荷蘭人在台灣的轉口貿易，受到鄭成功的競爭，有許多貿易品無法順利取得，所以必須跳過台灣找尋新的貿易路線，使得台灣作為轉口站的功能逐漸減低。
壹、生絲路線
1640年後鄭芝龍也往日本競爭生絲貿易，荷蘭人無法在台灣獲得足夠的中國生絲。日本白銀的獲得也跟著減少。荷蘭人轉而在東京（越南）購買越南生絲，1643年公司運送到日本的越南生絲就已經超過中國生絲的數量。然而華商在越南的競爭勢力亦不小，到1650年初，東京生絲的利益也逐漸減少。公司也試著運送波斯以及孟加拉的生絲到日本，但波斯的生絲在日本不受歡迎，而孟加拉的生絲成本較低，於是荷蘭人大量購買孟加拉的生絲銷往日本。1653年公司由孟加拉輸往日本的生絲已經超越由越南輸往日本的生絲。從1655年開始，有些年甚至根本沒有來自東京的生絲。1653-1660年8年間，荷蘭人輸入日本的生絲之中，孟加拉生絲除了在1654年占56%以外，其餘7年全都高達60%以上，更有1658、1660兩年間的生絲全都來自孟加拉的紀錄。據統計，1637年公司輸往日本的中國生絲與華人輸往日本的中國生絲比率是93%與7%；但是到1662年的比率變成8%與92%，數字完全倒過來，也就是荷蘭人利用台灣轉運中國生絲到日本的功能消失。但是，公司輸往日本的生絲總數與華人輸往日本的生絲總數，在1650年代約是40%與60%，顯然大部分來自孟加拉。
貳、金銀路線
黃金是荷蘭從中國取得的主要貨物之一，供給印度一帶。華商也經常用黃金到台灣來換取貨物，雖然鄭芝龍控制貿易，對黃金輸入台灣帶來影響。不過黃金是輸往印度半島，華商當時沒有這條貿易路線，為了利益，還是會將黃金賣給荷蘭人，只是荷蘭人的購買價格沒有以前理想。
鄭成功與荷蘭人對立後，荷蘭人的黃金收入經常不如預期。但是數量仍比1640年代多。1655-1656年，鄭成功與滿州人戰爭，在中國炒作黃金，派人到處收購黃金，迫使台灣提高黃金收買價格，黃金的利潤少，減低荷蘭人的利潤，降低購買慾望。
白銀方面，日本的白銀主要是用來交換中國的生絲。後來中國生絲運到台灣愈來愈少，日本運到台灣的白銀也減少。荷蘭人逐漸將生絲採購重點漸漸移向越南以及印度，白銀的使用也漸漸移向該地方。1647年荷蘭人的報吿，運往東京的日本白銀約運到台灣白銀的6.5倍。1651年12月更報吿，台灣因為貿易蕭條，不需要平常數量的資金。
1641-1654年，當時公司輸入的日本物資每年約有12.8百萬盾，其中有54%為生絲或絲織品。約有一半，超過3.5百萬盾直接來自東京越南，運到日本交換日本銀。公司由日本輸出的銀，每年有1/4，約1.5百萬盾，輸向東京，其中80%是購買東京生絲到日本去賣，其餘買絲的半成品。
孟加拉方面，公司從1656年開始將日本白銀使用於孟加拉，以確保孟加拉生絲的購買，運回歐洲的生絲也以孟加拉為主。1656-1672年，公司的生絲主要來自孟加拉。
參、砂糖貿易路線
台灣早期並不生產砂糖，荷蘭人透過進口中國砂糖到台灣，然後再轉運出去，運銷的地點以日本為主。1636年台灣也輸出自行生產的砂糖，後來砂糖受到中國砂糖銷往日本的競爭，日本的砂糖市場利益下降。台灣的蔗糖工業乃將製成的糖漿大量運往中國加工，從1648年起，每月有數百擔的糖漿輸出。1650年代初期，台灣行政當局便不斷地降低砂糖的收購價錢，顯然台灣的砂糖生產在中國的競爭之下，已經過剩，銷往日本的砂糖受到中國砂糖的競爭，無法再成為有力的貿易品。
1655年以後台灣的砂糖，除了作為壓艙運往日本之外，一部分未加工的糖水也運往中國。另外，公司找到另一條貿易路線，將大部分砂糖銷往波斯。1657年砂糖運到波斯的利益是96.75%，1658年的利益是194%。改變了貿易路線與市場，讓台灣的製糖工業可以存續下來。荷蘭從台灣撤退之後，仍然在巴達維亞經營製糖工業。
肆、台灣與中國的貿易品
1650年代以後，台灣輸出到中國的貨物，東南亞運來的香料因為鄭成功的競爭利益減少，剩下的是本地生產鹿產品、魚品為主，後來連砂糖也成為輸出中國的產品。
魚類：台灣輸出到中國最固定的是鹿產品以及魚類。魚類以冬季的烏魚為主。大約12月就會有戎克船來捕烏魚，持續到3月。一般是到南部去，範圍大約到恆春。捕到的魚主要銷售到中國。以中國漁夫為主，而且沒有荷蘭人的競爭，數量一直很穩定。
鹿製品：鹿製品並不限定在冬季，而且是台灣壟斷後再輸出中國，也不會涉及外銷上中國的競爭問題。1650年代中國戰亂，台灣輸出的鹿肉可作為中國人民糧食的補助品。
至於中國運到台灣的轉口貿易品生絲、黃金數量減少。特別是生絲，荷蘭人幾乎無法取得。主要轉口貿易品減少，但是日常生活品如菸草、酒、日常用品等卻增加。
運到台灣酒類相當多，而且種類多。日本學者中村孝志認為有人比較有閒暇，消費不同的酒類。另外相當多日常用品輸入，包括瓷器、鐵鍋、草蓆、女用鞋子。建築用品有瓦、鐵釘。還有鐵犁、糖鍋、石臼等。另外中國人增多，死亡的祭祀用品也輸入，如棺木、棺材板以及拜拜的金紙等。中村孝志認為輸入這些日常用品與漢人社會發展有關，認為台灣的中國人逐漸增多，社會也多樣化，所以輸入各項生活日常用品給台灣的中國人使用。另外，酒類與菸草也大量提供給原住民。
因此，1650年代，荷蘭人在台灣拿不到中國生絲，無法換取日本的白銀，而以孟加拉生絲取代中國生絲運送到日本。這條航路逐漸跳過台灣，嚴重影響台灣作為貿易轉運站的地位。
轉口貿易貨品減少，相對地，台灣輸出到中國的貨品以台灣生產居多。中國輸入到台灣的貨品，則是供應台灣正在擴大的漢人社會以及原住民使用為主。在競爭上，沒有荷蘭人競爭，都是由中國人輸入，台灣逐漸由國際貿易轉向兩岸貿易。
書名：典藏台灣史（三）大航海時代
作者：林偉盛
出版時間：2018年6月
出版社：玉山社出版公司