古早的通說認為，十字軍運動到了1291年，近東大陸上最後一座堡壘Acre被攻陷後，就逐漸退潮。但現在已經被證實是錯誤的說法。
事實是，在十四世紀的十字軍運動，一樣於歐洲各地如火如荼。只是，隨著收復聖地的機會越來越低，十字軍的目標也逐漸轉移，到了新生的鄂圖曼帝國身上。從十四到十六世紀的十字軍大潮，於是就成了「在東歐、巴爾幹抵禦鄂圖曼土耳其」為主的軍事遠征。這段時間組成的各類「神聖同盟」，也被看作是十字軍運動的一種變形。
在1444年，就有為了拯救拜占庭帝國、而號召的「瓦爾納十字軍」，範圍擴及十餘個歐洲國家，軍隊人數在兩萬人以上。而這只是後期十字軍之一而已。
可以說，十字軍直到十七世紀，才隨著「世俗國家」、「君權」等發展壓過教會，而逐漸退潮。到了啟蒙運動時代，才變成思想大豪嘲笑的對象。
但若考慮到當時十字軍的殘留，「馬爾他騎士團（醫院騎士團）」仍在馬爾他島上從事軍事活動，也可以說十字軍當時尚未結束。
因而，十字軍結束最晚的斷線，是「1798年」，法國大革命的時代，拿破崙把醫院騎士團趕出馬爾他島的時刻。
十字軍從1095年開始，到1798年結束，超過七百年的歷史，不得不說，是在全方位都對西方歷史影響極其深遠的一段故事。
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資料來源：
Thomas Asbridge, "The First Crusade: A New History"
Cristopher Tyerman, "The Crusades: A Brief Insight "
Jonanthan Riley-Smith ed., "The Oxford History of the Crusades"
