戰後的台灣本土派系被清算過一次，再加上蔣介石從中國敗退到台灣，帶來了原有的派系組織，使得質與量都產生了變化。這邊大致解釋一下，派系圍繞的無非就是「利益」，在台灣又要分為地方派系與非地方的中央派系。
台灣過去數十年的威權政治系統，是一種「扈從體系」。政治強人兩蔣使用這方法，建立一套有效統治社會的制度。在中央，各派系在兩蔣的安排下，進入各國家機關部門，由於各派系失去中國原有的地盤，使得在台灣必須完全仰賴蔣介石的恩庇。（註：Clientelism。）
而在地方，則讓各行各業、地方各階層組織團體，藉由地方組織掌握民眾。但團體本身該有的功能，受到中央機關的法令、武力等制約，無法正常運作。政治強人則與這些地方個團體派系的領導者，建立一套扈從關係，使地方領導者可以獲得「經濟租」，得到實際的利益，進而支持蔣的統治。兩蔣用以上的手段，分化與吸收各派系，建立單線的扈從關係，彼此無法串連。
在談論未來幾十年得派系發展前，要講先一下歷史，蔣介石在中國的時候，國民黨內的派系可分為以下幾個，分別掌握不同的勢力與利益，蔣介石其實並無絕對權力可以左右派系意見，與其說蔣介石是獨裁者，不如說是各大派系共同認可的領導者。（註：先了解過去才能理解現在。）
一、軍統系：
以戴笠為核心的特務機關，外圍組織包括力行社、復興社等，蔣介石可以在國民黨內佔有一席之地，情治系統居功厥偉。來台灣後，軍統改名為國防部保密局，在之後的情治系統改組中，保防任務交給調查局，經過一再改編後，成為今天的國防部軍事情報局。（註：軍特務組織。）
二、CC系：
也就是陳立夫、陳果夫組的中央俱樂部，他們為國民黨特務之首陳其美的姪子，與蔣介石關係匪淺。而俗稱中統的「中央執行委員會調查統計局」，成員多為CC系，派系勢力在中國權傾一時。來台後因CC系主導黨務，而大陸的失守CC系無法規避責任，因而失勢，陳立夫遠走美國。之後多次改組，中統改制為內政部調查局，也就是後來的法務部調查局。（註：CC系掌黨特務組織，但不代表CC系的勢力只有中統，派系之間的關係是很複雜的。）
三、孔宋集團：
在中國時掌管全國金融財政，以宋子文與孔祥熙為首，其事蹟讀者應該都很熟悉，可以說是為了家族財富將全中國財政搞垮的功臣。蔣介石敗退來台後，深知經濟問題實為失去中國的一大主因，而孔宋家族的責任最大，故孔宋被蔣屏除在國門外。孫立人等與孔宋集團關係不差的，後來都被除掉，最後僅有蔣宋美齡因其個人關係，掌握到國民黨婦工會，而在財政其他方面上完全失勢。（註：宋美齡當然不會被禁入國門，圍繞她身邊的就是後來的夫人派。）
四、政學系：
以翁文灝、朱家驊等行政、科技專才組成的派系，以輔佐蔣介石行政的勢力，陳儀算此系統的領袖之一。政學系在中國期間，掌握著鐵道、實業等工業部門，但蔣敗退到台灣後，政學系幾無舞台，只有少許幾人點綴。（註：原因很多，總之就是消散了。）
五、團派：
又稱三青團，全名為三民主義青年團，指以陳誠為首的黃埔校友會，是蔣介石組織黃埔勢力的忠實支持者。團派在來台後，由於屬於蔣的黃埔嫡系，被扶持來對抗CC系，勢力不次狀大。
這些舊派系來台後，因為失去了原有中國的地盤，所以在台灣積極的爭奪國家機關職缺，這些的勢力競逐，有合併有消失，面貌到了今天已經完全不同，但根源追溯下去，依照人脈關係是可以牽起來的。
這些中央派系，在兩蔣的政策與手腕下，並不能直接的與地方派系聯合，只能依靠政治強人賦予權力與掌握利益。但到蔣經國死後就開始鬆動，中央與地方派系的結合，加上選票最大，有錢就有選票的結果，形成了我們今天看到的地方政治樣貌。（註：這是很粗糙的講法，後面幾篇會慢慢談。）
