少林寺准許所使用的名號。
抗倭：
曾經在歷史中，也有助記敘關於南少林在明末幫助戚繼光、俞大猷對抗日本浪人的歷史過去。傳說當年俞家軍在福建沿海等待着日本浪人的來襲，期間曾經前往南少林寺視察，發現武僧的武藝已經失去漸多，於是把其武術留下，留名<<劍經>>，實際上是棍術，帶走三名武僧一同前往海邊佈防，以令他們能夠使用出被傳授的棍法，留待未來回到寺院後傳授開去。福建南少林武術善於一套名為<<三戰>>的套路，這是一種練習氣的方式，他們獨特的練習方式能夠令到他們的武術與北方的截然不同，發力、拳法等等與現今日本空手道非常接近，這是由於明末清朝時沖繩與福建的交流十分多，互相影響雙方的文化。
南少林的歷史源遠流長，影響着南方的武術文化，在遊客方面，南少林寺相比起北少林寺的豐富人流，南少林比較少來訪者，也並沒有像不少林寺那麼大的規模，在北少林的周邊有着非常之多的武校，而南少林寺則沒有。北少林寺有着武僧團用於往外國宣傳少林武術，南少林雖然同樣有着武僧團，但收徒規矩比較嚴格，並沒有公開收徒弟。
進入南少林練習功夫非常難，再加上他們的規矩十分不一樣，因此南少林的武功比較有傳奇色彩，但由於福建各派的武術也來源自南少林寺，三戰處處可見，因此不妨前往福建體驗一下那傳奇性的武術文化。希望南少林將會有更加多的發揚機會，令到南少林寺的武功未來可以跟北少林寺一樣威名傳播世界各地。
