經過數十年的無效談判後，馬來西亞和印尼在1998年將西巴丹島（Sipadan）和利吉丹島（Ligitan）將主權爭議帶上國際法院（International Court of Justice, ICJ）。2002年，ICJ將主權判予馬來西亞。
雖然印尼自此不再將這兩座島嶼劃入主權範圍，但卻無法解決領海爭議。
西巴丹島和利吉島位於婆羅洲的東方，就如許多偏離大陸（mainland）的島嶼，經常在繪製地圖時遭忽略。
Google Map。黃點為西巴丹島，紅點為利吉丹島。這張地圖僅用以方便理解兩島在東南亞的哪個位置，往下會更仔細。
直至1969年，馬來西亞和印尼兩國在勘察繪製海權地圖時，才特別留意到兩國主權重疊。自此開啟漫長而無結果的雙邊會談。1979年，馬來西亞發布新地圖，將兩島包含在內。如今關係到馬來西亞的海權爭議，幾乎都可以追溯到這張地圖。
截自論文：Renate Haller-Trost, Brunei-Malaysian Territorial and Maritime Disputes 仔細看能發現Sipadan 和Ligitan 的標識。
馬、印兩國的歷史追溯
我在第一篇講述沙巴與蘇祿/菲律賓主權爭議時，曾經寫過沙巴/北婆羅洲經過一系列的主權轉移：蘇祿蘇丹授權/割讓，Overbeck轉賣給北婆羅洲渣打公司，北婆羅洲公司殖民權轉到英國殖民地部，正式成為英國殖民地。1963年，組成馬來西亞。
不過，馬來西亞對西巴丹島與利吉丹島的主張，則是另一條主權轉移鏈：蘇祿蘇丹割讓/臣服於西班牙，西班牙依據條約將包括蘇祿在內的菲律賓主權轉到美國，美國與北婆羅洲公司勢力分配後，確認由後者負責。最後，由現代國家馬來西亞繼承。
此處最大的問題是，沒有證據顯示兩島是在蘇祿蘇丹國勢力範圍。
印尼則是主張依據1891年的英國（北婆羅洲殖民者）與荷蘭（印尼殖民者）條約，兩島劃入荷蘭範圍，而現代國家印尼是荷蘭殖民地繼承者。
1891年是英荷兩國殖民者為解決殖民地衝突所締結。該條約最終劃定石巴迪島（Sebatik）為界，區分南北。
Google Map。同樣，黃點為西巴丹島，紅點為利吉丹島。石巴迪島上直線分割是英荷殖民者所畫，北部為馬來西亞，南部為印尼。如今仍維持一島兩國。
印尼政府主張這條區分南北的界線，一直劃到外海，意味兩島將劃入荷蘭範圍。不過，即便荷蘭殖民當局曾有將兩島劃入範圍的意圖，卻沒有將此事正式帶入荷蘭國會，也沒有寫入條約。
ICJ最終認定，1891年條約的設計僅涉及陸地，並未包含西巴丹島與利吉丹島。
在印尼的補充說明中，還嘗試援引兩點有意思的依據：
1. 1891年以前，西巴丹島和利吉丹島主權屬於布倫乾蘇丹國（Bulungan）。即便排除1891年協議，印尼同樣能以布倫乾蘇丹國的繼承人身份，宣稱主權。ICJ 認為沒有證據顯示布倫乾蘇丹國曾擁有其主權。
布倫乾蘇丹國主要位於如今印尼的北加里曼丹（North Kalimantan），部分領土已併入馬來西亞的沙巴和砂拉越。印尼獨立後，曾將布倫乾定為自治區，但僅數年就廢止其特別地位。1964年，共和國士兵以蘇丹謀反為由，火燒布倫乾王宮，迫使蘇丹等人逃至馬來西亞居住至今。
2. 即便布倫乾蘇丹國未擁有主權，兩島一直都是印尼漁民傳統捕魚和棲息地，並維持到1970年代。ICJ 否定其效力，認為漁民捕魚屬於個人行為，不能代表國家政府主張，也不反映主權宣示行為。
有效管理：海龜與主權
兩國的歷史主權追溯都被否決，爭議點轉具有「有效管理」。在上一篇馬來西亞vs 新加坡的白礁島爭議裡，ICJ即以新加坡維護與管理島上燈塔，成為判予新加坡的主要依據。
在這次裁決中，「有效管理」則是有利於馬來西亞。
英殖民方在1917年「海龜保護法令」（Turtle Preservation Ordinance），將西巴丹島劃入保護範圍，50年代再將利吉丹島列入名單。ICJ 承認此即為以國家立法方式，實際管理島上海龜蛋採集作業。60年代初，英殖民者建立燈塔及其他設施，並在移交主權後，繼續由馬來西亞負責。
雖然爭議年限設在1969年（意味1969年後的活動不列入ICJ考量），但在雙方歷史依據薄弱的情況下，ICJ很看重「海龜保護法令」所彰顯的主權意識，最終兩島皆判於馬來西亞。
印尼並未提出上訴，從此也不再宣稱主權。如今搜尋西巴丹島，只會看到隸屬於馬來西亞與潛水天堂等字眼。
延伸案：菲律賓曾嘗試介入此案，要求判決菲國為涉及當事人，可見沙巴主權爭議案。馬來西亞與印尼兩國皆以不符程序為由（已經距離公告日已久，菲律賓不應在即將下判之時才申請介入），拒絕其請求。ICJ 最後亦否決其申請。
未完結的海權爭議
雖然西巴丹島和利吉丹島的主權爭議已告一段落，但無法解決從一開始就最具爭議的海權。
Robert Cribb 2010, Digital atlas of Indonesian history
馬來西亞命名 ND6 與 ND7 區塊，可以留意到西巴丹島和利吉丹島位處ND6。印尼接受不以石巴迪島的南印尼、北馬來西亞為界限後，改畫出Ambalat 與 Ambalat East。中間有不小的區塊是兩國重疊處。
其中最主要的利益衝突來自油田開採全。兩國在自己宣稱的主權內，將石油開採權頒布於不同的石油公司，引發ICJ判決後的一系列衝突。2005年、2007年與2009年，連續發生海軍「越界」（按各自說法，都是在行使本國主權），較嚴重時出現衝撞摩擦。
不過，自2009年以後，兩國都有有意降低爭議的公共能見度。部分學者認為，時任印尼總統蘇西洛（Susilo Bambang，任期2004-2014）和馬來西亞首相阿都拉（Abdullah Badawi，任期2003-2009）溫和的外交人格特質，是將爭議降溫的直接因素。
目前雙方皆表明不打算再交由ICJ裁決，是回到雙邊協商。
印尼立場：後蘇哈多時代的外交挫敗
經歷1997年金融風暴，印尼政治強人蘇哈多（Suharto）終於在1998年下台，結束31年的總統生涯。在後蘇哈多時代，印尼先是迎來兩位無力大刀闊斧改革的總統（各自就任一年左右），直到2001年，梅加瓦蒂（Megawati Sukarnoputri）就任，才讓印尼回到相對穩定但脆弱的民主政治。
2002年5月，東帝汶從印尼獨立（印尼在1975年入侵）。數個月後，ICJ將西巴丹島和利吉丹島判予馬來西亞。站在印尼立場，無異於後蘇哈多時代的連續重大外交挫敗。馬來西亞（Malaysia）在部分印尼媒體操作下，被惡意的稱為Malingsia。Maling即盜取，意指盜取印尼國土。
國土竊取者以外，背後更複雜的，還有盜取印尼文化。
馬來西亞與印尼本是文化與語言相近的國家。「馬來人」（Malay）在獨立前，是一個可以包含印尼的地域概念，獨立後才專指種族。然而，現代國家講求以國家為界限的「本土文化」，國與國之間似乎必須要有顯而易見的文化差異，才足以彰顯獨立身份。當馬來西亞宣稱如蠟染（Batik）和民謠Rasa Sayang為本國文化遺產，並作為國家特色宣傳時，在印尼眼中就成了文化盜竊者。
馬來西亞與印尼無疑是兩個獨立國家。旁人看來，這類爭議多屬無稽之談，畢竟說印尼語並不會成為印尼人（何況可能是在說馬來語），擁有高度相似的文化背景也不代表喪失自我，但卻有相當的輿論市場。
曾經緊張的「盜取國土者」身份已漸漸散去，但就如許多永遠戰不完的文化起源說，至今馬來西亞與印尼仍不時出現「〇〇是誰的文化」討論。
