雖然植物是光合自營生物,但它們還是需要從外界獲取一些特定的礦物質,才能合成所有它需要的分子。這些特定的礦物質稱為「必需元素」(essential elements)。
當然,每個必需元素都很重要,不過,其中還是有些不僅需求量大又特別容易缺乏的元素,例如氮(N)與磷(P)。因為土壤是帶負電的顆粒,而氮與磷又是以帶負電的形式硝酸根(NO3-與PO42-)存在,造成土壤不容易留住它們,所以就常常會不夠。
尤其是氮,不論是胺基酸、核酸、碳水化合物、脂肪都需要它。因此,植物對它的需求量很大,所以缺氮就會產生各種症狀:從老葉開始葉片逐漸變黃、提早開花、莖出現木質化的現象、老葉提前枯黃掉落等等。讓人想到艾青的《飢餓》:「我見過飢餓的孩子 眼神像秋天的草 枯黃而且空虛」。
當然,我們知道在缺氮的時候,植物會讓成熟的葉片提前衰老,好分解裡面的養分輸送給新生的組織,這是一種植物為了求生所產生的反應。畢竟,不能往上長就意味著陽光可能會被其他植物奪走,而那就意味著死亡。但是,究竟缺氮與衰老之間是怎麼連結起來的?
過去的研究已經發現,植物在缺氮的時候,會啟動一些轉錄因子來增加衰老基因的轉錄。如果植物少了這些基因,就算缺氮葉片也不會那麼快衰老變黃。
那麼,既然它們是轉錄因子,到底它們啟動了什麼基因呢?為了要找到關鍵的基因,研究團隊挑選了52個阿拉伯芥的自然變異株,分析這些植物的基因表現,想要找到與那些轉錄因子們一榮俱榮,一損俱損的基因。
結果他們找到了一個基因,這個基因不僅與那些轉錄因子同聲同氣,在它發生突變時,還會影響植物餓肚子(缺氮)時的症狀表現。他們發現,在52個自然變異的阿拉伯芥中,有6株在餓肚子的時候葉片衰老的速度比其他的要快得多,而這六株植物都在同一個基因裡發生同一個突變。
它是什麼基因呢?研究團隊發現,其實這個基因在2003年已經被另一組人發現且命名了。當時因為少了這個基因會讓植物提早進入下一個生長發育的階段,所以他們就把這個基因命名為HASTY(急)。
因為上面那六個自然變異株的「急」都在第1006個胺基酸發生突變,而且它們在餓肚子時都老得特別快,所以研究團隊認為「急」是氮飢餓衰老現象的負向調控因子。
過去的研究發現「急」跟小RNA(miRNA)的形成有關。所以,研究團隊分析了野生種與缺少「急」的植物在正常生長狀況與餓肚子狀況下的基因表現。結果發現,有160個小RNA與「急」相關,其中有84個在正常狀況下的突變株表現量減少,另外有79個在餓肚子狀況下的突變株表現量減少。
進一步的分析把範圍縮小到六個小RNA。其中一個,miR781,會負向調控植物氮飢餓的衰老現象。他們發現,miR781在少了「急」的植物中表現量減少,而當「急」高量表現時,它的表現量也跟著上升。另外,他們還發現miR781會跟其中一個啟動衰老機制的轉錄因子大BOSS結合。
另外他們發現「急」會跟許多個小RNA結合,也包括miR781;但是當「急」發生突變時,這個結合就減弱了。過去的研究發現,「急」還會跟另外兩個蛋白質互動。
到底「急」的角色是什麼呢?進一步的研究發現,這三個蛋白質會形成複合體(三劍客!),而這個「三劍客」複合體負責產生成熟的小RNA,然後這些小RNA會去負向調節植物缺氮時的衰老現象的發生。
而「急」的主要功能是做為輔助因子,幫忙進行小RNA的加工。當「急」發生突變時,「三劍客」複合體就變得不穩定,造成小RNA的產出下降,於是植物衰老的速度就變快了。
所以,從52株阿拉伯芥中找尋與三個大BOSS同聲氣的基因,研究團隊找到了「急」,然後接著發現「急」會抑制植物肚子餓時的衰老現象,而這是透過調節小RNA的產出來達成的,生物真的是精巧到讓人覺得不可思議啊!
參考文獻:
Sakuraba, Y., Yang, M., & Yanagisawa, S. (2024). HASTY-mediated miRNA dynamics modulate nitrogen starvation-induced leaf senescence in Arabidopsis. Nature Communications, 15(1), Article 7913. https://doi.org/10.1038/s41467-024-52339-w