每年五月，當診所申報年度執行業務所得之時，無論是以部頒費用率申報，或以帳載核實數申報，只要診所存在合夥投資狀況的話，都須同時申報合夥人的個人資訊、合夥比例...等資訊；並將診所的執行業務所得，依合夥比例分配給各個合夥人；各合夥人再將所分得的執行業務所得，併入個人綜合所得額中，連同其他所得來源，一併申報綜所稅。
而當診所申報執行業務所得時，若申報年度有合夥狀態改變，如：獨資變合夥、合夥人數與比例增減...等，都須在申報時，一併將合夥合約檢附給稅務機關，以供查核。而診所的合夥合約中，至少需具備以下幾個要件，包含：
1.合夥人的個人資訊，包含：姓名、身分證字號、執業證照號碼、聯繫方式
2.合夥人的出資資訊，包含：出資比例、出資方式
3.合夥人的共同約定，包含：診所名稱、薪資、權利義務、代表人
4.合夥人的進退約定，包含：退出合夥、轉讓出資比例、增加合夥
5.其他
然而，實務上，假若診所並未有合夥事實，卻在申報執行業務所得時，以虛假的合約，分散實際受益人的所得的話，這絕對是違法的行為。常見的查核方式，包含：
一、確認合夥出資的真實性：是否能提供出資金流或出資財產的證明
二、確認盈餘配發的真實性：是否能提供依合夥比例分配的金流證明
三、確認合夥事實的真實性：合夥合約內是否有不均的權利義務關係
四、其他，如：實際受益人的登記資產，是否與其申報所得失衡...等
是故，若僅以書面合約載明合夥比例，藉此分散執行業務所得，但實際上的獲益，卻都回流給實際受益人，除了是嚴重違法的漏稅行為之外，也無法應對實質的稽徵查核。
參考資料：
翰鼎顧問股份有限公司
