【Journal Club 筆記】就。很。酷。虛擬成年斑馬魚腦袋一探究竟

你不可不知，數位虛擬大腦的重要性。

不過，最近來自加拿大的肯尼將為此開創一個新的紀元。

熱騰騰的研究成果，尚未正式發表於學術期刊

怎麼建立3D大腦圖譜呢？讓我們一步一步來。

1. 獲取樣本：
   首先，當然要先取得大腦。新鮮的大腦需經藥劑固定，才能從鬆散豆花狀，變成有固定樣貌的果凍狀，接著使用一個稱為iDISCO+的組織透化方法， 簡單來說，就是把大腦裡的脂肪移除，讓它變透明，因為腦組織跟脂肪的折射率不同正是不透明的主要原因。另外，視後續實驗需求，在中間會添加不同的抗體標記目標物質或細胞（相當於染色劑）。
2. 取得影像：
   變透明後，接著就要拍照建立數位影像，這篇研究用的顯微鏡是Light-sheet Microscopy，有來自側邊的雷射光源，並以正對著樣本的物鏡依固定距離，由上往下在不同深度拍一張照，如此即可取得3維空間的影像資料。
3. 建構立體模型：
   這個步驟主要目的在於連接單一個大腦照片裡的資訊，建構各自的立體大腦。
4. 建立標準模型：
   每隻魚的腦雖然長得大同小異，不過還是有些微差距，因此經由電腦計算，把每個大腦對準到相同位置，並消除掉雜訊，針對不可避免的形變進行校正，最後會得到一個所有大腦平均後的標準模型。
5. 劃清大腦分區：
   最後一個步驟要將大腦裡的行政區劃分清楚，因為不同腦區有不同功能，也有不同的神經類型跟細胞組成，經由在第一步使用的不同免疫染色標記，依照訊號強弱就可知道哪個位置該種細胞或物質特別多，依此大腦進行劃分處理。

推陳出新的學術生態圈，站在新研究之上看向更遠的未來

最後，
AZBA已經在網路上囉！大家可以去玩玩看。

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