為了防止法國人繼續覬覦德克薩斯,新西班牙殖民政府決定在德克薩斯東部建立據點,於1689年底在內奇斯河(Neches River)河畔建立了德克薩斯聖方濟傳教站(Mission San Francisco de los Tejas),由方濟會傳教士達米安‧馬薩奈特(Damián Massanet)主持,對當地的原住民卡多人傳教。
1691年,殖民政府任命多明哥‧特蘭‧德‧洛斯里奧斯(Domingo Terán de los Ríos)擔任第一代德克薩斯與科阿維拉州(Tejas y Coahuila)州長,並計畫在德克薩斯建立一系列傳教站,除傳教外也鞏固在當地的統治。但殖民地的人口與預算有限,加上原住民的認為傳教士帶來瘟疫而群起抵制;實際上只有兩座傳教站落成(包含馬薩奈特那一座),而且都在1693年前後廢棄。
西班牙人前腳剛走,法國人又出現在墨西哥灣地區。1699年初法國探險家皮埃爾‧勒莫瓦 ‧迪貝維爾(Pierre Le Moyne d'Iberville, 1661 – 1706)在現在的比洛克西(Biloxi, Mississippi)建立據點莫爾帕堡(Fort Maurepas);兩年後又興築路易斯安那的路易堡(Fort Louis de La Louisiane),這座據點發展成為法屬路易斯安那的首府,即現在的莫比爾(Mobile, Alabama)。
由於莫爾帕堡與路易堡兩座城鎮地勢低窪,易受水患,迪貝維爾的弟弟尚‧巴蒂斯特‧勒莫瓦‧德‧比恩維爾(Jean-Baptiste Le Moyne de Bienville, 1680 – 1767)選中了密西西比河口一處高地上的廢棄原住民村莊,在此興建法屬路易斯安那的新首府──紐奧良(La Nouvelle-Orléans)於1718年5月建成。
1711年,曾在馬薩奈特手下任職的方濟會傳教士弗朗西斯科‧伊達爾戈(Francisco Hidalgo, 1659 – 1726)向殖民政府提議回到德克薩斯重建據點,他曾於1700年在墨西哥北部格蘭德河河畔建立了聖胡安‧包蒂斯塔傳教站(San Juan Bautista Mission),進入德克薩斯的西班牙探險隊都以此為基地,這座傳教站後來發展為科阿維拉州的邊境城鎮格雷羅(Guerrero, Coahuila)。
伊達爾戈遲遲等不到新西班牙方面的回應,便轉而找上法國人協助,法屬路易斯安那總督卡迪亞克(Antoine de la Mothe, sieur de Cadillac, 1658 – 1730)決定派遣探險家路易‧德‧聖丹尼(Louis Antoine Juchereau de St. Denis, 1676 – 1744)前去與伊達爾戈會合。聖丹尼的探險隊中還包含了聖路易堡的倖存者羅貝爾(Robert Talon)與皮埃爾‧塔隆(Pierre Talon, 1676 – ?)兄弟,這對兄弟在聖路易堡被攻破後獲得友好的原住民部落收留,後被送到墨西哥,不久前才搬回路易斯安那定居,對德克薩斯的情況有一定的認知。
翌年7月,拉蒙探險隊在馬薩奈特傳教站的舊址上重建了聖方濟寶劍傳教站(Mission San Francisco de la Espada)以及一座附屬的堡壘(Presidio),另外三座傳教站也在附近的原住民村莊中建成。傳教士們將這片土地稱為「新菲律賓」(Nuevas Filipinas),期望他們的事業能像西班牙在菲律賓的前例一樣成功,但這個名字只在少數官方文件中出現,並未取代德克薩斯的地位。
新菲律賓距離西班牙的主基地聖胡安‧包蒂斯塔實在太遠,補給上困難重重,四座傳教站中有三座後來都被迫搬遷,只有納科多奇部落(Nacogdoche)的瓜達露白聖母傳教站(Mission Nuestra Señora de Guadalupe)繼續堅持,這座傳教站與村莊往後發展成東德克薩斯的重要城鎮納科多奇斯(Nacogdoches)。
1718年,新任德克薩斯州長阿拉孔(Martín de Alarcón)決定在聖胡安‧包蒂斯塔與新菲律賓之間設置一座中繼站,他選上聖安東尼奧河畔的一座科阿維特坎人村莊,於此建立了聖安東尼奧‧德‧瓦萊羅傳教站(Mission San Antonio de Valero)與貝沙爾堡壘(Presidio de Béxar),並賦予其城鎮的法律地位。這座城鎮即是聖安東尼奧的雛形,而傳教站則成為該城最重要的地標:阿拉莫教堂。