在日本已故動畫導演今敏的作品當中，《東京教父》可謂異類 — — 沒有虛實交錯的世界觀、華麗花俏的畫風、跳躍的剪接或敘事模式，簡單一直線地講述一個發生平安夜的故事。觀眾只是跟著三位露宿者，一起在東京穿梭來回，尋找棄嬰的家庭，同時解開自己的「家庭」心結。
只是仔細品味，「虛實交錯」還是有的，只是存在於「家庭關係」裡頭：明明毫無血緣關係，卻因為聚在一起變成了「家人」；明明只是一念之仁，想為棄嬰尋回家人，卻在過程中重新面對自己拋棄／被拋棄「家庭」的理由，甚至意外與真正的家人修復關係，兩種關係的交錯貫穿整部電影。
虛幻的家庭構成
據說原型來自1948年美國西部電影《荒漠義俠（3 Godfathers）》的《東京教父》，三位護送嬰孩的「教父」卻非全是年齡相若的男性，而是有男有女，剛好能對應一個家庭 — — 「爸爸」是爛賭大叔阿仁，「媽媽」是跨性別的「變裝皇后」小花，「女兒」是離家出走的美由紀。三人輾轉流落在新宿，更意外在垃圾堆撿到一名女嬰（阿花擅自為她改名為清子），組成了一個有「父」「母」及「孩子」的露宿者家庭，以傳統的角度來看，家庭構造相當完整。雖然他們沒有血緣關係，平時相處粗魯直接，經常吵鬧鬥嘴、互相嫌棄，對意外撿到的清子亦各有意見…但身體始終很誠實，就算爭論的時候說話再難聽，大家總是像約定般一起行動；甚至有人身陷險境的時候，其餘兩位會立即拯救對方，三人亦把這份心思放在棄嬰身上，為她改名、尋找親人、帶她看醫生…
這種「愛」的表現，也許比依靠血緣的關係更為親密強烈，畢竟就如小花所言：「當彼此坦承相對，還能愛對方，才是真正的親情吧。」縱使他們四處露宿，沒有實體的「家庭」，但在乎對方的心情，已經確立了家庭的牽絆。
實際的血緣牽絆
對照虛構但緊密的「現在式」家庭關係，「過去」有血緣的家庭關係更堪玩味。就如上文提到，三名皆是拋棄／被拋棄自身的家庭才成為露宿者，然而於尋找棄嬰尋的家人過程當中，除除揭開他們與原生家庭糾纏不清的關係。
阿仁自稱競輪選手，其實是個爛賭大叔，因為欠下巨債而拋妻棄女，到處流氓避債，並深信她們只會痛恨自己不負責任…結果在帶棄嬰清子看醫生的時候，重遇親生女兒（一樣叫清子），並得知她與太太沒有記恨，多年來只等待他回家！另一方面，小花身為變裝皇后，因為「男友」死後失去生存目標及動力，而變成露宿者，她心底裡渴望擁有幸福家庭，對為棄嬰尋找家人一事亦最為積極。
至於年紀最小的美由紀，原本胖胖的她脾氣剛烈，誤會爸爸把寵物貓丟掉，爭執時意外刺傷了他，為迴避過錯而離家出走，自稱沒有任何家人，外面的風霜更令她變瘦，與以前判若兩人！當美由紀一直跟著阿仁及阿花的腳步尋找棄嬰，同時令她慢慢願意面對過去，原諒跟自己有爭執的爸爸，接受任性與家人斷絕聯絡的自己。
說實話，《東京教父》（香港國際電影節曾譯：東京契爺）片名未必完全貼切，因為主導故事的，是看似是棄嬰的清子為三人帶來一連串奇蹟，雖然過於公整及老梗的笑位，觀眾總覺得是否太過戲劇上的 巧合了？只是不能否認，隨著這名「奇蹟嬰兒」的出現，令三位露宿者審視眼前的「虛構」家庭關係，亦讓他們重拾一度失聯、被割裂的「真實」家人。如此看來，《東京教父》仍然繼承了今敏作品「虛實交錯」的傳統，跟《藍色恐懼》、《千年女優》及《盜夢偵探》微妙地連接起來，電影果然還是流著今敏的血脈。
