故事起於阿和找了朋友菜頭幫他出氣，而意外砍傷他人。法庭上，沉默的父親不願為兒子多說點好話，最終阿和被關進少年輔育院。故事至此揭開序幕，木訥的父親、優秀的哥哥、叛逆的小兒子、堅韌的母親，勾勒出台灣最常見的家庭狀況。
父親:沉默不均的愛
在台灣大多數的家庭，父親們總吝於說出「愛」，也許連他們也羞於承認愛自己的孩子，如同這部電影裡的父親說:「別人問我有幾個孩子，我都只說一個，因為我從來沒有承認過阿和。」話雖是這麼說，但父愛早就在他的行動中溢於言表，為了不讓阿和再被菜頭欺負，他私下給他二十萬，希望阿和不再被欺負。而當他再次發現菜頭又找阿和做事時，他選擇幫阿和永除後患。
這個父親的角色宛如家中的父親，他們努力賺錢撐起這個家，卻忘記怎麼對家人說「我愛你」。每天滿嘴嫌棄的他們，實際上早已為孩子付出大半的人生，或許是傳統制約導致他們無法輕易用言語表達愛，但他們會在行動中向你傳達。也許是晚歸時為你留的一盞燈；也許是當你需要時能隨時載你回家的摩托車；也許是當錢不夠時默默塞給你的動作。
阿豪:無處可躲的炙熱
「這個世界，最公平的是太陽，不論緯度高低，白天與黑夜各佔一半。媽媽、弟弟、動物園的動物，還有司馬光，都有一些陰暗的角落可以躲，可是我沒有。我沒有水缸，沒有暗處，只有陽光，24小時從不間斷，明亮溫暖，陽光普照。」
對哥哥而言，他的人生目標就是實現這個家的夢想出人頭地，儘管明面上父母並未親口說希望他考上醫學系，但他心裡知道，他必須要做到。如果這世上每個人都需要陰影來自癒，那他就是因為沒有陰影而感到熾熱所以選擇離開。他把自己的好留給世人，卻忘記留一點溫暖給自己。
阿和:無處可躲的陰影
由於哥哥的優秀，阿和想用「叛逆」吸引父母的注意，可惜得這麼做只是讓大家失望，讓這個家的希望重擔落在哥哥身上。在哥哥的襯托下，阿和顯得弱小又無助，他是活在陰影下沒錯，但他卻是活在哥哥的陰影裡，甚至是連父親也不願承認有他這個兒子。阿和活在一個沒有人願意肯定他的世界中，所以他以「叛逆」之名掩蓋心中受傷的事實。
陽光普照?
故事的主旨圍繞在父親與兒子之間的故事。同時導演也用烏雲的流動說明:「烏雲擋住陽光，世界不再陽光普照，但是烏雲也會離開，最終將再次陽光普照。」這好像是導演想告訴我們的，一切悲痛終將過去，讓我們家悲傷留在昨天。但是事實卻告訴我們，一個悲傷過去了，好事確實也會來，但隨之而來的也有下一次悲傷，人生就是在悲傷、迎接快樂、快樂、迎接悲傷中度過。陽光難道真的普照嗎?如果陽光真的公平，在名為父愛的陽光底下，為何一個承受極度熾熱，一個承受極度陰冷。在最後的最後，阿和的父親將罩在兒子頭頂上的那烏雲趕走，感到自己的頭上。所以，烏雲一直都在。
