貝氏計算工具 (1) NIMBLE
更新於 2024/01/19閱讀時間約 3 分鐘
嗨，大家好！
今天我們來說一個統計學和資料分析領域非常有趣的工具，她可以協助我們進行貝氏計算。她就是 NIMBLE。（這篇文章用語有和 chatgpt 聊過）。
NIMBLE 是一個 R 語言的套件。有了 NIMBLE，你可以把 BUGS 的程式碼轉換成模型物件，然後用在你想要的任何演算法上，包含 MCMC, MCEM, HMC 等等。這不僅包括 NIMBLE 提供的演算法，還有你用 nimbleFunctions 自己編寫的演算法。
首先，Nimble 有個很厲害的地方，就是她不僅使用了 BUGS 語法，還擴展了它。這點相當方便，因為過去二十年來，大量的書籍、文件、期刊文章、範例都是使用 BUGS 語法寫的，包含 WinBUGS、OpenBUGS、JAGS 等平台。然而，這些平台有的已經不能用、不再更新，或者效能不如預期。目前大多數人轉用 JAGS，但是 JAGS 也有一些效能、收斂等問題。所以在 2012 年，像是 Andrew Gelman 等學者開始推動 Stan 語言，而現今的貝氏統計學三大經典教材都以 Stan 為基礎或至少提及 Stan。這三本書包含：
- Bayesian data analysis, 3/e (Stan 作者)
- Statistical rethinking, 2/e (提供簡單寫 Stan 的方法
Ulam(),alist()) - Doing Bayesian data analysis, 2/e (提及 Stan)
接下來，Nimble 的速度也比 JAGS 快，這點在很多文章中都有被討論過。雖然之前有 R2jags 套件可以進行平行計算，但是 Nimble 內建的平行計算功能還在開發中，目前只提供使用 parallel 套件的方式。
最後，Nimble 在混合模型的計算上有優勢。這意味著在需要使用混合模型的領域，Nimble 可能會比 Stan 更適用。特別是在生態學領域，有很多生態學家在使用 Nimble，或許就是因為她在處理混合模型時的優越性。
總而言之，NIMBLE 就像是一位統計學的超級英雄，尤其適合在貝氏統計學中積極探索的你們。如果你對統計學充滿好奇，這個工具絕對值得你一試！
See Also
- Beraha, M., Falco, D., & Guglielmi, A. (2021). JAGS, NIMBLE, Stan: a detailed comparison among Bayesian MCMC software. arXiv preprint arXiv:2107.09357.
- Nimble user manual
- Bayesian Analysis of Capture-Recapture Data with Hidden Markov Models: Theory and Case Studies in R
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*合作聲明與警語：
本文係由國泰世華銀行邀稿。
證券服務係由國泰世華銀行辦理共同行銷證券經紀開戶業務，定期定額(股)服務由國泰綜合證券提供。
剛出社會的時候，很常在各種 Podcast 或 YouTube 甚至是在朋友間聊天，都會聽到各種市場動態、理財話題，像是：聯準會降息或是近期哪些科
Vision Pro不只是一款普通的VR眼鏡，蘋果一直以來都在創造指標性的產品，不管是電腦或手機，只要是蘋果出來的產品都會讓人對於它的創新與獨特感到欽佩。
如同這款Vision Pro，雖然在眼睛前的面板尺寸僅為郵票大小，卻有著2300萬像素的規格，等於每隻眼睛都在看一部4K電視。當佩戴上這款設備時
當一切都準備就緒的時候，Andy開始實行自己的計劃了，剛剛開開始的時候十分順利，每天下班之後抽時間學習50個英文詞彙，然後上一個公開課程，每天學習後便去睡覺，第二天去上班，週末去找一些外國人聊天，十分充實。
突然有一段時間，Andy的朋友們經常約他吃飯，每隔兩三天便約他一次，他也不好意思拒絕，唯有是
賴香吟新版的短篇小說集《島》，集結十四個短篇，一篇篇如星遙遙接壤，在夜裡亮出南國的天域，而我們也在這三十年的時光裡浮沉，隱約辨認出島的陌生面目。
第一篇是一九八七年的〈蛙〉，以蛙聲嘓嘓鳴出女人的命運，意識流般的傾淌，蔓延家庭與職場，同時也在母職與女性自我之間，發出微弱的抗議：
清冰箱不僅能將食材好好利用，更能夠趁食材還新鮮的時候吃到營養價值高的料理。
-寫於2020/12/02
Hi there， 今天想分享我目前心中很讚的天后合作歌曲，這篇一共會分享兩首。當然呢，說是天后合作曲，歌手的咖位當然不是我隨便找的，這兩首的演唱歌手都真的是殿堂級的，一首感性、一首性感，就跟我接著看下去吧！
備孕的路程每個媽媽都走過，有些媽媽的路簡單明瞭，從備孕到懷孕就像到巷口買菜一樣輕鬆；有些路卻佈滿荊棘，甚至有媽媽雖成功懷孕，卻不斷「落胎」，前後經歷了9次才成功，過程的苦只有女人才懂，我甚至覺得比國父革命還偉大！
這個開始是因為對於最近業界意見、新聞，我有很多想法。不過我中文也沒有好到可以很順利的拍影片，完美解釋我的想法。所以接下來一個一個主題我想公佈。先寫的一篇是「為什麼不想被說經紀公司的原因」。
2018年11月5日，台北市長柯文哲競選總幹事小野（李遠）拍影片發聲，公開支持民進黨高雄市長候選人陳其邁，結果被當時的輿論批評操作選舉「棄保」策略，甚至被國民黨台北市長候選人丁守中質疑為「門神」。但其實真正的內情，我認為沒有這麼單純，被後都是政治算計...
2008 年裴益基修繕家中，整理物品時發現了尚州本存在，當時 MBC 安東電視台前去採訪，雖然遺失序文四頁和最後一頁，但內容有朝鮮時代學者的注釋筆記，學術價值高於澗松本。由此，在沒有經過專家評估和鑑定的情況下，慶北大學的經濟學教授估計其市價值韓圜一兆元，即台幣260億左右。導致日後裴益基緊咬一兆此
安春熙（音譯，안춘희）出生於慶尚北道醴泉郡的山裡，是八個兄弟姊妹中的長女，爸媽說丫頭不用識字，就沒讓她去學校。在餐廳打雜的時候連老闆交代的待買食材清單都無法寫下。這樣的她在七十七歲這年學會認字後不久寫了首詩，得了首爾市成人文解教育詩畫展的特別獎。
〈歲月呀，等等我 세월아 기다려〉
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