雖然每一個私人診所都是開業醫師的個人執業場域，亦是個人出資的診療空間，但畢竟初始成立私人診所的資金挹注，可不是一筆小數目，故私人診所加盟連鎖品牌的診所體系，尋求更多資源與品牌效應之時，經常可見管理中心或控股公司(下稱:總管理公司)從旁提供必要協助的角色；而這類的總管理公司，經常在連鎖品牌診所的體系中，扮演以下的行政職能，包含：
例如：由總管理公司承租診間所需的診療空間，並由工班依集團CIS統一裝修，再轉租給體系內的各私人診所；或由總管理公司購置(調度)診療所需的設備、相關固定資產，如:車輛、伺服器、冷凍設備...等，再轉租給體系內的個人私診所，藉以降低體系內私人診所的初期成本壓力。
二、相關耗材統購
例如：由總管理公司協助體系內的各私人診所統一採購所需要的耗材，藉此控制成本與統一品質；或為體系內的診所醫師安排研討會或進修課程，以精進診療技術或管理知識，甚至是統一安排專職公司處理醫療廢棄物的清運，或診間的消毒與清理，或為體系內的私人診所提供管理協助，如：稅務申報、節稅規劃、人事制度建置、醫務管理流程改善、資訊系統建置...等；諸如此類，私人診所共同所需的經營支援，皆由總管理公司統一處理，降低體系內私人診所的經營成本。
三、緊急資金調度
體系內的各私人診所，若有營運所需的資金不足之時，總管理公司亦會提供資金融借與調度的協助，以解決燃眉之急。
然而，在制定體系內各私人診所與總管理公司之間的顧問合約時，必須留意以下的合理性問題：
一、是否可以描述具體服務內容
諮詢費多屬定額給付，但每年獲利卻是動態在發生；總管理公司為了取得每年動態的獲利，與體系內的私人診所，簽署一份不合理，甚至無法解釋諮詢、顧問的具體內容為何，且諮詢費用還每年不斷上下浮動的顧問合約；此類為了收款而擬定之合約，可能存在違法疑慮與診所費用遭剔除之風險。
二、合約內的顧問費用是否合理
提供顧問諮詢所收取的顧問費，必有市場上，可受公評的合理價格，若總管理公司為收款而擬定高額顧問合約，且無法解釋具體諮詢內容與計價邏輯，即存在診所支付總管理公司之顧問費用，遭剔除的風險。
三、諮詢費是否與診療收入有關
依據執行業務所得查核辦法§14之規定：非屬執行業務之直接必要費用，不得列為執行業務費用，故依據合約要求，體系內各私人診所支付總管理公司的費用，是否與診所之診療收入直接相關？若無關者，不能列為診所的業務費用。
實務上，在這些總管理公司法人背後的股東與投資者，也希望藉由解決私人診所開業初期，醫師需要大量資金投注的需求，透過支援性質的職能，以諮詢費、管理費、顧問費...等名義，賺取可能的獲利空間。
但如果總管理公司的年度諮詢費被稅務機關剔除，導致私人診所開業醫師需要再補稅的話，由誰承擔？如何承擔？這就必須要再進一步細究了。
參考資料：翰鼎顧問股份有限公司
