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1952年7月23日自由軍官組織發動政變後，法魯克國王退位。1953年6月18日，埃及正式廢除君主制，宣佈成立共和國，由穆罕默德·納吉布（Muhammad Naguib）擔任首任總統兼總理。行政體系從君主立憲轉向共和制，但中央集權結構與尼羅河管理的基本框架繼續維持。土地改革於1952年9月開始實施，將大地主土地重新分配給農民，村社與灌溉系統仍由國家統一管理。
1954年，納吉布與賈邁勒·阿卜杜勒·納賽爾（Gamal Abdel Nasser）之間權力鬥爭結束，納賽爾成為實際領導人。1956年6月，納賽爾當選總統。同年7月26日，他宣佈將蘇伊士運河收歸國有，引發蘇伊士運河危機。英國、法國與以色列聯合進攻埃及，後在國際壓力下撤軍。
危機後，埃及行政更加中央集權，納賽爾推行阿拉伯社會主義政策，擴大國有化範圍。阿斯旺高壩於1950年代開始興建（1960年正式動工，1970年完工），由蘇聯提供技術與資金支持，大壩徹底改變尼羅河灌溉模式，實現全年灌溉，棉花與糧食產量大幅增加，但也影響下游生態。
1967年6月，第三次中東戰爭（六日戰爭）爆發，以色列佔領西奈半島、加薩地帶、約旦河西岸與戈蘭高地。埃及軍隊遭受重大損失，納賽爾一度提出辭職但在民眾壓力下留任。戰後，埃及進入「消耗戰」（War of Attrition，1967–1970年），與以色列在蘇伊士運河沿線持續衝突。行政與經濟管理繼續以中央計劃為主，尼羅河水資源由國家統一調配。
1970年代，阿斯旺高壩建成後，聯合國教科文組織（UNESCO）與埃及政府合作展開努比亞遺址拯救行動，將阿布辛貝神廟等重要古蹟整體搬遷至安全地點，這是埃及現代文化遺產保護的早期大型國際合作案例。
此後，埃及將古蹟保護納入國家發展計劃，成立最高文物委員會（Supreme Council of Antiquities，後改組為文物與旅遊部下屬機構）負責統籌全國古蹟、博物館與考古工作。
1970年9月28日，納賽爾因心臟病去世，副總統安瓦爾·薩達特（Anwar Sadat）繼任總統。薩達特調整政策，1971年頒布永久憲法，改國名為阿拉伯埃及共和國。1972年，他驅逐蘇聯軍事顧問，轉向西方。
1973年10月，第四次中東戰爭（贖罪日戰爭）爆發，埃及軍隊成功渡過蘇伊士運河，打破1967年以來的僵局。戰後，薩達特推行「開放政策」（Infitah），放鬆經濟管制，鼓勵私人投資與外資。1977年，他訪問耶路撒冷，開啟與以色列和平談判。
1979年3月26日，埃及與以色列簽訂《埃以和平條約》，以色列同意逐步撤出西奈半島。埃及因此被阿拉伯聯盟開除，總部遷至突尼斯。國內伊斯蘭主義團體反對和平條約，1981年10月6日，薩達特在閱兵式上被伊斯蘭極端分子刺殺身亡。
副總統穆罕默德·胡斯尼·穆巴拉克（Hosni Mubarak）立即繼任總統，並宣佈全國進入緊急狀態（此狀態持續至2011年）。穆巴拉克執政時期（1981–2011年，但本部分止於2000年），行政體系維持強中央集權，總統掌握主要權力，執政黨民族民主黨控制議會。
經濟上，他繼續開放政策，推動私有化與國際援助，但失業與貧富差距問題持續存在。尼羅河水資源管理仍由國家控制，阿斯旺高壩的運作與灌溉網絡得到維護，農業生產穩定。蘇伊士運河收入成為重要外匯來源。
1980年代至1990年代，埃及參與海灣戰爭（1991年），支持多國部隊對伊拉克的行動，換取經濟援助與債務減免。國內伊斯蘭極端組織活動增加，1990年代發生多起針對遊客與政府的攻擊事件，但政府維持嚴格安全控制。行政與官僚體系延續共和時代以來的結構，地方省長由中央任命，村社與稅收管理保持連續性。
1980年代至1990年代，埃及政府與國際組織合作，對帝王谷、吉薩金字塔群、盧克索神廟群與卡納克神廟進行修復與保護。1990年代，UNESCO將這些遺址列入世界遺產名錄，埃及政府制定專門法規，禁止未經許可的挖掘與文物出口，並設立專責單位處理盜墓與走私問題。
到2000年，穆巴拉克已執政近20年，埃及仍為共和制國家，尼羅河作為生命線的角色未變，行政管理從拜占庭晚期延續下來的灌溉、稅收與中央集權傳統，經過阿拉伯征服、奧圖曼統治、穆罕默德·阿里現代化、英國占領與共和時代的多次轉型，仍保持明顯的連續性。
2000年代，穆巴拉克政府時期，文化遺產保護經費增加，重點修復開羅伊斯蘭老城（Islamic Cairo）與科普特開羅地區。政府與外國考古團合作，在全國展開系統考古發掘，同時加強博物館管理。2002年，大埃及博物館（Grand Egyptian Museum）項目啟動，計劃將吉薩金字塔附近的收藏集中展示。
