芝山巖大墓公同歸所為埋葬無主先人之處。最初由於清朝時期爆發林爽文起事，芝山巖亦成為戰場，戰死於此之無主屍體約有五、六十具。庄民發善心收埋這些戰歿者，乃之後成立的大墓公同歸所最早的一批「居民」。
1859年，北臺爆發大規模漳、泉械鬥，芝山巖又被波及，事件中身亡者亦葬於山頭。約在1896年六氏先生被殺後，庄民重新收納骸骨，將歷年來無主骨骸同葬一穴，是為大墓公同歸所。
傳說在同歸所建立後，當地常在晚上會聽到打殺之聲，隔天早上廟公來打掃時，會發現有骸骨被棄置在外面，一開始以為是野狗叼出來，或是小孩亂玩，但每次把骸骨放回去，隔天又會跑出來，連續幾天，廟公眉頭一皺，感覺事情並不單純......
經詢問開漳聖王結果，係漳、泉兩幫「人馬」互鬥，由於此地主要是漳州人地盤，泉州人不敵，屍骨便被拋到外面。
後來庄民另尋一地埋葬泉人，此事才平息下去。
看來善心人士想讓祂們同歸，無奈漳泉矛盾太深，同歸不了......
雖然暫時解決了，不過為了長遠計，當地四個角頭北山頂、石牌、士林街仔及三芝蘭共同商議，今後要好好普渡一番，以慰幽冥。
過去大約是農曆七月十四日放水燈，七月十五普施，並有賽神豬活動，從參加比賽的神豬有三百多頭，便可知亦是一大盛事。
由此活動還衍生出一段話
「士林街，普電火；石牌仔，普紅龜粿；北山頂，普豬公尾；湳雅（即三芝蘭），普傢伙。」
