《沉默》（Silence），是2016年的歷史時代電影，由馬田·史高西斯執導，是他的「宗教三部曲」第三部電影，首部是《基督最後的誘惑》（1988年），其次是《活佛傳》（1997年），電影改編自日本作家遠藤周作於1966年出版的同名小說。史高西斯在1989年第一次閱讀這本小說，之後很快獲得了電影版權。從1990年起籌備開拍，到電影上畫經歷26年時光，一直爭議不斷，所以本片算是史高西斯的一個「受難項目」。
故事發生在德川幕府時代禁教令下長崎附近的友義村，一個葡萄牙耶穌會教士范禮安（基安·希斯 飾演）從澳門『聖保祿學院』偷渡到日本傳教，並調查恩師克里斯多夫·費雷拉（里安·尼遜 飾演）因遭受「穴吊」酷刑而宣誓棄教一事，因為事件在當時歐洲人眼中，不只是個人的挫折，同時也是整個歐洲思想信仰的恥辱和失敗。
當看見一名老武士把在村中搜捕的可疑基督徒，綁在海邊木製十字架上，讓潮水淹死他們，三位神父都非常震驚。神父們解下淹死的村民，因無法以基督徒方式埋葬，唯有將屍體火化。
格儒佩動身去平戶市找井上政重大名（一成尾形 飾演）要求停止迫害基督教村莊。羅德里奎茲去五島市—費雷拉最後居住地方，發現其居住房子已被毀壞。當三人回到友義村集合時，發覺嚮導吉治郎已背叛他們。吉治郎帶著老武士警告羅德里奎茲，除非他放棄信仰，否則其他被俘的基督徒將會受苦。
羅德里奎茲被帶到長崎市，與許多日本基督徒被監禁起來。法庭上，他被告知日本對天主教教義深惡痛絕。羅德里奎茲要求見井上大名，原來之前出現的老武士就是井上本人。羅德里奎茲回到監獄，遇上也被監禁的吉次郎，他向羅德里奎茲解釋，法庭官員威脅要他背叛羅德里奎茲。
吉治郎表示自己也是基督徒，要求羅德里奎茲寬恕他的背叛。不久，吉治郎願意踩踏一個像徵拋棄信仰行為的「踏繪」（一個粗糙的十架苦像）後被釋放出來。
羅德里奎茲被帶到海岸線，他目睹消瘦的格儒佩和另外三名囚犯被警衛看守著，另外三名囚犯坐在小船上被帶出海，並逐一掉入水中淹死，目的是要勸誘格儒佩叛教。羅德里奎茲看見格儒佩拒絕放棄信仰，並試圖搶救最後一名被淹死的囚犯時，不幸溺斃。
後來，羅德里奎茲終於與年老的費雷拉見面，費雷拉態度強硬表示自己遭受折磨時確實叛教，經歷16年在日本傳教，發覺天主教福音在日本起不到作用，羅德里奎茲只能與他斷絕關係。
當晚，羅德里奎茲在監獄裡，聽到五名基督徒遭受酷刑，並已放棄信仰。此刻，羅德里奎茲看著一個「踏繪」，彷彿聽到基督的聲音允許他踩踏它，他就踩下去。隨後羅德里奎茲背上叛教罵名，井上賜他日本名以及妻子和兒子，在往後的日子裡，他一直受到監視。
幾年後，費雷拉去世，吉治郎突然來找羅德里奎茲，要求神父再次赦免他，但羅德里奎茲拒絕，理由是他不再是一名神父。
吉治郎後來被人發現身上的護身符內裡藏有基督教物品，他辯稱是賭博贏來的，但沒有人信他，他被帶走，跟著再沒有他的消息。多年後，羅德里奎茲去世，他被放在一個大圓形的木製棺材裡進行火化，手裡拿著剛來日本時候，耶穌會給他的粗糙小十字架。
羅德里奎茲在傳教與尋訪過程中，信仰與反叛、聖潔與背德、強權與卑微、受難與恐懼、堅貞與隱忍、掙扎與超脫...等，所有兩難情境他都遇上過，逼迫他對基督信仰進行更深層與現實的思考。最終，羅德里奎茲走過恩師費雷拉的心路歷程，擁有自己對信仰的詮釋與實踐。
史高西斯導演花了26年，經歷無數困難，仍堅持完成《沉默》這部電影，可見他對宗教信仰的執著。宗教信仰，是否人心靈的歸屬，電影最終沒有明說，但透過故事主人翁的思想爭扎，相信觀眾自有體會，究竟史高西斯導演想帶出甚麼訊息。
