雙方達成 15% 對等關稅且不疊加協議，台灣爭取到銷美261 項農產品零關稅，美國也有多項農產品獲得我方調降稅率，例如豬肉、柑橘 及花生等品項更享有零關稅優惠。整體來看，蝴蝶蘭產業為大贏家，出口水產業亦屬正面利多，酪農業所受負面衝擊最大，畜牧業也受到衝擊，降低關稅後的進口美豬，恐對國內豬肉市場造成嚴峻挑戰。
美國是台灣農產品出口的第一大市場，市佔率達 17.6%，也是第一大進口來源國，佔總產值22.3%。本次關稅談判對出口業者相當有利。
社團法人台灣蘭花產銷發展協會理事長黃文榮表示，美國是台灣蘭花的重要外銷市場，市佔率約 40%，台灣蝴蝶蘭銷美「零關稅」，是過年收到最大紅包。相較於主要競爭國家─荷蘭銷美關稅15% ，我方蝴蝶蘭優勢大增。台灣水產工業同業公會秘書長吳姿蓉表示，美國是我國水產品出口的最大市場，這次對等關稅得到更好的立足點，「我們拿到 15%，其他競爭國像中國、越南、印尼，沒有人比我們關稅更低。」很有信心可以提升國際競爭力。同時，美國進口水產品降至零關稅，也為加工端降低成本，等於此項談判成果對產業是兩大利多。
台灣鯛協會理事長郭建賢表示，目前台美關稅底定在 15％不疊加，對台灣鯛在美國市場而言，他仍是認為長期樂觀。郭建賢指出，台灣對美輸出主要品項是條凍，主要對手是中國，現在中國受關稅影響，條凍出口已經轉向非洲。
他觀察到，中國國內的羅非魚（與吳郭魚、台灣鯛同品項）目前正在減少放養量，把生產基地移到印尼跟越南，但新增投資在這兩國主要以魚片出口為主，中國遺留下來的條凍市場會由台灣跟越南來競爭，即便越南的生產者背後也是中國資金。
郭建賢表示，目前條凍魚在美國佔有的市場份額已從 20% 上升至 29%，但現下貿易商的存貨還很多，新的出口量需求拉抬，應該會從 4 月才開始產生。
在台美關稅談判期間，一度傳出美國要求稻米降關稅，讓農方十分緊張。業界分析，如果台灣給予美國米零關稅的優惠，等於美國米的售價就只有 30 元左右。以現今國產白米每公斤 50 元的均價來看，台灣價格遠遠不敵，開放美國米零關稅將「動搖國本」。
這次談判結果未調降進口美米關稅，台北市米穀商業同業公會梁朝凱理事長表示，感謝政府守住台灣主食稻米底線，不僅維持現行關稅配額制度，配額外的關稅也不調整，是對數十萬從業人員的一劑強心針。
中華民國養雞協會秘書長王建培則表示，原本十分擔心進口雞肉關稅降低，現在大勢底定、維持不降稅，對養雞產業是相當好的消息。台灣養雞產業除了產量、換肉率提升，價格也維持平穩，同時也輔導禽舍更換設備，產業正在進步，在農安基金協助、國人樂意消費的情況之下，將不怕競爭。
根據農業部統計資料，2025 年液態奶進口量為 5 萬 9595 噸，其中美國液態奶為 3 萬 3046 噸，占比 55%，且因美國進口的液態奶幾乎屬於鮮乳（7 月 1 日後將更名為「牛乳」），不論是業務市場或家用市場，都是巨大衝擊。
台大動物科學技術系名譽教授徐濟泰預估，關稅壁壘消失後，進口商與乳品公司將能以更低成本引進美國液態奶，替代部分成本較高的國產生乳，直接衝擊酪農的生乳收購量。中華民國酪農協會前理事長、綠盈牧場負責人顏志輝認為，經過高溫烹煮後，鮮乳與進口奶的風味差異縮小，對成本敏感的業者如飲料業、飯店業、烘焙業自然會轉用價格較低的進口原料。
