診所在申報執行業務所得之時，有兩種申報上的主要分類；一者，是依據財政部頒布的標準逕行申報，另一者，則是依據帳載數核實進行申報。兩種申報方式的主要差異在於，前者申報程序雖然簡單，但依據財政部所頒訂的費用標準計算執行業務所得，未必符合診所真實的營運狀況。
依據帳載數核實申報，雖然比較繁雜，所需填具的資料與表格也相對較多，但申報的數值，可能與診所營運的結果，相對較有依循的憑證與查核的軌跡，也可能比較符合診所營運的成果。
然而，依據帳載數核實申報時，診所必須依據帳載的資訊，填具損益計算表，並提供收入明細、薪資調查表...等資訊；其中，在損益計算表中，各有兩個主要欄位，一個欄位是『申報金額』，另一個則為『自行調整後金額』，兩項欄位的資訊基礎，有以下的差異：
一、申報金額欄
申報金額欄的資訊，主要是依據財政部核准的入帳基礎，所編製的損益資訊，因此，填具時，尚未帶入稅上的限額。然而，無關乎，是否為被掌握到的健保給付資訊、掛號資訊，亦或是健保未給付的自費，以及其他收入來源，都應依實入帳並申報，支出也是亦然。
二、自行調整後金額欄
而自行調整後金額欄，則是以申報金額欄的損益資訊為基礎，再依據稅法規範進行調整，剔除超過費用限額的部分，如：交際費、職工福利、折舊...等，以及不合乎稅法規範的差額，最後則是以自行調整後的金額，依據盈餘分配比例，申報執行業務所得。換言之，自行調整後金額欄的純益，可能大於或等於，申報金額欄的純益。
而兩項欄位的差異，主要是因為，財務資訊、稅務資訊上，因為不同前提基礎，所產生的財稅差異。
參考資料：