密勒日巴生於公元1052年，其家族是販羊毛致富的商人，其父樂善好施，甚為人尊敬。
在尊者生父病死前，曾把家產托付予尊者的叔嬸代為管理，直至尊者成年。
但在尊者之父死後，他的叔嬸卻把尊者母子視作僕人，命他們種田苦役，只給予低劣的食物及很差的居住環境。在尊者年屆十五時，其母便延請親友見証，意欲要求交還其家產。
在這時候，尊者之叔嬸卻聲稱自己才是家產原有人，更把尊者母子驅趕離家。族中親友有的欺善怕惡，有的則無能為力，只好袖手旁觀。
尊者的母親眼見豐富的家產被吞奪，親友中又沒有人主持公道，心感極大的怨屈，便把唯一餘下的娘家田產賣了，把全副家當交予尊者，囑他向術士求學咒術復仇，更以自殺作為威脅。
尊者便離家學術，經過了好一段日子終於學成了。
在其叔嬸一次舉行盛宴的時候，尊者便施咒令大宅倒塌，一彈指間便殺死了三十五個族中親友，只刻意讓其叔嬸活了下來，讓他們體驗家產散盡的痛苦。
在此後，尊者又施術令天降冰雹，把其原來居住的村中田產全毀，對族中親友的報復到此方休。
在復仇後，尊者并未得到復仇的快感，反而開始生起悔疚罪業的心。
在這種日益折磨他內心的罪疚感變得越來越強時，尊者便輾轉來到了著名的瑪爾巴譯師居地。
瑪爾巴是一位居士，曾不畏危險多次遠赴印度，依止那諾巴等大師修學，更帶回大量珍貴佛典，成為了在藏地受人敬重的大譯師及大修行者。
透過瑪爾巴的神通，他知道了密勒日巴的殺人重罪，同時也知道尊者有緣成為他的上首弟子。
瑪爾巴早已是一位証悟了無上慈悲心的大成就者，但為了令密勒日巴懺淨罪障，他便對尊者拳打腳踢，又命尊者為他在山上建造大型樓房，自己卻表現為脾氣暴躁、不近人情及常常飲酒的人。
尊者為了替師父建房，身心被折磨得很厲害。瑪爾巴更規定尊者要以背扛大石上山，令尊者背部被磨至潰爛不堪。
在每次建成一樓房後，瑪爾巴卻會發脾氣命尊者把房子拆去重建為不同形狀。
就這樣，尊者不屈不撓地捱著痛苦折磨及責打多年。
在這期間，瑪爾巴常有對其他弟子開示，卻從不允許尊者參與聞法，更多次施以責打。
這樣地過了多年後，瑪爾巴才對尊者說：「你是我有緣的弟子。這些年來，為了令你洗盡極重的罪業，我才對你多番留難。這些磨難你本應歷受九次，但因著你師母的阻撓，我只施行了八次！」。
自此，譯師便終於對尊者開示，並授記尊者將成為極為傑出的行者。
