茶樹的族群研究
茶是全世界最多人飲用的飲料了。若從中國的唐朝算起，這個世界喝茶的歷史也有將近1500年。在這麼多年間，透過育種，茶樹也已經有非常多不同的品系。當然，也有特別受歡迎的品系。如台灣種得比較多的，大概就是青心烏龍、金萱、紅玉等品系，而在中國，則有「龍井43」。龍井43具有高抗寒、廣泛的種植適應性、早發芽、口感好、香氣十足等優點。
有鑑於此，研究團隊對「龍井43」進行了高品質定序。他們發現「龍井43」的基因體約為3.26Gb，有33,556個基因。基因體中約80.06%為重複序列，主要是LTR。
另外，分析也發現與疾病抗性、次級代謝與生長發育相關的基因都有擴張的現象。例如，UDP-葡萄糖苷基轉移酶（與兒茶素含量相關）和（-）-香葉烯D合酶（與萜烯代謝相關）等基因家族都有擴張。研究團隊也識別出74個可能經歷了正選擇的基因，涉及疾病抗性、耐寒性和高光照耐受性等。
接著，研究團隊使用「龍井43」做為參考基因組，對從全球收集來的139個茶樹樣本進行重測序分析。這139株茶樹有93個來自於中國，另外46個分別來自印度、斯里蘭卡、日本、台灣、非洲、南美洲、東南亞。另外，研究團隊還使用了山茶花（Camellia sasanqua Thunb.）作為外群。
他們發現，這139株茶樹可分為三群，分別是近緣種（CSR）、中國種（CSS）與阿薩姆種（CSA）這三群。其中近緣種與外群（山茶花）最近，另外這一群的雜合度顯著高於另外兩群，也意味著它們是更古老的群體。再者，近緣種主要分布在中國雲南等地區，而這些地區也被認為是茶樹的原產地與多樣性中心。因此，研究團隊認為，近緣種應該是中國種與阿薩姆種的祖先。
進一步的分析發現，中國種裡面與萜烯代謝以及抗寒相關基因，都受到了較強的選擇。由於茶樹在中國多種植在東部與北部較寒冷地區，用來生產綠茶與烏龍茶，這些基因受到選擇壓力，也相當合理。
透過這些研究，研究團隊讓我們對茶樹的遺傳特性、演化歷史都有了進一步的了解，也能更加深入地了解茶樹的生物學特性。
所以，野生茶樹被歸類為近緣種，與中國種及阿薩姆種都不同！這是否也能解釋，為何古茶樹做的茶，喝起來這麼不一樣的原因呢？
參考文獻：
Wang, X., Feng, H., Chang, Y., Ma, C., Wang, L., Hao, X., Li, A., Cheng, H., Wang, L., Cui, P., Jin, J., Wang, X., Wei, K., Ai, C., Zhao, S., Wu, Z., Li, Y., Liu, B., Wang, G.-D., ... Yang, Y. (2020). Population sequencing enhances understanding of tea plant evolution. Nature Communications, 11(1), 4447. https://doi.org/10.1038/s41467-020-18228-8
