隨著東羅馬殘餘，尼西亞帝國日益壯大，很古怪的是，他們卻極少遇到大規模的十字軍遠征，前來對抗這些「希臘異端」的復興勢力。
其中一個原因，來自於當時的神聖羅馬帝國皇帝，乃是西西里教育出來的霍亨史陶芬王朝「腓特烈二世」。
這位老哥以中世紀而言，還真是個怪人：喜好知識、充滿實驗精神、不排斥與異教徒來往，追求世俗國家利益、並且極度反對教會介入帝國事務。於是，腓特烈二世成為了教廷的死敵，最後在1245年被處以絕罰令 （Excommunication），開除教籍。
俗話說，敵人的敵人就是朋友，所以，當腓特烈二世往東方看去，尼西亞的約翰三世．瓦塔澤斯往西方看去，「我倆惺惺相惜，情不自禁」，一拍即合，締結了長年的國交。腓特烈二世還成了約翰三世．瓦塔澤斯的岳父。
一反過往神羅與東羅的交往模式，「兩位羅馬皇帝」不只幾乎沒什麼衝突，國交還十分融洽。
腓特烈喜歡東羅馬那種皇帝可以壓制教會的風格，還寫信替東羅馬叫屈，說教廷竟敢「汙辱最正統的羅馬人（希臘人）為異端」，實在大逆不道。
另一方面，雖然遠在西邊，但神聖羅馬帝國在義大利有事時，尼西亞還會派兵支援，算是相當義氣的盟友了。
雖然在交往之中，尼西亞礙於國力和威望，都處於比較低的地位，但腓特烈二世的存在對他們來說是非常有用的：因為有這位「教會之敵」當標靶，教廷的十字軍號召力不只分散，還不得不把精力投到這個西西里老哥身上。尼西亞？那就沒空管了。
只能說：謝謝你！腓特烈老哥！
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圖片一： 腓特烈二世時代的神羅範圍
圖片二：尼西亞帝國與拉丁帝國，約翰三世去世不久後的1255年。
圖片來源：
Wiki Commons, "Mitteleuropa zur Zeit der Staufer.svg"
尼西亞地圖由Ian Mladjov繪。
A. Gardner, "The Lascarids of Nicaea", Adolf M. Hakkert, 1964, pp.159-179.
