佛國品第一：
「寶積！眾生之類、是菩薩佛土。
所以者何？菩薩隨所化眾生、而取佛土，隨所調伏眾生、而取佛土，隨諸眾生、應以何國入佛智慧、而取佛土，隨諸眾生、應以何國起菩薩根、而取佛土；所以者何？菩薩取於淨國、皆為饒益諸眾生故。譬如，有人欲於空地、造立宮室，隨意無礙，若於虛空，終不能成；菩薩、如是、為成就眾生故、願取佛國，願取佛國者、非於空也。」
(評曰：
上段即《金剛經》：「我皆令入無餘涅槃、而滅度之，實無眾生、得滅度者」之意；若修行人、於其心中、有一「眾生想」轉滅者，即不名菩薩摩訶薩，如是、有「我想、人想、壽者想」轉滅者、即不名菩薩摩訶薩。
要在「入」之一字：若菩薩、起於善根，「入」佛智慧，則常寂光中、建立隨所化度眾生，貫穿無礙；若惟務轉滅雜染諸想，證於空、無相、無作正位，則惡取空中、棄捨所應饒益眾生，殊失方便，便落聲聞緣覺、而無有我、人、眾、壽等想。)
「寶積！當知：直心、是菩薩淨土，菩薩成佛時，不諂眾生來生其國；深心、是菩薩淨土，菩薩成佛時，具足功德眾生來生其國；菩提心、是菩薩淨土，菩薩成佛時，大乘眾生來生其國；⋯
方便、是菩薩淨土，菩薩成佛時，於一切法方便無礙眾生、來生其國；⋯
迴向心、是菩薩淨土，菩薩成佛時，得一切具足功德國土；⋯
如是，寶積！菩薩隨其直心、則能發行；隨其發行、則得深心；隨其深心、則意調伏；隨意調伏、則如說行；隨如說行、則能迴向；隨其迴向、則有方便；隨其方便、則成就眾生；隨成就眾生、則佛土淨。」
(評曰：
直心、深心、菩提心、即：以實想、「入」於煩惱叢林時、所歷之林相差別也；方便、即：當人欲渡阿賴耶識大海時、所乘之船筏也；迴向、即：以船筏駛往彼岸時、所趣之行向也。)
「仁者心有高下、不依佛慧，故見此土、為不淨耳！舍利弗！菩薩於一切眾生、悉皆平等，深心清淨、依佛智慧，則能見此佛土清淨。」
(評曰：
佛國、即諸人現今腳下所踩之處，此穢土、方是真淨土也；污穢、是仁者心污穢、非土污穢，心若淨、所見皆是淨土，心若不淨、各處無非穢土，是故，淨土不應遠求西方、而應求諸自心。)
方便品第二：
「入深法門、善於智度，通達方便、大願成就。」
菩薩品第四：
「直心是道場，無虛假故；發行是道場，能辦事故；深心是道場，增益功德故；菩提心是道場，無錯謬故。」
文殊師利問疾品第五：
「深達實相、善說法要，辯才無滯、智慧無礙，一切菩薩法式悉知，諸佛祕藏、無不得入，降伏眾魔、遊戲神通，其『慧、方便』、皆已得度。」
「云何『平等』？謂：我等、涅槃等，所以者何？我及涅槃、此二皆空，以何為空？但以名字、故空，如此二法、無決定性；
得是平等，無有餘病、唯有空病；空病、亦空。
是有疾菩薩、以無所受、而受諸受，未具佛法、亦不滅受而取證也。
設身有苦，念惡趣眾生、起大悲心：我既調伏，亦當調伏一切眾生，但除其病、而不除法，為斷病本、而教導之。⋯
文殊師利！是為有疾菩薩、調伏其心，為斷老病死苦，是菩薩菩提；若不如是，己所修治、為無慧利。譬如，勝怨、乃可為勇，如是、兼除老病死者、菩薩之謂也。」
(評曰：
空病、即病本，亦即《楞伽經》三自性中、緣起自性之究竟邊際，配當第九菴摩羅識；
法想、即緣起自性，配當第八阿賴耶識；
我想、眾生想、即妄想自性，配當前七轉識。
我想、眾生想、法想不需除，但除病本，而我想、眾生想、法想自轉為四智矣。)
「何謂『縛』？何謂『解』？貪著禪味、是菩薩『縛』，以方便生、是菩薩『解』。
又，無方便、慧縛，有方便、慧解，無慧、方便縛，有慧、方便解。
何謂『無方便、慧縛』？謂：菩薩以愛見心、莊嚴佛土、成就眾生，於空、無相、無作法中，而自調伏，是名『無方便、慧縛』。
何謂『有方便、慧解』？謂：不以愛見心、莊嚴佛土、成就眾生，於空、無相、無作法中，以自調伏、而不疲厭，是名『有方便、慧解』。
何謂『無慧、方便縛』？謂：菩薩住貪欲、瞋恚、邪見等諸煩惱，而植眾德本，是名『無慧、方便縛』。
何謂『有慧、方便解』？謂：離諸貪欲、瞋恚、邪見等諸煩惱，而植眾德本、迴向阿耨多羅三藐三菩提，是名『有慧、方便解』。」
(評曰：
慧、即是定，方便、即是慧，莫拘用詞；二乘人、定慧不等，大乘人、入佛秘藏時、定慧等。)
不思議品第六：
「夫，求法者，非有色受想行識之求，非有界、入之求，非有欲、色、無色之求。」
(評曰：
是知：佛智慧、在阿賴耶識之外、而包括之。)
「法不可見聞覺知，若行見聞覺知，是則見聞覺知，非求法也。」
(評曰：
見聞覺知、特指第八阿賴耶識而言、兼指六識，何以故？前云：法、非有陰界入之求，此云：法不可見聞覺知，可知：見聞覺知、即陰界入也，所謂「見聞覺知即六識、非阿賴耶識」者，謬言也。)
觀眾生品第七：
「行方便慈，一切示現故；行無隱慈，直心清淨故；行深心慈，無雜行故；行無誑慈，不虛假故；行安樂慈，令得佛樂故。
菩薩之慈，為若此也。」
佛道品第八：
「智度菩薩母，方便以為父，一切眾導師，無不由是生。」
菩薩行品第十一：
「何謂『不盡有為』？謂：不離大慈、不捨大悲，深發一切智心、而不忽忘，⋯
種諸善根、無有疲厭，志常安住、方便迴向，⋯
墮煩惱者、令發正念，於遠離樂、不以為貴，⋯
在諸禪定、如地獄想，於生死中、如園觀想，⋯
發行善根、無有齊限，⋯
生死無數劫、意而有勇，聞佛無量德、志而不倦，以智慧劍、破煩惱賊、出陰界入，荷負眾生、永使解脫，以大精進、摧伏魔軍，常求無念、實相智慧行，⋯
行如此法，是名菩薩『不盡有為』。」
