科因指的宗教，有幾個特徵。一、有神論（theism）。有神論的神不但創造萬物，也干涉世事。比方基督教說上帝會聽信徒祈禱，會審判世人，加以賞罰等等。二、道德標準。信徒要服從神所啟示的道德。三、信徒跟神直接相交的個人關係。簡單說，他指的宗教，就像猶太教、基督教、伊蘭蘭教。
3.1 宗教信仰以事實為依據
宗教說法往往是經驗的假設、事實式陳述。所謂神創造天地，天地就是這個現實世界；佛教所謂轉世、基督教所謂道成肉身，是說成了活在世上、有血有肉的人。大洪水、挪亞方舟、以色列人出埃及等等就不必說了。信徒大多把神的存在、耶穌復活等等當成事實。換言之，宗教說法是對現實世界的描述。
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宗教顯然以現實世界的事實為根據，建立其信仰。有些人卻不同意，例如基督教神學家Spufford說：
宗教不是哲學論證，……也不是什麼代替科學的。其實宗教根本不是一套現實世界的命題。宗教什麼都不是，而是感受的結構、情感的建築。你不是因為贊同上帝存在這個命題而有那種情感，而是因為你先有了情感，才相信上帝存在的命題。
還有穆斯林神學家Aslan的說法：
不管神話表達的是什麼真理，都跟歷史事實沒什麼關係。摩西是不是真的分開紅海、耶穌是不是真的叫拉撒路復活、真主是不是真的由穆罕默德傳話，根本都是不相干的問題。宗教及其神話的相關問題只有一個：「這些故事有什麼意思？」
科因不同意這種宗教與事實無關的說法。因為就算信徒是先有宗教感情才相信神的存在等命題，仍然需要以這些事實命題的信仰，來引導情感，實踐成道德標準、生活模式、宗教行為等。如果《聖經》、《古蘭經》都只是一些有寓意的故事，就只是哲學，不成其宗教。比喻還是實寫的問題，下文分析地獄、始祖故事時再來討論。
許多神學家、學者也不同意宗教與事實無關。首先是保羅：
「既傳基督是從死裡復活了，怎麼在你們中間有人說沒有死人復活的事呢？若沒有死人復活的事，基督也就沒有復活了。若基督沒有復活，我們所傳的便是枉然，你們所信的也是枉然；」（林前15:12-14）
可見基督教是建基於耶穌復活這件事上。神學家Swinburne認為信仰要有事實根據：
惟有神存在，信奉基督宗教（或任何有神論宗教）才有意義──如果神不存在，那麼崇拜一個不存在的造物主、祈求祂在世上做些什麼、帶我們上天堂，是沒有意義的；如果神沒有意志，我們設法按祂的意志生活，也是沒有意義的。
Mikael Stenmark說得更明白：
所以宗教也包含（d）現實世界的信念。……根據基督教的信仰，……最少神要存在、耶穌是神的兒子、神按着祂的形象造人、神是造物主、神想要原諒人、神愛世人，這些都一定要是真的，救贖才可行。由此可見，基督教好像跟科學一樣，都有知識上的目的，就是設法闡明現實世界的真相。
John Polkinghorne也強調信仰的事實根據：
宗教跟科學一樣注重真理。然而，除非宗教的信念符合事實，否則就不能指引人生，勇於面對死亡；充其量只成了安慰人的幻想的錯覺練習。
Ian Barbour說：
宗教傳統其實是生活方式，而不是一套抽象觀念。但是生活方式是以對現實世界的性質的信念為前提，如果這些信念不再可信，生活方式就無法維持。
最後是Francis Collins和Karl Giberson的聯合聲明：
同樣，宗教的各方各面幾乎都不只是價值判斷和道德指引。宗教常常陳述「事物的實況」。
按：科因花了許多篇幅，特別強調「宗教信仰基於事實陳述」這一點，因為許多宗教說法被人指出不實時，信徒往往推說「不相干」、「那是比喻」、「那不重要」。奇怪的是，有些科學家也這樣認為，例如Stephen Jay Gould, Brian Greene等等；用格林的話說，對客觀實在的事實陳述「不是對的標準」。有些信徒可能就說：「看，科學家說的呢！」我奉勸信徒別見縫插針，先想清楚格林的話的言下之意。＃相容派科學家根本不了解宗教，也不了解信徒。以基督教為例，照他們的講法，就算《聖經》記載的「事實」都不是事實，也沒有關係，因為「不相干」、「那是比喻」、「那不重要」。換言之，就算神創造天地萬物、創造人是假的，亞當夏娃的故事是假的，原罪云云是假的，耶穌為世人贖罪釘十字架是假的，復活也是假的，天堂地獄假的，通通沒有關係，你照樣可以相信基督教，當基督徒。因為信仰的本質不在乎那些，而在乎人怎樣在內心尋求神，與神同在云云。其實不少學者、平信徒都這樣解釋過。＃請問你願意信這樣的基督教、當這樣的基督徒嗎？請問你願意不願意？＃如果願意，請問當這樣的基督徒，跟當穆斯林、媽祖信徒有什麼分別？許多穆斯林、媽祖信徒內心都真誠地感動，你跟他們有什麼分別？還是說，進入你內心、叫你感動的那個神其實是觀世音，你稱呼祂耶穌而已？還是說，這也無所謂，你在內心尋求祂，與祂同在就行了？＃如果不願意信這樣的基督教，那麼《聖經》的「事實」跟科學衝突，你為什麼不計較？如果你不知道有什麼衝突，因為教會都說沒有，你為什麼不自己像大陸人「翻牆」那樣翻出去看清楚？
