扣繳申報，是一種通知的責任，原則上，只要是有統一編號的組織，給付境內稅務居民且達到一定門檻以上，都有協助稅務單位：預扣稅金、次月十日完成繳納，並在隔年一月完成申報的責任；若沒有達到起扣門檻，雖然不用做『扣』、『繳』兩道程序，但仍有申報的義務，因此，扣繳申報，可說是『扣』、『繳』與『申報』三個動作的總稱；假若，給付境內所得給境外稅務居民的話，則沒有門檻，且要在給付之日起，十天之內，完成『扣』、『繳』與『申報』三個動作。
同時，透過扣繳申報的資訊，勞健保局也會同步勾核，給付單位對其員工的社會福利保險(就保、災保、勞保、勞退金提繳、全民健保)的納保級距是否合規；若扣繳申報的給付金額高，但是勞健保的納保級距低，其原因為何？業者通常都會回覆『因為有給獎金』，但這樣的回覆，會有以下兩個應留意的變數：
一、給付報酬是否符合獎金的定義
所謂獎金，乃指具獎勵性質但無關勞動力對價的恩惠給付，如：三節、紅利...等；若為業績獎金、績效獎金，實為應納入就保、災保、勞保、勞退金提繳、全民健保納保級距的平均工資。
二、給付報酬是否有代扣二代健保的義務
若確實為高額獎金、兼職所得、股利收入、利息收入、執行業務收入、租金收入的扣繳申報資訊，雖然，無關乎就保、災保、勞保、勞退金提繳、全民健保，但若未善盡二代健保扣費義務的話，給付企業仍會產生相關罰則。
是故，我國目前的扣繳申報資訊，與勞健保的納保資訊，已高度密合在一起，給付單位除應留意扣繳申報義務之外，也要留意勞健保的納保是否符合法規的規範。
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